MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002944	GCG	2	6	260802	260807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406337
5502	NC_002944	CGA	2	6	260838	260843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406337
5503	NC_002944	GAT	2	6	260887	260892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406337
5504	NC_002944	CCG	2	6	260970	260975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406337
5505	NC_002944	CGG	2	6	261020	261025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406337
5506	NC_002944	GCT	2	6	261030	261035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406337
5507	NC_002944	CGG	2	6	261074	261079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406337
5508	NC_002944	GCC	2	6	261128	261133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406337
5509	NC_002944	TCC	2	6	261156	261161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406338
5510	NC_002944	GAA	2	6	261246	261251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406338
5511	NC_002944	CAG	2	6	261279	261284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5512	NC_002944	CAG	2	6	261306	261311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5513	NC_002944	GAA	2	6	261333	261338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406338
5514	NC_002944	CGT	2	6	261350	261355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5515	NC_002944	ACC	2	6	261378	261383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406338
5516	NC_002944	TCG	2	6	261400	261405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5517	NC_002944	GCC	2	6	261470	261475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406338
5518	NC_002944	TCG	2	6	261490	261495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5519	NC_002944	AAC	2	6	261568	261573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406338
5520	NC_002944	GTC	2	6	261678	261683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5521	NC_002944	CGT	3	9	261776	261784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5522	NC_002944	GCA	2	6	261824	261829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5523	NC_002944	GCC	2	6	261852	261857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406338
5524	NC_002944	GGT	2	6	261882	261887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406338
5525	NC_002944	CGT	2	6	261926	261931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5526	NC_002944	GGT	2	6	261959	261964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406338
5527	NC_002944	GCT	2	6	261981	261986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5528	NC_002944	TCG	2	6	262012	262017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5529	NC_002944	GCG	2	6	262020	262025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406338
5530	NC_002944	GAC	3	9	262032	262040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5531	NC_002944	CGG	2	6	262069	262074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406339
5532	NC_002944	GCG	2	6	262104	262109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406339
5533	NC_002944	CAC	2	6	262130	262135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406339
5534	NC_002944	GCC	2	6	262145	262150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406339
5535	NC_002944	CGA	2	6	262252	262257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406339
5536	NC_002944	CTT	2	6	262280	262285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406339
5537	NC_002944	TCG	2	6	262317	262322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406339
5538	NC_002944	AGC	2	6	262323	262328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406339
5539	NC_002944	TCG	2	6	262446	262451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406339
5540	NC_002944	GAT	3	9	262499	262507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406339
5541	NC_002944	GCA	2	6	262624	262629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406339
5542	NC_002944	CCA	4	12	262714	262725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406339
5543	NC_002944	GCC	2	6	262751	262756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406339
5544	NC_002944	CTT	2	6	262775	262780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406339
5545	NC_002944	GGC	2	6	262970	262975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406340
5546	NC_002944	CTC	2	6	263114	263119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406340
5547	NC_002944	CGT	2	6	263197	263202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406340
5548	NC_002944	CCT	2	6	263221	263226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406340
5549	NC_002944	AGC	2	6	263229	263234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406340
5550	NC_002944	GCT	2	6	263272	263277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406340
5551	NC_002944	TCG	2	6	263301	263306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406340
5552	NC_002944	CGT	3	9	263308	263316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406340
5553	NC_002944	CAT	2	6	263324	263329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406340
5554	NC_002944	ACC	2	6	263342	263347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406340
5555	NC_002944	TCA	2	6	263364	263369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406340
5556	NC_002944	CGT	2	6	263420	263425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406341
5557	NC_002944	CGC	2	6	263582	263587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406341
5558	NC_002944	CGC	2	6	263608	263613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406341
5559	NC_002944	AGA	2	6	263629	263634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406341
5560	NC_002944	CTG	2	6	263660	263665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406341
5561	NC_002944	ATC	2	6	263814	263819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406341
5562	NC_002944	AAC	2	6	263841	263846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406341
5563	NC_002944	TGG	3	9	263884	263892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406341
5564	NC_002944	CCA	2	6	263893	263898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406341
5565	NC_002944	GCC	2	6	263941	263946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406341
5566	NC_002944	GCC	2	6	263951	263956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406341
5567	NC_002944	AGC	2	6	264024	264029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406341
5568	NC_002944	GGC	2	6	264038	264043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406341
5569	NC_002944	GCG	2	6	264050	264055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406341
5570	NC_002944	AGA	2	6	264067	264072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406341
5571	NC_002944	GCC	2	6	264107	264112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406341
5572	NC_002944	CAC	3	9	264137	264145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406341
5573	NC_002944	AGC	2	6	264150	264155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406341
5574	NC_002944	CCA	2	6	264170	264175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406341
5575	NC_002944	TCT	2	6	264178	264183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406341
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5578	NC_002944	CTT	2	6	264293	264298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406341
5579	NC_002944	GAT	2	6	264329	264334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406341
5580	NC_002944	CTG	3	9	264341	264349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406341
5581	NC_002944	TGA	2	6	264355	264360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406341
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5584	NC_002944	CAG	2	6	264479	264484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406341
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5587	NC_002944	GCC	2	6	264540	264545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406341
5588	NC_002944	GGC	2	6	264611	264616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406341
5589	NC_002944	CGC	2	6	264629	264634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406341
5590	NC_002944	CGG	2	6	264694	264699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406341
5591	NC_002944	GCA	2	6	264733	264738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406341
5592	NC_002944	GCC	2	6	264739	264744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406341
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5601	NC_002944	CAG	2	6	265058	265063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406341
5602	NC_002944	GCC	2	6	265071	265076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406341
5603	NC_002944	CGG	3	9	265078	265086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406341
5604	NC_002944	CAG	3	9	265139	265147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406341
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5607	NC_002944	AAT	2	6	265235	265240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41406341
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5612	NC_002944	GGC	2	6	265691	265696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406342
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5618	NC_002944	CGA	3	9	265838	265846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406342
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5983	NC_002944	CGG	2	6	283781	283786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406361
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