MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002944	CGG	2	6	47909	47914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406140
1002	NC_002944	GCC	2	6	48067	48072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406141
1003	NC_002944	TCC	2	6	48096	48101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406141
1004	NC_002944	GCC	2	6	48123	48128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406141
1005	NC_002944	CGG	2	6	48131	48136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406141
1006	NC_002944	CCG	2	6	48156	48161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406141
1007	NC_002944	TTG	2	6	48207	48212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406141
1008	NC_002944	CGG	2	6	48368	48373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406141
1009	NC_002944	CAG	2	6	48410	48415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406141
1010	NC_002944	CCG	2	6	48463	48468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406141
1011	NC_002944	CGA	2	6	48502	48507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406141
1012	NC_002944	CGG	2	6	48520	48525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406141
1013	NC_002944	CAG	2	6	48596	48601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406141
1014	NC_002944	TGG	2	6	48612	48617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406141
1015	NC_002944	GGC	2	6	48663	48668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406141
1016	NC_002944	TGC	2	6	48743	48748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_002944	CGC	2	6	48805	48810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406142
1018	NC_002944	GCC	2	6	48811	48816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406142
1019	NC_002944	CGA	2	6	48817	48822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406142
1020	NC_002944	CGT	2	6	48889	48894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406142
1021	NC_002944	CGA	2	6	48925	48930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406142
1022	NC_002944	CGT	2	6	48985	48990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406142
1023	NC_002944	CAC	2	6	49064	49069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406142
1024	NC_002944	AGC	2	6	49080	49085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406142
1025	NC_002944	CGA	2	6	49105	49110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406142
1026	NC_002944	CGG	2	6	49158	49163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406142
1027	NC_002944	GCG	2	6	49171	49176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406142
1028	NC_002944	CGG	2	6	49207	49212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406142
1029	NC_002944	GAA	2	6	49217	49222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406142
1030	NC_002944	CAG	2	6	49286	49291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406142
1031	NC_002944	CAC	2	6	49304	49309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406142
1032	NC_002944	GGC	2	6	49319	49324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406142
1033	NC_002944	GTC	2	6	49436	49441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406142
1034	NC_002944	ACA	2	6	49474	49479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406142
1035	NC_002944	CGC	2	6	49520	49525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406142
1036	NC_002944	CAC	2	6	49631	49636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406142
1037	NC_002944	CAC	2	6	49649	49654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406142
1038	NC_002944	CGA	2	6	49684	49689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406142
1039	NC_002944	CAG	3	9	49721	49729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406142
1040	NC_002944	CAG	2	6	49859	49864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406142
1041	NC_002944	CGG	2	6	49915	49920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406142
1042	NC_002944	CAG	2	6	49937	49942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406142
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1044	NC_002944	AAC	2	6	49965	49970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406142
1045	NC_002944	GCA	2	6	50002	50007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406142
1046	NC_002944	GCC	2	6	50008	50013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406142
1047	NC_002944	CAA	2	6	50140	50145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_002944	CGA	2	6	50187	50192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_002944	ATG	2	6	50206	50211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_002944	GCC	3	9	50219	50227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406143
1051	NC_002944	GGA	2	6	50228	50233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406143
1052	NC_002944	CGC	2	6	50255	50260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406143
1053	NC_002944	TGC	2	6	50284	50289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406143
1054	NC_002944	CTG	2	6	50304	50309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406143
1055	NC_002944	ACG	2	6	50353	50358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406143
1056	NC_002944	CCG	2	6	50398	50403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406143
1057	NC_002944	TGC	2	6	50413	50418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406143
1058	NC_002944	GGC	2	6	50435	50440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406143
1059	NC_002944	CGG	2	6	50462	50467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406143
1060	NC_002944	GTG	2	6	50562	50567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406143
1061	NC_002944	TGG	2	6	50608	50613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406143
1062	NC_002944	GAC	2	6	50682	50687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406143
1063	NC_002944	TGG	2	6	50722	50727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406143
1064	NC_002944	GCC	2	6	50761	50766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406143
1065	NC_002944	GCT	2	6	50783	50788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406143
1066	NC_002944	CCG	2	6	50832	50837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_002944	CTG	2	6	50895	50900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406144
1068	NC_002944	CGG	2	6	50933	50938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406144
1069	NC_002944	GCC	2	6	51018	51023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406144
1070	NC_002944	GGC	2	6	51024	51029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406144
1071	NC_002944	GCC	2	6	51043	51048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406144
1072	NC_002944	CCG	2	6	51131	51136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406144
1073	NC_002944	CCG	2	6	51143	51148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406144
1074	NC_002944	CCG	2	6	51204	51209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_002944	TGC	2	6	51239	51244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406145
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1078	NC_002944	GCC	2	6	51347	51352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406145
1079	NC_002944	GCC	2	6	51383	51388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406145
1080	NC_002944	GCG	2	6	51389	51394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406145
1081	NC_002944	GCG	2	6	51413	51418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406145
1082	NC_002944	GGC	2	6	51481	51486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406145
1083	NC_002944	CGA	2	6	51694	51699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406145
1084	NC_002944	GCC	2	6	51706	51711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406145
1085	NC_002944	TGG	2	6	51732	51737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406145
1086	NC_002944	CGA	2	6	51838	51843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406145
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1088	NC_002944	GGT	2	6	52117	52122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406145
1089	NC_002944	GCG	2	6	52128	52133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406145
1090	NC_002944	CGG	2	6	52150	52155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406145
1091	NC_002944	CGG	2	6	52210	52215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406145
