MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002944	CGG	2	6	193018	193023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_002944	ACG	2	6	193048	193053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_002944	CCG	2	6	193080	193085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_002944	GGC	3	9	193132	193140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406285
4005	NC_002944	GCA	2	6	193251	193256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406285
4006	NC_002944	GAT	2	6	193261	193266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406285
4007	NC_002944	CTG	2	6	193285	193290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406285
4008	NC_002944	GGC	3	9	193372	193380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406285
4009	NC_002944	CGT	2	6	193419	193424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406285
4010	NC_002944	CGG	2	6	193431	193436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406285
4011	NC_002944	CCG	2	6	193460	193465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406285
4012	NC_002944	TTC	2	6	193478	193483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406285
4013	NC_002944	GCC	2	6	193507	193512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406285
4014	NC_002944	CGT	2	6	193596	193601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406285
4015	NC_002944	GTG	2	6	193624	193629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406285
4016	NC_002944	TTC	2	6	193732	193737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_002944	GTC	2	6	193742	193747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_002944	CGG	2	6	193776	193781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_002944	CAG	2	6	193913	193918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406286
4020	NC_002944	GCC	2	6	193982	193987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406286
4021	NC_002944	GCG	2	6	194198	194203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_002944	CGG	2	6	194222	194227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_002944	GCC	2	6	194326	194331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_002944	GCG	2	6	194404	194409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_002944	CGG	2	6	194412	194417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_002944	GCG	2	6	194432	194437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_002944	TCG	2	6	194439	194444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_002944	GCG	2	6	194445	194450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_002944	GTG	2	6	194523	194528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406287
4030	NC_002944	CGC	3	9	194612	194620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406287
4031	NC_002944	GCC	2	6	194625	194630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406287
4032	NC_002944	CCG	3	9	194668	194676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406287
4033	NC_002944	CGT	2	6	194686	194691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406287
4034	NC_002944	GCC	2	6	194754	194759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406287
4035	NC_002944	CCG	2	6	194791	194796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406287
4036	NC_002944	CAC	2	6	194811	194816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406287
4037	NC_002944	TCG	2	6	194822	194827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406287
4038	NC_002944	CGC	2	6	194847	194852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406287
4039	NC_002944	CGT	2	6	194862	194867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406287
4040	NC_002944	CTG	3	9	194875	194883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406287
4041	NC_002944	GAT	2	6	195006	195011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406287
4042	NC_002944	CAC	2	6	195037	195042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406287
4043	NC_002944	GTG	2	6	195088	195093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406287
4044	NC_002944	CTG	2	6	195106	195111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406287
4045	NC_002944	CTG	2	6	195142	195147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406287
4046	NC_002944	GAG	2	6	195148	195153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406287
4047	NC_002944	ACC	2	6	195158	195163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406287
4048	NC_002944	GTG	2	6	195186	195191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406287
4049	NC_002944	CAA	2	6	195270	195275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406287
4050	NC_002944	CGC	3	9	195306	195314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406287
4051	NC_002944	CGA	2	6	195399	195404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406287
4052	NC_002944	CCG	2	6	195415	195420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406287
4053	NC_002944	GCA	2	6	195460	195465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406287
4054	NC_002944	CGA	2	6	195484	195489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406288
4055	NC_002944	GCC	2	6	195536	195541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406288
4056	NC_002944	GCC	2	6	195560	195565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406288
4057	NC_002944	AGG	2	6	195582	195587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406288
4058	NC_002944	CCG	2	6	195652	195657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406288
4059	NC_002944	GCT	2	6	195892	195897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406288
4060	NC_002944	CTG	2	6	195902	195907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406288
4061	NC_002944	CGC	2	6	195922	195927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406288
4062	NC_002944	CCG	2	6	195936	195941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406288
4063	NC_002944	GTG	2	6	195956	195961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406288
4064	NC_002944	CGG	2	6	195995	196000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406288
4065	NC_002944	TGC	2	6	196011	196016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406288
4066	NC_002944	TGC	2	6	196023	196028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406288
4067	NC_002944	CGG	2	6	196068	196073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406288
4068	NC_002944	CTG	2	6	196165	196170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406288
4069	NC_002944	CGA	2	6	196177	196182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406288
4070	NC_002944	GCT	2	6	196299	196304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406289
4071	NC_002944	TGC	2	6	196314	196319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406289
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4073	NC_002944	GCC	2	6	196364	196369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406289
4074	NC_002944	CAC	3	9	196384	196392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406289
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4076	NC_002944	GCA	2	6	196587	196592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406289
4077	NC_002944	CGA	2	6	196599	196604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406289
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4080	NC_002944	CAG	2	6	196858	196863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406289
4081	NC_002944	TCG	2	6	196953	196958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406289
4082	NC_002944	CAG	2	6	196993	196998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406289
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4084	NC_002944	GCT	2	6	197043	197048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406289
4085	NC_002944	TGC	2	6	197051	197056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406289
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4087	NC_002944	CGA	2	6	197088	197093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406289
4088	NC_002944	TGC	2	6	197103	197108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406289
4089	NC_002944	GCC	3	9	197197	197205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406289
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4091	NC_002944	CAC	2	6	197218	197223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406289
4092	NC_002944	CAG	2	6	197224	197229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406289
4093	NC_002944	GCG	2	6	197376	197381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406289
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4095	NC_002944	CGG	2	6	197440	197445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406289
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4097	NC_002944	GAC	2	6	197531	197536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4103	NC_002944	ACC	2	6	197893	197898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406290
4104	NC_002944	GCC	2	6	197915	197920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406290
4105	NC_002944	GCA	2	6	197921	197926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406290
4106	NC_002944	CAG	2	6	197973	197978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406290
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4108	NC_002944	GCC	2	6	198050	198055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406290
4109	NC_002944	AGC	2	6	198121	198126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406290
4110	NC_002944	TCG	2	6	198244	198249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406290
4111	NC_002944	CAG	2	6	198261	198266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406290
4112	NC_002944	CGC	2	6	198269	198274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406290
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4114	NC_002944	CGC	2	6	198413	198418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_002944	GGC	2	6	198476	198481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406291
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4117	NC_002944	GCC	2	6	198591	198596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406291
4118	NC_002944	CGC	2	6	198673	198678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406291
4119	NC_002944	GAC	2	6	198695	198700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406291
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4121	NC_002944	GCC	3	9	198780	198788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406291
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