MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002944	CGA	2	6	284410	284415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406362
6002	NC_002944	CAT	2	6	284435	284440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406362
6003	NC_002944	CCG	2	6	284470	284475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406362
6004	NC_002944	GCC	3	9	284487	284495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406362
6005	NC_002944	CCT	2	6	284578	284583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406362
6006	NC_002944	TTG	2	6	284685	284690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406362
6007	NC_002944	CGA	2	6	284707	284712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406362
6008	NC_002944	CGG	2	6	284726	284731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406362
6009	NC_002944	CGG	2	6	284764	284769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406362
6010	NC_002944	CCT	2	6	284785	284790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406362
6011	NC_002944	GTC	2	6	284810	284815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406362
6012	NC_002944	CCG	2	6	284830	284835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406362
6013	NC_002944	CGT	2	6	284924	284929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406363
6014	NC_002944	AGC	2	6	285019	285024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406363
6015	NC_002944	GGC	2	6	285126	285131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406363
6016	NC_002944	TCG	2	6	285154	285159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406363
6017	NC_002944	CGC	2	6	285177	285182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406363
6018	NC_002944	GCA	2	6	285185	285190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406363
6019	NC_002944	CGA	2	6	285230	285235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406363
6020	NC_002944	CAG	2	6	285261	285266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406363
6021	NC_002944	CAT	2	6	285303	285308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406363
6022	NC_002944	GCC	2	6	285356	285361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406363
6023	NC_002944	AAG	2	6	285388	285393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406363
6024	NC_002944	CGG	2	6	285422	285427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406363
6025	NC_002944	GGT	3	9	285491	285499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406363
6026	NC_002944	CGA	3	9	285587	285595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406363
6027	NC_002944	GAA	2	6	285597	285602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406363
6028	NC_002944	GGA	2	6	285621	285626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406363
6029	NC_002944	GTG	2	6	285679	285684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406363
6030	NC_002944	CAG	2	6	285750	285755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406363
6031	NC_002944	GAT	2	6	285801	285806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406363
6032	NC_002944	CGA	2	6	285983	285988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406363
6033	NC_002944	TCG	2	6	286000	286005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406363
6034	NC_002944	TCG	2	6	286057	286062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406363
6035	NC_002944	CTC	2	6	286139	286144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_002944	GGT	2	6	286188	286193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406364
6037	NC_002944	GCG	2	6	286225	286230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406364
6038	NC_002944	CGA	2	6	286232	286237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406364
6039	NC_002944	CCG	2	6	286364	286369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406364
6040	NC_002944	CGG	2	6	286463	286468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406364
6041	NC_002944	TGA	2	6	286478	286483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406364
6042	NC_002944	CCA	2	6	286502	286507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406364
6043	NC_002944	GTT	2	6	286626	286631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406364
6044	NC_002944	TGT	2	6	286753	286758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406364
6045	NC_002944	CAC	2	6	286797	286802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406364
6046	NC_002944	CGC	2	6	286808	286813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406364
6047	NC_002944	ACC	2	6	286873	286878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406364
6048	NC_002944	GCC	2	6	286946	286951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406365
6049	NC_002944	ATC	2	6	286970	286975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406365
6050	NC_002944	CGC	2	6	287038	287043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406365
6051	NC_002944	TCT	2	6	287049	287054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406365
6052	NC_002944	GTA	2	6	287092	287097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406365
6053	NC_002944	TCC	2	6	287192	287197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406365
6054	NC_002944	CGT	2	6	287211	287216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406365
6055	NC_002944	CAG	2	6	287221	287226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406365
6056	NC_002944	CAC	2	6	287228	287233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406365
6057	NC_002944	GTC	2	6	287261	287266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406365
6058	NC_002944	GGC	2	6	287284	287289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406365
6059	NC_002944	ATG	2	6	287348	287353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406365
6060	NC_002944	GCG	2	6	287380	287385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406365
6061	NC_002944	GGC	2	6	287487	287492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406365
6062	NC_002944	GGC	2	6	287539	287544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406365
6063	NC_002944	CCG	2	6	287612	287617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406365
6064	NC_002944	CGC	2	6	287641	287646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406365
6065	NC_002944	GTC	2	6	287683	287688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406365
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6068	NC_002944	GCA	2	6	287802	287807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406365
6069	NC_002944	GCC	2	6	287854	287859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406365
6070	NC_002944	CGC	2	6	287886	287891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406365
6071	NC_002944	CGT	2	6	287901	287906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406365
6072	NC_002944	CCG	2	6	288017	288022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_002944	CGT	2	6	288087	288092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406366
6074	NC_002944	GTC	2	6	288133	288138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406366
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6080	NC_002944	TGG	2	6	288381	288386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406366
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6082	NC_002944	GCG	2	6	288470	288475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406366
6083	NC_002944	CGG	2	6	288480	288485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406366
6084	NC_002944	CGA	2	6	288522	288527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406366
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6086	NC_002944	TCG	2	6	288611	288616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406366
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6088	NC_002944	GGC	2	6	288682	288687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406366
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6091	NC_002944	ACG	2	6	288776	288781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_002944	GAA	2	6	288783	288788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6107	NC_002944	CTG	2	6	289373	289378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406367
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6111	NC_002944	ACG	3	9	289573	289581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406368
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6118	NC_002944	GCC	2	6	289780	289785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406368
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