1092	NC_002944	CCG	2	6	52280	52285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406145
1093	NC_002944	ATC	2	6	52316	52321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406145
1094	NC_002944	CGC	2	6	52476	52481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_002944	GCC	2	6	52547	52552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406146
1096	NC_002944	CGC	2	6	52569	52574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406146
1097	NC_002944	CCG	2	6	52869	52874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406146
1098	NC_002944	CCG	2	6	52939	52944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406146
1099	NC_002944	CAG	2	6	52975	52980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406146
1100	NC_002944	CCA	2	6	52992	52997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406146
1101	NC_002944	CGC	2	6	53065	53070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406146
1102	NC_002944	CAA	2	6	53071	53076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406146
1103	NC_002944	CGA	2	6	53131	53136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406146
1104	NC_002944	CGG	2	6	53160	53165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406146
1105	NC_002944	GAG	2	6	53261	53266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406146
1106	NC_002944	CCG	2	6	53271	53276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406146
1107	NC_002944	GAT	2	6	53332	53337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406146
1108	NC_002944	GCT	2	6	53362	53367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406146
1109	NC_002944	CGA	2	6	53368	53373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406146
1110	NC_002944	CTG	2	6	53381	53386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406146
1111	NC_002944	ACC	2	6	53504	53509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406146
1112	NC_002944	CGA	2	6	53569	53574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406146
1113	NC_002944	GCC	2	6	53627	53632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406146
1114	NC_002944	CGG	2	6	53660	53665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406146
1115	NC_002944	CCA	2	6	53739	53744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406146
1116	NC_002944	CCA	2	6	53748	53753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406146
1117	NC_002944	GGC	3	9	53974	53982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406146
1118	NC_002944	AGG	2	6	53985	53990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406146
1119	NC_002944	GGC	2	6	54117	54122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406146
1120	NC_002944	CGA	2	6	54133	54138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406146
1121	NC_002944	CGA	2	6	54199	54204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406146
1122	NC_002944	CGC	2	6	54222	54227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406146
1123	NC_002944	CCG	2	6	54420	54425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406146
1124	NC_002944	CGG	2	6	54445	54450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406146
1125	NC_002944	CCG	2	6	54562	54567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406146
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1158	NC_002944	TGA	2	6	56074	56079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406147
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1192	NC_002944	CAA	2	6	58151	58156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406150
1193	NC_002944	GAA	2	6	58190	58195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406150
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1208	NC_002944	CAC	2	6	58721	58726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406150
1209	NC_002944	GTA	2	6	58733	58738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406150
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1212	NC_002944	GCG	2	6	58820	58825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406150
1213	NC_002944	CAG	2	6	58841	58846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1214	NC_002944	CGA	2	6	58864	58869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1215	NC_002944	CAG	2	6	58907	58912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1216	NC_002944	CGT	2	6	59057	59062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1217	NC_002944	TCG	2	6	59067	59072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1218	NC_002944	GCC	2	6	59087	59092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406150
1219	NC_002944	GCA	2	6	59110	59115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1220	NC_002944	GCC	3	9	59160	59168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406150
1221	NC_002944	CAG	2	6	59177	59182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1222	NC_002944	CGA	2	6	59186	59191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1223	NC_002944	TCA	2	6	59269	59274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1224	NC_002944	CGG	2	6	59295	59300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1225	NC_002944	CGC	2	6	59343	59348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406151
1226	NC_002944	ACG	2	6	59390	59395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406151
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1228	NC_002944	GGC	2	6	59411	59416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406151
1229	NC_002944	CGG	2	6	59426	59431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406151
1230	NC_002944	GCA	2	6	59547	59552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406151
1231	NC_002944	GTC	2	6	59554	59559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406151
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1233	NC_002944	TCG	2	6	59648	59653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406151
1234	NC_002944	CGG	2	6	59673	59678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406151
1235	NC_002944	CAG	2	6	59725	59730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406151
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1237	NC_002944	AGC	2	6	59798	59803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406151
1238	NC_002944	GTG	2	6	59815	59820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406151
1239	NC_002944	TCG	2	6	59837	59842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406151
1240	NC_002944	CGA	2	6	59850	59855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406151
1241	NC_002944	CGC	2	6	59859	59864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406151
1242	NC_002944	GGT	2	6	59865	59870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406151
1243	NC_002944	CGT	2	6	59889	59894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406151
1244	NC_002944	AAC	2	6	60022	60027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406151
1245	NC_002944	TTC	2	6	60053	60058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406151
1246	NC_002944	CGA	2	6	60148	60153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1247	NC_002944	CAG	2	6	60257	60262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406152
1248	NC_002944	CCG	2	6	60322	60327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406152
1249	NC_002944	CGG	2	6	60409	60414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406152
1250	NC_002944	TGC	2	6	60441	60446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406152
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1253	NC_002944	CGG	2	6	60583	60588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406152
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1316	NC_002944	CGG	2	6	65104	65109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1369	NC_002944	CAG	2	6	68063	68068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406159
1370	NC_002944	ACG	2	6	68131	68136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1371	NC_002944	GCC	2	6	68232	68237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1498	NC_002944	GCG	2	6	73119	73124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406163
1499	NC_002944	GCT	2	6	73139	73144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406163
1500	NC_002944	TGC	2	6	73159	73164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406163

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