MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002944	GGC	2	6	73214	73219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406163
1502	NC_002944	GCT	2	6	73232	73237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406163
1503	NC_002944	TTC	2	6	73284	73289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406163
1504	NC_002944	CGT	2	6	73334	73339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406163
1505	NC_002944	GCC	2	6	73391	73396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406163
1506	NC_002944	GTC	2	6	73413	73418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406163
1507	NC_002944	TGT	2	6	73437	73442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406163
1508	NC_002944	TGG	2	6	73507	73512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406163
1509	NC_002944	CGC	2	6	73514	73519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406163
1510	NC_002944	CTG	2	6	73524	73529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406163
1511	NC_002944	CGG	2	6	73599	73604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406163
1512	NC_002944	TGC	2	6	73606	73611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406163
1513	NC_002944	TAC	2	6	73656	73661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406163
1514	NC_002944	CAC	3	9	73703	73711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406163
1515	NC_002944	TGC	3	9	73714	73722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406163
1516	NC_002944	GAC	2	6	73812	73817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406163
1517	NC_002944	CGG	2	6	73819	73824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406163
1518	NC_002944	CGC	2	6	73896	73901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406163
1519	NC_002944	CAC	2	6	73978	73983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406164
1520	NC_002944	TGC	2	6	74010	74015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406164
1521	NC_002944	TCG	2	6	74043	74048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406164
1522	NC_002944	CGA	2	6	74113	74118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406164
1523	NC_002944	GTG	3	9	74135	74143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406164
1524	NC_002944	CGG	2	6	74149	74154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406164
1525	NC_002944	ACG	2	6	74178	74183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406164
1526	NC_002944	CAC	2	6	74230	74235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406164
1527	NC_002944	TGC	2	6	74256	74261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406164
1528	NC_002944	CCA	2	6	74295	74300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406164
1529	NC_002944	GTC	2	6	74360	74365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406164
1530	NC_002944	CAT	2	6	74383	74388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406164
1531	NC_002944	TGG	2	6	74433	74438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406164
1532	NC_002944	GCT	2	6	74440	74445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406164
1533	NC_002944	GCC	2	6	74468	74473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406164
1534	NC_002944	GCT	2	6	74476	74481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406164
1535	NC_002944	GCC	2	6	74500	74505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406164
1536	NC_002944	GCG	2	6	74537	74542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406164
1537	NC_002944	CCT	2	6	74662	74667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_002944	AGG	2	6	74700	74705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_002944	CGA	2	6	74760	74765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406165
1540	NC_002944	CGT	2	6	74802	74807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406165
1541	NC_002944	CGT	2	6	74898	74903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406165
1542	NC_002944	TGC	2	6	74972	74977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406165
1543	NC_002944	CCA	2	6	75082	75087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_002944	GCG	2	6	75093	75098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_002944	GAG	2	6	75115	75120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_002944	GCC	2	6	75202	75207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406166
1547	NC_002944	GCC	2	6	75313	75318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406166
1548	NC_002944	AGC	2	6	75377	75382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406166
1549	NC_002944	CAA	2	6	75477	75482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406166
1550	NC_002944	GCG	4	12	75494	75505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406166
1551	NC_002944	GGC	2	6	75508	75513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406166
1552	NC_002944	CGG	2	6	75516	75521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406166
1553	NC_002944	CAG	2	6	75532	75537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406166
1554	NC_002944	CAG	2	6	75549	75554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406166
1555	NC_002944	CGA	2	6	75564	75569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406166
1556	NC_002944	CGG	3	9	75603	75611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406166
1557	NC_002944	CGA	3	9	75612	75620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406166
1558	NC_002944	CCG	2	6	75622	75627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406166
1559	NC_002944	AAG	2	6	75632	75637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406166
1560	NC_002944	CAG	2	6	75645	75650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_002944	CAA	2	6	75686	75691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406167
1562	NC_002944	GCG	2	6	75692	75697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406167
1563	NC_002944	GAA	2	6	75746	75751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406167
1564	NC_002944	GCT	2	6	75782	75787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406167
1565	NC_002944	GCA	2	6	75848	75853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406167
1566	NC_002944	GAA	2	6	75878	75883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406167
1567	NC_002944	GCT	2	6	75899	75904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406167
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1569	NC_002944	CTG	2	6	76047	76052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406168
1570	NC_002944	CGA	2	6	76100	76105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406168
1571	NC_002944	CCG	2	6	76109	76114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406168
1572	NC_002944	CCG	2	6	76246	76251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406168
1573	NC_002944	CGT	2	6	76256	76261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406168
1574	NC_002944	AAG	2	6	76272	76277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406168
1575	NC_002944	CGG	2	6	76280	76285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406168
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1577	NC_002944	CGG	2	6	76441	76446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_002944	GCC	3	9	76459	76467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_002944	CGT	2	6	76829	76834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_002944	GAG	2	6	76937	76942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_002944	GTC	2	6	76956	76961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406169
1582	NC_002944	TCG	3	9	76986	76994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406169
1583	NC_002944	GGC	2	6	77033	77038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406169
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1588	NC_002944	CTG	2	6	77226	77231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406169
1589	NC_002944	CGC	2	6	77232	77237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406169
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1591	NC_002944	CTA	2	6	77300	77305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406169
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1604	NC_002944	GAC	2	6	77687	77692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406169
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1607	NC_002944	GGT	2	6	77750	77755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406169
1608	NC_002944	TCG	2	6	77821	77826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406169
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1611	NC_002944	GCC	2	6	78093	78098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406169
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1620	NC_002944	CTT	2	6	78914	78919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406169
1621	NC_002944	TCT	2	6	78958	78963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406169
1622	NC_002944	TGT	2	6	79000	79005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406169
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1998	NC_002944	ATC	2	6	99680	99685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406189
1999	NC_002944	CCA	2	6	99747	99752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2000	NC_002944	CCG	2	6	99841	99846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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