Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Repeats of Cucurbita pepo mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_014050(ACCA)3p41937194812Design Primer
2NC_014050(AACA)3p44835484612Design Primer
3NC_014050(TTGG)4p46122613716Design Primer
4NC_014050(AAAC)3p47167717812Design Primer
5NC_014050(AAAG)3p48191820212Design Primer
6NC_014050(AAAG)3p4105641057512Design Primer
7NC_014050(TCTT)3p4121521216312Design Primer
8NC_014050(GAAC)3p4125551256612Design Primer
9NC_014050(GTCT)3p4136091362012Design Primer
10NC_014050(TTAC)3p4202352024612Design Primer
11NC_014050(ATAC)4p4224272244216Design Primer
12NC_014050(AAGA)3p4229492296012Design Primer
13NC_014050(GAAT)3p4241032411412Design Primer
14NC_014050(AATA)3p4264992651012Design Primer
15NC_014050(CTTT)3p4284182842912Design Primer
16NC_014050(TGTC)3p4295122952312Design Primer
17NC_014050(GTCT)5p4297162973520Design Primer
18NC_014050(AGGC)3p4339163392712Design Primer
19NC_014050(GCTT)3p4369773698812Design Primer
20NC_014050(TTCA)3p4398313984212Design Primer
21NC_014050(GCAA)3p4402154022612Design Primer
22NC_014050(TATC)3p4444524446312Design Primer
23NC_014050(TGAA)3p4467634677412Design Primer
24NC_014050(AGAA)5p4550275504620Design Primer
25NC_014050(CTTG)3p4569465695712Design Primer
26NC_014050(CTTC)3p4572835729412Design Primer
27NC_014050(TGCT)3p4594515946212Design Primer
28NC_014050(AAAG)3p4609326094312Design Primer
29NC_014050(CCTT)3p4654366544712Design Primer
30NC_014050(CTTT)3p4664586646912Design Primer
31NC_014050(TTTG)3p4687716878212Design Primer
32NC_014050(AGAA)3p4720547206512Design Primer
33NC_014050(CTTT)3p4772667727712Design Primer
34NC_014050(AAGA)5p4782667828520Design Primer
35NC_014050(TTCT)3p4785517856212Design Primer
36NC_014050(TCTT)3p4790767908712Design Primer
37NC_014050(CTTC)3p4883688837912Design Primer
38NC_014050(TTAG)3p4896718968212Design Primer
39NC_014050(CAAG)3p4953669537712Design Primer
40NC_014050(ATTC)3p4957259573612Design Primer
41NC_014050(AACC)4p410178510180016Design Primer
42NC_014050(GAAA)3p410281910283012Design Primer
43NC_014050(CTTT)3p410446710447812Design Primer
44NC_014050(ATTC)3p410874510875612Design Primer
45NC_014050(CTTT)3p411814711815812Design Primer
46NC_014050(TTTG)3p412709112710212Design Primer
47NC_014050(CCTG)3p412772812773912Design Primer
48NC_014050(GAAA)3p412816412817512Design Primer
49NC_014050(TTCT)3p413430213431312Design Primer
50NC_014050(CAGC)3p414451514452612Design Primer
51NC_014050(GAAG)3p414509514510612Design Primer
52NC_014050(GAAT)3p414864314865412Design Primer
53NC_014050(CTGT)3p414987014988112Design Primer
54NC_014050(CTTT)3p415523815524912Design Primer
55NC_014050(AAGA)3p417398917400012Design Primer
56NC_014050(GTTC)3p418035518036612Design Primer
57NC_014050(GCAA)3p418467618468712Design Primer
58NC_014050(GAAG)3p419097519098612Design Primer
59NC_014050(ACAG)3p419397619398712Design Primer
60NC_014050(AAAC)3p419594319595412Design Primer
61NC_014050(AAGA)3p420008120009212Design Primer
62NC_014050(TGAA)3p420734620735712Design Primer
63NC_014050(GAAA)3p420816220817312Design Primer
