MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002944	GGC	2	6	125684	125689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406213
2502	NC_002944	GCG	2	6	125731	125736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406213
2503	NC_002944	CGG	2	6	125741	125746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406213
2504	NC_002944	CCG	2	6	125856	125861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406213
2505	NC_002944	TGA	2	6	125884	125889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406213
2506	NC_002944	GCA	2	6	125899	125904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406213
2507	NC_002944	GAG	2	6	125937	125942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406213
2508	NC_002944	GTG	2	6	125979	125984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406213
2509	NC_002944	CAA	2	6	126020	126025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406213
2510	NC_002944	GCC	2	6	126111	126116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406213
2511	NC_002944	CCG	2	6	126120	126125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406213
2512	NC_002944	AGG	2	6	126145	126150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406213
2513	NC_002944	CGC	2	6	126161	126166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406213
2514	NC_002944	GCA	2	6	126170	126175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406213
2515	NC_002944	GGC	2	6	126234	126239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406213
2516	NC_002944	CGA	2	6	126263	126268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406213
2517	NC_002944	TGC	2	6	126397	126402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406213
2518	NC_002944	CGG	2	6	126413	126418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406213
2519	NC_002944	CGG	2	6	126432	126437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_002944	CCA	2	6	126509	126514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406214
2521	NC_002944	GCT	2	6	126530	126535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406214
2522	NC_002944	GCG	2	6	126592	126597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406214
2523	NC_002944	GCC	2	6	126629	126634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406214
2524	NC_002944	GCC	3	9	126707	126715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406214
2525	NC_002944	TGG	2	6	126783	126788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406214
2526	NC_002944	CGA	2	6	126805	126810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406214
2527	NC_002944	CAC	2	6	126853	126858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406214
2528	NC_002944	ACC	2	6	126872	126877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406214
2529	NC_002944	CGG	2	6	126895	126900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406214
2530	NC_002944	GCG	2	6	126930	126935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406214
2531	NC_002944	CGG	2	6	126977	126982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406214
2532	NC_002944	CGG	2	6	127044	127049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406214
2533	NC_002944	GCA	2	6	127068	127073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406214
2534	NC_002944	ACC	2	6	127080	127085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406214
2535	NC_002944	CGC	3	9	127132	127140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406214
2536	NC_002944	GCC	2	6	127214	127219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406214
2537	NC_002944	CTG	3	9	127232	127240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406214
2538	NC_002944	CGG	2	6	127305	127310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406214
2539	NC_002944	CCG	2	6	127401	127406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406214
2540	NC_002944	CCA	2	6	127425	127430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406214
2541	NC_002944	TAC	2	6	127514	127519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406214
2542	NC_002944	TGC	2	6	127554	127559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406214
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2544	NC_002944	GGC	2	6	127609	127614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406214
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2546	NC_002944	CAC	2	6	127723	127728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406214
2547	NC_002944	CGG	2	6	127733	127738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406214
2548	NC_002944	GAC	2	6	127761	127766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406214
2549	NC_002944	CGC	2	6	127811	127816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406214
2550	NC_002944	GGC	2	6	127865	127870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_002944	TAC	2	6	127954	127959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_002944	CTG	2	6	128078	128083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406215
2553	NC_002944	CTG	2	6	128096	128101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406215
2554	NC_002944	TCG	2	6	128118	128123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406215
2555	NC_002944	GTG	2	6	128183	128188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406215
2556	NC_002944	TGC	2	6	128220	128225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406215
2557	NC_002944	GTG	2	6	128296	128301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406216
2558	NC_002944	CGG	2	6	128310	128315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406216
2559	NC_002944	CTG	2	6	128317	128322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406216
2560	NC_002944	ACG	2	6	128395	128400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406216
2561	NC_002944	GGC	2	6	128412	128417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406216
2562	NC_002944	CGG	2	6	128432	128437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406216
2563	NC_002944	GGC	2	6	128535	128540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406216
2564	NC_002944	ACC	2	6	128558	128563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406216
2565	NC_002944	GGC	2	6	128564	128569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406216
2566	NC_002944	CTC	2	6	128675	128680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2567	NC_002944	GTT	2	6	128743	128748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_002944	ACC	2	6	128956	128961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406217
2569	NC_002944	GCC	2	6	128988	128993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406217
2570	NC_002944	GTT	2	6	128994	128999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406217
2571	NC_002944	GCG	2	6	129008	129013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406217
2572	NC_002944	GAG	2	6	129018	129023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406217
2573	NC_002944	TGA	2	6	129194	129199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406217
2574	NC_002944	CGT	2	6	129206	129211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406217
2575	NC_002944	CCG	2	6	129233	129238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406217
2576	NC_002944	GCG	2	6	129348	129353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406217
