MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002944	TCG	3	9	216104	216112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406309
4502	NC_002944	TTC	2	6	216121	216126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406309
4503	NC_002944	GTG	2	6	216178	216183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406309
4504	NC_002944	CGC	2	6	216187	216192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406309
4505	NC_002944	CGG	2	6	216201	216206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406309
4506	NC_002944	TAA	2	6	216282	216287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41406309
4507	NC_002944	TTC	2	6	216406	216411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406309
4508	NC_002944	GCC	2	6	216460	216465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406309
4509	NC_002944	CCG	2	6	216476	216481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406309
4510	NC_002944	GAG	2	6	216496	216501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406309
4511	NC_002944	GCC	2	6	216706	216711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406309
4512	NC_002944	GGT	2	6	216792	216797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406309
4513	NC_002944	TGC	2	6	216878	216883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406309
4514	NC_002944	TGA	2	6	216911	216916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406309
4515	NC_002944	GAC	3	9	217036	217044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406309
4516	NC_002944	CTA	2	6	217050	217055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406309
4517	NC_002944	CTG	2	6	217084	217089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406309
4518	NC_002944	GCC	2	6	217090	217095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406309
4519	NC_002944	CGG	2	6	217143	217148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406309
4520	NC_002944	CGC	2	6	217226	217231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406309
4521	NC_002944	GCG	2	6	217280	217285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406309
4522	NC_002944	ACG	2	6	217299	217304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_002944	CTG	2	6	217356	217361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4524	NC_002944	ATC	2	6	217368	217373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406310
4525	NC_002944	GGA	2	6	217418	217423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406310
4526	NC_002944	CGA	2	6	217426	217431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4527	NC_002944	CCA	2	6	217453	217458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406310
4528	NC_002944	GGC	2	6	217537	217542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406310
4529	NC_002944	GGT	2	6	217562	217567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406310
4530	NC_002944	GCC	2	6	217648	217653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406310
4531	NC_002944	TCG	2	6	217657	217662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4532	NC_002944	CGA	2	6	217667	217672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4533	NC_002944	TCG	2	6	217684	217689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4534	NC_002944	CGG	2	6	217721	217726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406310
4535	NC_002944	CAC	2	6	217745	217750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406310
4536	NC_002944	GCG	2	6	217774	217779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406310
4537	NC_002944	CCG	2	6	217849	217854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406310
4538	NC_002944	TGG	2	6	217894	217899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406310
4539	NC_002944	ACC	2	6	217954	217959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406310
4540	NC_002944	CGG	3	9	217969	217977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406310
4541	NC_002944	CGG	2	6	218024	218029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406310
4542	NC_002944	CGG	2	6	218033	218038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406310
4543	NC_002944	GAC	2	6	218103	218108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4544	NC_002944	CGG	2	6	218180	218185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406310
4545	NC_002944	CAT	2	6	218222	218227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406310
4546	NC_002944	GTC	2	6	218235	218240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4547	NC_002944	TGC	2	6	218338	218343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4548	NC_002944	GTG	2	6	218372	218377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406310
4549	NC_002944	GAG	2	6	218406	218411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406310
4550	NC_002944	GAC	2	6	218445	218450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4551	NC_002944	GAC	2	6	218541	218546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4552	NC_002944	TGG	2	6	218587	218592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406310
4553	NC_002944	CGC	2	6	218594	218599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406310
4554	NC_002944	CGA	2	6	218711	218716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4555	NC_002944	TCT	2	6	218740	218745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406310
4556	NC_002944	GGT	2	6	218804	218809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406310
4557	NC_002944	CGG	2	6	218815	218820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406310
4558	NC_002944	GCC	3	9	218831	218839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406310
4559	NC_002944	GCC	2	6	218864	218869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406310
4560	NC_002944	GGT	2	6	218986	218991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406310
4561	NC_002944	GAC	2	6	219023	219028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4562	NC_002944	TGT	2	6	219085	219090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406310
4563	NC_002944	CGA	2	6	219131	219136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4564	NC_002944	TGC	2	6	219202	219207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406310
4565	NC_002944	CTG	2	6	219233	219238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_002944	TCG	2	6	219269	219274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406311