64NC_014050(AGTA)5p420963420965320Design Primer
65NC_014050(TTTC)3p421010521011612Design Primer
66NC_014050(TAAC)3p421159321160412Design Primer
67NC_014050(AAAG)3p421218121219212Design Primer
68NC_014050(TTAC)3p421230821231912Design Primer
69NC_014050(TAGC)3p421416421417512Design Primer
70NC_014050(TTAC)4p421444221445716Design Primer
71NC_014050(TTCC)3p421483821484912Design Primer
72NC_014050(TAGT)3p421497421498512Design Primer
73NC_014050(TCAT)3p421614021615112Design Primer
74NC_014050(TATG)3p421651421652512Design Primer
75NC_014050(TGAA)3p422143822144912Design Primer
76NC_014050(GTTT)4p422340722342216Design Primer
77NC_014050(ACCA)3p422488022489112Design Primer
78NC_014050(TTGG)3p422842822843912Design Primer
79NC_014050(GAAA)3p423085223086312Design Primer
80NC_014050(TGCT)3p423542923544012Design Primer
81NC_014050(ACCA)3p424092424093512Design Primer
82NC_014050(AACA)3p424142324143412Design Primer
83NC_014050(AATT)3p424700124701212Design Primer
84NC_014050(TTCT)3p424863624864712Design Primer
85NC_014050(TATT)3p424966624967712Design Primer
86NC_014050(CCGA)3p425992125993212Design Primer
87NC_014050(AGCA)3p426093626094712Design Primer
88NC_014050(TTAA)3p426598926600012Design Primer
89NC_014050(AAGA)3p427069127070212Design Primer
90NC_014050(GAAA)4p427223827225316Design Primer
91NC_014050(TTTC)3p427969027970112Design Primer
92NC_014050(TCTT)4p428089628091116Design Primer
93NC_014050(GAAA)5p428756928758820Design Primer
94NC_014050(CTTG)3p428981028982112Design Primer
95NC_014050(ATCA)3p429106029107112Design Primer
96NC_014050(AAGA)3p429153029154112Design Primer
97NC_014050(CCAG)4p429236929238416Design Primer
98NC_014050(CAGT)3p429390429391512Design Primer
99NC_014050(GGAA)3p429423229424312Design Primer
100NC_014050(TCTT)4p429518129519616Design Primer
101NC_014050(CCTT)3p429822129823212Design Primer
102NC_014050(GATA)3p429942029943112Design Primer
103NC_014050(CTTT)4p429978329979816Design Primer
104NC_014050(TTCT)4p430363530365016Design Primer
105NC_014050(TCTA)3p430423330424412Design Primer
106NC_014050(AAGC)3p430569330570412Design Primer
107NC_014050(CCTT)3p430646230647312Design Primer
108NC_014050(GGAA)3p430820230821312Design Primer
109NC_014050(ATTC)3p430880030881112Design Primer
110NC_014050(TTCT)3p431219731220812Design Primer
111NC_014050(TTTC)3p431489531490612Design Primer
112NC_014050(TTAT)3p431726631727712Design Primer
113NC_014050(CTAT)3p431968431969512Design Primer
114NC_014050(CAAG)3p432590532591612Design Primer
115NC_014050(CTTT)3p433053433054512Design Primer
116NC_014050(TTCA)3p433962433963512Design Primer
117NC_014050(TGGT)3p434072834073912Design Primer
118NC_014050(TTCT)3p434106234107312Design Primer
119NC_014050(AACG)3p434614234615312Design Primer
120NC_014050(AGCT)3p434756834757912Design Primer
121NC_014050(CTCA)3p434901634902712Design Primer
122NC_014050(TTCT)3p434985634986712Design Primer
123NC_014050(TGGT)4p435030435031916Design Primer
124NC_014050(TCTT)3p435195635196712Design Primer
125NC_014050(AACC)3p435341835342912Design Primer
126NC_014050(GTAG)3p435362435363512Design Primer