2577	NC_002944	ACG	3	9	129400	129408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406217
2578	NC_002944	GAT	2	6	129468	129473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406217
2579	NC_002944	CGC	2	6	129483	129488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406217
2580	NC_002944	GTC	2	6	129558	129563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406217
2581	NC_002944	CAG	2	6	129567	129572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406217
2582	NC_002944	TGA	2	6	129574	129579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406217
2583	NC_002944	CCG	2	6	129590	129595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406217
2584	NC_002944	CGC	2	6	129609	129614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406217
2585	NC_002944	GCA	2	6	129626	129631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406217
2586	NC_002944	GTC	2	6	129678	129683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406217
2587	NC_002944	CAG	2	6	129693	129698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406217
2588	NC_002944	ATC	2	6	129836	129841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406218
2589	NC_002944	GCC	2	6	129849	129854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406218
2590	NC_002944	GAC	2	6	129896	129901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406218
2591	NC_002944	GCG	2	6	129973	129978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406218
2592	NC_002944	GCT	2	6	130000	130005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406218
2593	NC_002944	GCA	2	6	130030	130035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406218
2594	NC_002944	CGC	2	6	130078	130083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406218
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2597	NC_002944	CGG	2	6	130241	130246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406219
2598	NC_002944	CAT	2	6	130296	130301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406219
2599	NC_002944	GGC	2	6	130374	130379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406219
2600	NC_002944	GCG	2	6	130426	130431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406219
2601	NC_002944	GCC	3	9	130495	130503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406219
2602	NC_002944	TCG	2	6	130694	130699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406219
2603	NC_002944	GTG	2	6	130717	130722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406219
2604	NC_002944	CGA	2	6	130829	130834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406220
2605	NC_002944	GCG	2	6	130837	130842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406220
2606	NC_002944	GGC	2	6	130866	130871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406220
2607	NC_002944	GGT	2	6	130893	130898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406220
2608	NC_002944	GGT	3	9	130902	130910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406220
2609	NC_002944	CCG	2	6	130943	130948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406220
2610	NC_002944	GCG	2	6	131065	131070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406220
2611	NC_002944	GCT	2	6	131150	131155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406221
2612	NC_002944	AGC	2	6	131157	131162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406221
2613	NC_002944	GCA	2	6	131193	131198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406221
2614	NC_002944	CGG	2	6	131230	131235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406221
2615	NC_002944	CCG	2	6	131290	131295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406221
2616	NC_002944	GCC	2	6	131367	131372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406221
2617	NC_002944	CCG	2	6	131401	131406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406221
2618	NC_002944	GCC	2	6	131466	131471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406221
2619	NC_002944	TGG	2	6	131494	131499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406221
2620	NC_002944	CGA	2	6	131500	131505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406221
2621	NC_002944	GGC	2	6	131573	131578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406221
2622	NC_002944	CAC	2	6	131579	131584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406221
2623	NC_002944	ACC	2	6	131589	131594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406221
2624	NC_002944	CGA	2	6	131602	131607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406221
2625	NC_002944	AGC	2	6	131625	131630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406221
2626	NC_002944	GGA	2	6	131649	131654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406221
2627	NC_002944	CGG	2	6	131761	131766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406221
2628	NC_002944	GCG	4	12	131781	131792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406221
2629	NC_002944	AGA	2	6	131821	131826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406221
2630	NC_002944	TTC	2	6	131924	131929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406221
2631	NC_002944	CAG	2	6	131960	131965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406221
2632	NC_002944	ATC	2	6	132041	132046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_002944	TCC	2	6	132075	132080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2634	NC_002944	GCT	3	9	132091	132099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406222
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2637	NC_002944	CCG	2	6	132242	132247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406222
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2641	NC_002944	TGG	2	6	132414	132419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406222
2642	NC_002944	GCC	2	6	132476	132481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406222
2643	NC_002944	GCG	2	6	132512	132517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406222
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2645	NC_002944	CGA	3	9	132598	132606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406222
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2649	NC_002944	TGC	2	6	132768	132773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406222
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2652	NC_002944	ACC	2	6	132984	132989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406223
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2662	NC_002944	GTG	2	6	133987	133992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406224
2663	NC_002944	TCC	2	6	134014	134019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406224
2664	NC_002944	ACG	2	6	134183	134188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2665	NC_002944	TGG	2	6	134395	134400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406225
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2667	NC_002944	TCG	2	6	134482	134487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
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2671	NC_002944	CGT	2	6	134555	134560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
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2863	NC_002944	GCA	2	6	143385	143390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
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