4567	NC_002944	GGC	2	6	219282	219287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406311
4568	NC_002944	GGC	3	9	219363	219371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406311
4569	NC_002944	TCG	2	6	219437	219442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406311
4570	NC_002944	GCT	2	6	219448	219453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406311
4571	NC_002944	CGT	3	9	219456	219464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406311
4572	NC_002944	GCG	2	6	219477	219482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406311
4573	NC_002944	CAT	2	6	219493	219498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406311
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4581	NC_002944	GAA	2	6	219845	219850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406312
4582	NC_002944	GGC	2	6	219875	219880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406312
4583	NC_002944	GGC	2	6	219885	219890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406312
4584	NC_002944	GTG	2	6	219942	219947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406312
4585	NC_002944	GCC	2	6	219957	219962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406312
4586	NC_002944	TCG	2	6	219963	219968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406312
4587	NC_002944	ACG	2	6	219982	219987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406312
4588	NC_002944	CCA	2	6	220018	220023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406312
4589	NC_002944	GTG	2	6	220050	220055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406312
4590	NC_002944	TGC	2	6	220084	220089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406312
4591	NC_002944	GGC	3	9	220091	220099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406312
4592	NC_002944	TGG	2	6	220116	220121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406312
4593	NC_002944	GGC	2	6	220136	220141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406312
4594	NC_002944	GTC	2	6	220223	220228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406312
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4599	NC_002944	ATG	2	6	220299	220304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406312
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4601	NC_002944	TGG	2	6	220450	220455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406312
4602	NC_002944	GTG	2	6	220509	220514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406312
4603	NC_002944	CGG	2	6	220565	220570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406312
4604	NC_002944	TGC	2	6	220597	220602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406312
4605	NC_002944	GCC	2	6	220653	220658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406312
4606	NC_002944	TGA	2	6	220721	220726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406313
4607	NC_002944	GGC	2	6	220727	220732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406313
4608	NC_002944	ACG	2	6	220756	220761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406313
4609	NC_002944	GGT	2	6	220794	220799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406313
4610	NC_002944	GGC	2	6	220819	220824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406313
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4612	NC_002944	CGA	2	6	220845	220850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406313
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4618	NC_002944	CCG	2	6	221117	221122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406313
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4620	NC_002944	TGG	2	6	221215	221220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406313
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4737	NC_002944	GGC	2	6	226353	226358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4739	NC_002944	GCA	2	6	226766	226771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406317
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4742	NC_002944	GCC	2	6	226965	226970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406317
4743	NC_002944	GCC	2	6	227069	227074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406317
4744	NC_002944	CGA	2	6	227081	227086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406317
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4771	NC_002944	AAG	2	6	228506	228511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4772	NC_002944	CGA	2	6	228529	228534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406318
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4981	NC_002944	AGC	2	6	238251	238256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406322
4982	NC_002944	GGT	2	6	238280	238285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406322
4983	NC_002944	GCC	2	6	238307	238312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406322
4984	NC_002944	CGG	2	6	238393	238398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406322
4985	NC_002944	GGC	2	6	238406	238411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406322
4986	NC_002944	GCC	3	9	238430	238438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406322
4987	NC_002944	CGA	2	6	238508	238513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406322
4988	NC_002944	CGC	2	6	238523	238528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406322
4989	NC_002944	CTG	2	6	238550	238555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406322
4990	NC_002944	CGG	2	6	238592	238597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406322
4991	NC_002944	CAC	2	6	238601	238606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406322
4992	NC_002944	CTC	2	6	238667	238672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406322
4993	NC_002944	GCC	2	6	238691	238696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406322
4994	NC_002944	TCG	2	6	238743	238748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406322
4995	NC_002944	GTA	2	6	238757	238762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406322
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4999	NC_002944	CCA	2	6	238965	238970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406323
5000	NC_002944	GTC	2	6	239068	239073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406323

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