127NC_014050(TATT)3p435419935421012Design Primer
128NC_014050(GTCT)3p437136637137712Design Primer
129NC_014050(AACT)5p437564937566820Design Primer
130NC_014050(TGTA)3p437582037583112Design Primer
131NC_014050(ATTC)3p437679637680712Design Primer
132NC_014050(AATC)3p437771837772912Design Primer
133NC_014050(CTAT)3p437900737901812Design Primer
134NC_014050(TTCT)3p437921937923012Design Primer
135NC_014050(CTCA)3p438077538078612Design Primer
136NC_014050(GTTC)4p438388938390416Design Primer
137NC_014050(AACT)3p438574138575212Design Primer
138NC_014050(TCTT)3p438672238673312Design Primer
139NC_014050(ATTC)4p438734738736216Design Primer
140NC_014050(TAGC)3p438773138774212Design Primer
141NC_014050(CTTG)3p438874538875612Design Primer
142NC_014050(AGAA)3p438913938915012Design Primer
143NC_014050(GAAG)3p438938738939812Design Primer
144NC_014050(CGGC)3p439116239117312Design Primer
145NC_014050(TTCT)3p439614239615312Design Primer
146NC_014050(AATA)4p440038440039916Design Primer
147NC_014050(TTTC)3p440354840355912Design Primer
148NC_014050(TTCT)3p440525040526112Design Primer
149NC_014050(TTTA)3p440612840613912Design Primer
150NC_014050(GGCT)3p440647640648712Design Primer
151NC_014050(CCTG)4p440725740727216Design Primer
152NC_014050(CTTT)3p440829940831012Design Primer
153NC_014050(GAAA)3p440871340872412Design Primer
154NC_014050(GAAC)3p440979640980712Design Primer
155NC_014050(TTTC)3p441046441047512Design Primer
156NC_014050(AAAG)3p441701341702412Design Primer
157NC_014050(GAAT)3p442031742032812Design Primer
158NC_014050(GAAT)4p442123642125116Design Primer
159NC_014050(CTTT)3p442310942312012Design Primer
160NC_014050(TCTT)3p442363642364712Design Primer
161NC_014050(ATTA)3p442389842390912Design Primer
162NC_014050(ATTG)3p442563242564312Design Primer
163NC_014050(GGAG)3p442612542613612Design Primer
164NC_014050(TAGC)3p442801442802512Design Primer
165NC_014050(AGTA)3p443526143527212Design Primer
166NC_014050(CTTA)3p444045144046212Design Primer
167NC_014050(AAAG)3p444274044275112Design Primer
168NC_014050(CAAG)3p444415144416212Design Primer
169NC_014050(GAGT)3p445640645641712Design Primer
170NC_014050(GAAC)3p445751045752112Design Primer
171NC_014050(CCAG)3p446061346062412Design Primer
172NC_014050(TTTC)3p446097146098212Design Primer
173NC_014050(AGCA)3p446245846246912Design Primer
174NC_014050(TAAT)3p446268146269212Design Primer
175NC_014050(ACAA)3p446376546377612Design Primer
176NC_014050(AGAA)3p446411946413012Design Primer
177NC_014050(TTGG)3p447102447103512Design Primer
178NC_014050(ACCA)3p447297347298412Design Primer
179NC_014050(AGAA)4p447635347636816Design Primer
180NC_014050(GGAA)3p447727847728912Design Primer
181NC_014050(TTCT)3p448239048240112Design Primer
182NC_014050(AGGA)3p448376948378012Design Primer
183NC_014050(CTTT)4p448817648819116Design Primer
184NC_014050(TTCT)3p448845948847012Design Primer
185NC_014050(TTTC)3p448858048859112Design Primer
186NC_014050(TTGG)3p448909548910612Design Primer
187NC_014050(CTTA)3p448963648964712Design Primer
188NC_014050(TCTT)3p449026449027512Design Primer
