MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002944	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406099
2	NC_002944	CGG	2	6	81	86	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406099
3	NC_002944	GCC	2	6	88	93	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406099
4	NC_002944	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406099
5	NC_002944	CTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406099
6	NC_002944	GCC	3	9	260	268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406099
7	NC_002944	CAG	2	6	274	279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406099
8	NC_002944	CGA	2	6	312	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406099
9	NC_002944	CGC	2	6	366	371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406099
10	NC_002944	CCG	2	6	377	382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406099
11	NC_002944	ACG	2	6	383	388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406099
12	NC_002944	ACT	2	6	452	457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406099
13	NC_002944	CGC	2	6	492	497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406099
14	NC_002944	CCG	2	6	513	518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406099
15	NC_002944	CGC	3	9	567	575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406099
16	NC_002944	GTT	2	6	615	620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406099
17	NC_002944	CTG	2	6	655	660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406099
18	NC_002944	CGC	2	6	663	668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406099
19	NC_002944	TCA	2	6	743	748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406099
20	NC_002944	CGA	2	6	759	764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406099
21	NC_002944	AGG	2	6	854	859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406099
22	NC_002944	TTC	2	6	862	867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406099
23	NC_002944	CAA	2	6	894	899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406099
24	NC_002944	TCC	2	6	913	918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406099
25	NC_002944	GCC	2	6	924	929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406099
26	NC_002944	AAG	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406099
27	NC_002944	CGA	2	6	1068	1073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406099
28	NC_002944	CAG	2	6	1092	1097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406099
29	NC_002944	TGC	2	6	1199	1204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406099
30	NC_002944	CCA	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406099
31	NC_002944	GCC	2	6	1258	1263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406099
32	NC_002944	CCG	2	6	1265	1270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406099
33	NC_002944	ACC	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406099
34	NC_002944	CAC	2	6	1497	1502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406099
35	NC_002944	CGC	2	6	1535	1540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_002944	GTA	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002944	GCC	2	6	1746	1751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_002944	GCG	2	6	1789	1794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002944	TTA	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002944	TTC	2	6	1855	1860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_002944	CGT	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_002944	GTT	2	6	1972	1977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002944	GTC	3	9	1995	2003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_002944	CGA	2	6	2110	2115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406100
45	NC_002944	TGC	2	6	2233	2238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406100
46	NC_002944	CGA	2	6	2249	2254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406100
47	NC_002944	CCG	2	6	2290	2295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406100
48	NC_002944	GGC	2	6	2306	2311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406100
49	NC_002944	CAA	2	6	2381	2386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406100
50	NC_002944	CGA	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406100
51	NC_002944	GAG	2	6	2499	2504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406100
52	NC_002944	CGA	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406100
53	NC_002944	GGT	2	6	2624	2629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406100
54	NC_002944	GCC	2	6	2634	2639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406100
55	NC_002944	CGG	2	6	2680	2685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406100
56	NC_002944	GCG	2	6	2703	2708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406100
57	NC_002944	GGC	2	6	2738	2743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406100
58	NC_002944	CTG	2	6	2814	2819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406100
59	NC_002944	GCA	2	6	2842	2847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406100
60	NC_002944	CTG	2	6	2856	2861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406100
61	NC_002944	CGG	2	6	2908	2913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406100
62	NC_002944	CCA	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406100
63	NC_002944	TGG	2	6	2956	2961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406100
64	NC_002944	TGG	2	6	2965	2970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406100
65	NC_002944	CCG	2	6	3025	3030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406100
66	NC_002944	CGA	2	6	3035	3040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406100
67	NC_002944	AGG	2	6	3055	3060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406100
68	NC_002944	CAC	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406100
69	NC_002944	CTG	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406100
70	NC_002944	CGA	3	9	3206	3214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406100
71	NC_002944	CCG	2	6	3219	3224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406100
72	NC_002944	CTG	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406100
73	NC_002944	GGT	2	6	3503	3508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406101
74	NC_002944	ACG	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406101
75	NC_002944	CGC	2	6	3560	3565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406101
76	NC_002944	GCA	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406101
77	NC_002944	TGC	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406101
78	NC_002944	GCG	2	6	3692	3697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406101
79	NC_002944	CGA	2	6	3707	3712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406101
80	NC_002944	GCG	2	6	3725	3730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406101
81	NC_002944	CGC	2	6	3740	3745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406101
82	NC_002944	GCT	2	6	3950	3955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406101
83	NC_002944	GCG	2	6	3972	3977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406101
84	NC_002944	GCG	2	6	4005	4010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406101
85	NC_002944	GCT	2	6	4058	4063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406101
86	NC_002944	GGC	2	6	4073	4078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406101
87	NC_002944	CGA	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406101
88	NC_002944	GCC	2	6	4221	4226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406101
89	NC_002944	TGC	2	6	4234	4239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406101
90	NC_002944	CGA	2	6	4244	4249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406101
91	NC_002944	TGC	2	6	4264	4269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406101
92	NC_002944	CGA	2	6	4271	4276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406101
93	NC_002944	CGC	2	6	4295	4300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406101
94	NC_002944	CCG	3	9	4301	4309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406101
95	NC_002944	CCG	2	6	4333	4338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406101
96	NC_002944	CGG	2	6	4357	4362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406101
97	NC_002944	CGG	2	6	4395	4400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406101
98	NC_002944	TCG	2	6	4405	4410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406101