189NC_014050(AAAG)4p449263149264616Design Primer
190NC_014050(TTTC)3p449424749425812Design Primer
191NC_014050(CTCC)3p449571049572112Design Primer
192NC_014050(TCTT)4p449692949694416Design Primer
193NC_014050(GACT)3p449896349897412Design Primer
194NC_014050(AAAG)3p450753050754112Design Primer
195NC_014050(GAAA)3p451166451167512Design Primer
196NC_014050(ATTC)6p451347051349324Design Primer
197NC_014050(TCAT)3p451697951699012Design Primer
198NC_014050(AAGG)3p452027752028812Design Primer
199NC_014050(AGAA)4p452584652586116Design Primer
200NC_014050(CAAG)3p453052353053412Design Primer
201NC_014050(TATT)4p453199053200516Design Primer
202NC_014050(TTAC)5p453252553254420Design Primer
203NC_014050(CTGT)3p453307353308412Design Primer
204NC_014050(AACT)3p453384253385312Design Primer
205NC_014050(AGCT)3p453468253469312Design Primer
206NC_014050(CCTT)3p453485453486512Design Primer
207NC_014050(AAGG)3p453533853534912Design Primer
208NC_014050(AAGA)3p453679053680112Design Primer
209NC_014050(TTGT)3p453722853723912Design Primer
210NC_014050(TATC)4p453744553746016Design Primer
211NC_014050(AAGA)3p453846553847612Design Primer
212NC_014050(TATT)3p453885853886912Design Primer
213NC_014050(AAGA)3p453954553955612Design Primer
214NC_014050(AAAG)3p454034854035912Design Primer
215NC_014050(GATA)5p454077354079220Design Primer
216NC_014050(AGTA)4p454213754215216Design Primer
217NC_014050(CTTT)3p454225954227012Design Primer
218NC_014050(TCCT)4p454441954443416Design Primer
219NC_014050(CTTT)3p454741054742112Design Primer
220NC_014050(TTCT)3p454856054857112Design Primer
221NC_014050(CATA)3p455653255654312Design Primer
222NC_014050(AGAA)3p456122156123212Design Primer
223NC_014050(AATC)3p456196056197112Design Primer
224NC_014050(GAAA)3p456433256434312Design Primer
225NC_014050(AAGA)3p456452156453212Design Primer
226NC_014050(TATT)3p456683756684812Design Primer
227NC_014050(CTCA)3p457075357076412Design Primer
228NC_014050(GGCT)4p457115457116916Design Primer
229NC_014050(TCTT)3p457149157150212Design Primer
230NC_014050(TAAC)4p457313657315116Design Primer
231NC_014050(ATTC)3p457397057398112Design Primer
232NC_014050(GGTT)3p457608157609212Design Primer
233NC_014050(TTAC)3p457748657749712Design Primer
234NC_014050(TCTG)3p457938057939112Design Primer
235NC_014050(TTTC)3p458043458044512Design Primer
236NC_014050(TTTC)3p458123758124812Design Primer
237NC_014050(GATT)3p458591158592212Design Primer
238NC_014050(AAGG)3p458652258653312Design Primer
239NC_014050(TTTC)3p458757458758512Design Primer
240NC_014050(ATTC)3p458981258982312Design Primer
241NC_014050(TTCT)3p459033059034112Design Primer
242NC_014050(ATTT)3p459260059261112Design Primer
243NC_014050(AGAT)3p460250660251712Design Primer
244NC_014050(TCAA)3p460267060268112Design Primer
245NC_014050(ATTG)3p460495660496712Design Primer
246NC_014050(CTTG)3p460677760678812Design Primer
247NC_014050(TGCC)3p460759660760712Design Primer
248NC_014050(AATA)3p460916560917612Design Primer
249NC_014050(ATTT)3p461239061240112Design Primer
250NC_014050(GTTT)3p461529861530912Design Primer
251NC_014050(TACC)3p462098962100012Design Primer
252NC_014050(TCTT)3p462596462597512Design Primer
253NC_014050(TTCT)3p463235763236812Design Primer
254NC_014050(GTAA)3p463673363674412Design Primer
255NC_014050(TGTA)3p463887363888412Design Primer
256NC_014050(GTTT)3p464010264011312Design Primer
257NC_014050(AAGA)3p464107864108912Design Primer
258NC_014050(CTAT)3p464154964156012Design Primer
259NC_014050(AAGA)4p464252364253816Design Primer
260NC_014050(AGCT)3p464520964522012Design Primer
261NC_014050(GGCT)3p464704564705612Design Primer
262NC_014050(GCTT)3p464778864779912Design Primer
263NC_014050(AAGG)3p464949364950412Design Primer
264NC_014050(CAAA)3p466422766423812Design Primer
265NC_014050(CATT)3p466548466549512Design Primer
266NC_014050(CTTT)3p466900266901312Design Primer
267NC_014050(TATG)3p467899567900612Design Primer
268NC_014050(AAAG)3p467961667962712Design Primer
269NC_014050(GAGG)3p468143568144612Design Primer
270NC_014050(CTTC)3p468981768982812Design Primer
271NC_014050(TGAC)3p469049769050812Design Primer
272NC_014050(TTCT)3p469142669143712Design Primer
273NC_014050(AGTC)3p469615669616712Design Primer
274NC_014050(GAAA)3p470510970512012Design Primer
275NC_014050(GAAA)3p470675170676212Design Primer
276NC_014050(TCTT)4p470721370722816Design Primer
277NC_014050(TAAG)3p471022771023812Design Primer
278NC_014050(AGTA)3p471250571251612Design Primer
279NC_014050(GAAA)3p471859771860812Design Primer
280NC_014050(GATT)3p472328472329512Design Primer
281NC_014050(AGTA)3p472360272361312Design Primer
282NC_014050(ATAA)3p473959373960412Design Primer
283NC_014050(ATTC)3p474050574051612Design Primer
284NC_014050(AGAA)4p474442274443716Design Primer
285NC_014050(TTCT)5p474613774615620Design Primer
286NC_014050(AGCT)3p474759974761012Design Primer
287NC_014050(ACAA)3p474800274801312Design Primer
288NC_014050(TACT)3p474933974935012Design Primer
289NC_014050(TTCT)3p474971074972112Design Primer
290NC_014050(CTGA)3p475013075014112Design Primer
291NC_014050(GCCA)3p475267175268212Design Primer
292NC_014050(GCTG)3p475609875610912Design Primer
293NC_014050(CTTT)3p476032576033612Design Primer
294NC_014050(CATA)3p476091076092112Design Primer
295NC_014050(AGAA)3p476151476152512Design Primer
296NC_014050(ATTC)3p476240276241312Design Primer
297NC_014050(GTTT)4p476298876300316Design Primer
298NC_014050(ATAC)3p476745376746412Design Primer
299NC_014050(CTTT)3p477342777343812Design Primer
300NC_014050(GTCA)3p477737377738412Design Primer
301NC_014050(AAAG)3p477770677771712Design Primer
302NC_014050(GCAA)3p477866377867412Design Primer
303NC_014050(AGAA)3p478154978156012Design Primer
304NC_014050(GAAT)3p478172978174012Design Primer
305NC_014050(TCTT)3p479635879636912Design Primer
306NC_014050(AAGA)3p480553980555012Design Primer
307NC_014050(GAAA)4p481593881595316Design Primer
308NC_014050(GACA)3p481948181949212Design Primer
309NC_014050(ACAG)3p482041282042312Design Primer
310NC_014050(TATG)3p482144682145712Design Primer
311NC_014050(AGAC)3p482200482201512Design Primer
312NC_014050(CAGA)3p482848182849212Design Primer
313NC_014050(CCAA)3p482957082958112Design Primer