99	NC_002944	CGA	2	6	4459	4464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_002944	GCG	2	6	4510	4515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406102
101	NC_002944	GAG	2	6	4523	4528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406102
102	NC_002944	GCA	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406102
103	NC_002944	CGC	2	6	4590	4595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406102
104	NC_002944	GCG	2	6	4612	4617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406102
105	NC_002944	CGG	2	6	4743	4748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406102
106	NC_002944	CCG	2	6	4815	4820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406102
107	NC_002944	GAT	2	6	4849	4854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406102
108	NC_002944	CGC	3	9	4879	4887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406102
109	NC_002944	GTG	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406102
110	NC_002944	GAC	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_002944	GAA	2	6	5110	5115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002944	TTG	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002944	AGA	3	9	5268	5276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406103
114	NC_002944	CAC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406103
115	NC_002944	GGT	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406103
116	NC_002944	CGA	2	6	5419	5424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406103
117	NC_002944	GAC	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406103
118	NC_002944	GTG	2	6	5549	5554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406103
119	NC_002944	CGG	2	6	5572	5577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406103
120	NC_002944	CGG	2	6	5584	5589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406103
121	NC_002944	GCG	2	6	5613	5618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406103
122	NC_002944	GGT	2	6	5641	5646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406103
123	NC_002944	TAC	2	6	5708	5713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406103
124	NC_002944	CCA	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406103
125	NC_002944	CAC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406103
126	NC_002944	ACC	2	6	5807	5812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406103
127	NC_002944	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406103
128	NC_002944	CGA	2	6	5890	5895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406103
129	NC_002944	GTC	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406103
130	NC_002944	GGT	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406103
131	NC_002944	CCG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406103
132	NC_002944	GGC	2	6	5971	5976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406103
133	NC_002944	CGG	2	6	6025	6030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406103
134	NC_002944	CCA	2	6	6076	6081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406103
135	NC_002944	CAT	2	6	6085	6090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406103
136	NC_002944	CGG	2	6	6145	6150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406103
137	NC_002944	GGC	2	6	6200	6205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406103
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149	NC_002944	GCT	2	6	7030	7035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406103
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152	NC_002944	GAC	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406103
153	NC_002944	TGC	2	6	7158	7163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406103
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166	NC_002944	TGC	2	6	7799	7804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406104
167	NC_002944	CTG	2	6	7822	7827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406104
168	NC_002944	CGC	2	6	7874	7879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406104
169	NC_002944	CGA	2	6	7935	7940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406104
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258	NC_002944	CCA	2	6	11736	11741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_002944	ACG	2	6	11748	11753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_002944	CGT	2	6	11854	11859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406107
261	NC_002944	CTC	2	6	11862	11867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406107
262	NC_002944	CGC	2	6	11873	11878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406107
263	NC_002944	CGC	2	6	11889	11894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406107
264	NC_002944	TTC	2	6	11948	11953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406107
265	NC_002944	TCT	2	6	12036	12041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406107
266	NC_002944	CGA	2	6	12114	12119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406107
267	NC_002944	CCG	2	6	12195	12200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406107
268	NC_002944	CTG	2	6	12233	12238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406107
269	NC_002944	ATC	2	6	12266	12271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406107
270	NC_002944	GAG	2	6	12272	12277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406107
271	NC_002944	CCG	2	6	12291	12296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406107
272	NC_002944	ATG	2	6	12368	12373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406107
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274	NC_002944	CCA	3	9	12438	12446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406107
275	NC_002944	CTG	2	6	12449	12454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406107
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280	NC_002944	AGC	2	6	12609	12614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406107
281	NC_002944	GCT	2	6	12673	12678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406107
282	NC_002944	CTG	3	9	12863	12871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406107
283	NC_002944	GCC	2	6	12941	12946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406107
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285	NC_002944	CGG	2	6	13164	13169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406108
286	NC_002944	CGG	2	6	13226	13231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406108
287	NC_002944	ACC	2	6	13336	13341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406108
288	NC_002944	GCG	2	6	13348	13353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406108
289	NC_002944	GCT	2	6	13430	13435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406108
290	NC_002944	CGG	2	6	13629	13634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_002944	TCG	2	6	13786	13791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406109
292	NC_002944	CTC	2	6	13841	13846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406109
293	NC_002944	ACG	2	6	13858	13863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406109
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295	NC_002944	CGG	2	6	13931	13936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406109
296	NC_002944	CGA	2	6	13955	13960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406109
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298	NC_002944	TCA	2	6	14044	14049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406109
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301	NC_002944	GTC	2	6	14124	14129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406109
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320	NC_002944	CGA	2	6	15133	15138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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374	NC_002944	GAC	2	6	17657	17662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406114
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385	NC_002944	GAT	2	6	18196	18201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406114
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388	NC_002944	CGA	2	6	18336	18341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406114
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500	NC_002944	TCG	2	6	23382	23387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119

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