314NC_014050(TTCT)3p483072483073512Design Primer
315NC_014050(ATTC)3p483413183414212Design Primer
316NC_014050(GAAA)3p483447683448712Design Primer
317NC_014050(GGAA)3p483653083654112Design Primer
318NC_014050(CTTT)3p483688183689212Design Primer
319NC_014050(CAAA)3p484146084147112Design Primer
320NC_014050(AAAG)5p484254284256120Design Primer
321NC_014050(CCAA)3p485074985076012Design Primer
322NC_014050(AAAG)4p485255685257116Design Primer
323NC_014050(TTCA)4p485295585297016Design Primer
324NC_014050(TTTC)3p485504485505512Design Primer
325NC_014050(AGCA)3p485524485525512Design Primer
326NC_014050(GATA)3p485649785650812Design Primer
327NC_014050(TTCT)3p485693685694712Design Primer
328NC_014050(ACAG)3p485919285920312Design Primer
329NC_014050(CAAG)3p486057086058112Design Primer
330NC_014050(AGAA)3p486464986466012Design Primer
331NC_014050(TTCT)3p487665887666912Design Primer
332NC_014050(GAAA)3p487866687867712Design Primer
333NC_014050(CAAC)3p488261988263012Design Primer
334NC_014050(TCTT)4p488425288426716Design Primer
335NC_014050(GAAT)3p488462188463212Design Primer
336NC_014050(AGCC)3p488789288790312Design Primer
337NC_014050(AATT)3p489204589205612Design Primer
338NC_014050(TCAA)3p489455789456812Design Primer
339NC_014050(TTCT)3p490053890054912Design Primer
340NC_014050(TAAT)4p490448690450116Design Primer
341NC_014050(GACT)3p491188391189412Design Primer
342NC_014050(GGGC)3p491382891383912Design Primer
343NC_014050(TTCT)3p491439191440212Design Primer
344NC_014050(GTAA)3p491602491603512Design Primer
345NC_014050(CAAC)3p491653891654912Design Primer
346NC_014050(CTTG)3p491703791704812Design Primer
347NC_014050(CTTT)3p491841991843012Design Primer
348NC_014050(TCTT)3p492003992005012Design Primer
349NC_014050(TATT)3p492241292242312Design Primer
350NC_014050(TTAG)3p492536692537712Design Primer
351NC_014050(ATCT)3p492847292848312Design Primer
352NC_014050(TTAT)3p493196093197112Design Primer
353NC_014050(TTCT)3p493216593217612Design Primer
354NC_014050(AGTC)3p493329893330912Design Primer
355NC_014050(CTTG)3p493648793649812Design Primer
356NC_014050(AAGA)3p493786893787912Design Primer
357NC_014050(AAGA)3p493956993958012Design Primer
358NC_014050(CTTT)5p494041794043620Design Primer
359NC_014050(TTTC)3p494341794342812Design Primer
360NC_014050(CTTT)3p494370394371412Design Primer
361NC_014050(TTTC)4p494419094420516Design Primer
362NC_014050(ATAG)3p495155795156812Design Primer
363NC_014050(GGCT)3p495531095532112Design Primer
364NC_014050(AAAG)3p495707095708112Design Primer
365NC_014050(TGAA)3p495774795775812Design Primer
366NC_014050(CTTC)3p496013996015012Design Primer
367NC_014050(GGTT)3p496223296224312Design Primer
368NC_014050(CAGA)3p496311996313012Design Primer
369NC_014050(AAGA)3p496545596546612Design Primer
370NC_014050(AATA)3p497068397069412Design Primer
371NC_014050(TTTC)3p497294197295212Design Primer
372NC_014050(GGTG)3p497922997924012Design Primer
373NC_014050(CATT)3p497934297935312Design Primer
374NC_014050(AAAG)3p498102098103112Design Primer
375NC_014050(GAAA)3p498163898164912Design Primer