MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002944	GTA	2	6	149129	149134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_002944	CGC	2	6	149180	149185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_002944	ACT	2	6	149267	149272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406241
3004	NC_002944	ATG	2	6	149290	149295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406241
3005	NC_002944	CTG	2	6	149332	149337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406241
3006	NC_002944	TCA	2	6	149363	149368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406241
3007	NC_002944	CGG	2	6	149373	149378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406241
3008	NC_002944	CAC	2	6	149400	149405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406241
3009	NC_002944	AAG	2	6	149416	149421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406241
3010	NC_002944	ACG	2	6	149426	149431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406241
3011	NC_002944	CGG	2	6	149572	149577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_002944	GGT	2	6	149642	149647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406242
3013	NC_002944	TGC	2	6	149716	149721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3014	NC_002944	GGT	2	6	149753	149758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406242
3015	NC_002944	GCT	2	6	149762	149767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3016	NC_002944	GCT	2	6	149795	149800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3017	NC_002944	GTG	2	6	149889	149894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406242
3018	NC_002944	GCT	2	6	149909	149914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3019	NC_002944	GGC	2	6	149930	149935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406242
3020	NC_002944	CGT	2	6	150008	150013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3021	NC_002944	CGG	2	6	150056	150061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406242
3022	NC_002944	CGA	2	6	150122	150127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3023	NC_002944	GCA	2	6	150188	150193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3024	NC_002944	ACG	2	6	150226	150231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3025	NC_002944	GGA	2	6	150233	150238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406242
3026	NC_002944	TGC	2	6	150244	150249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3027	NC_002944	GCG	2	6	150274	150279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406242
3028	NC_002944	AGG	2	6	150280	150285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406242
3029	NC_002944	GCG	2	6	150286	150291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406242
3030	NC_002944	ACG	2	6	150301	150306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3031	NC_002944	CGC	2	6	150347	150352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406242
3032	NC_002944	GTT	2	6	150365	150370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406242
3033	NC_002944	GGA	2	6	150371	150376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406242
3034	NC_002944	AGG	2	6	150412	150417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406242
3035	NC_002944	CGT	2	6	150424	150429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3036	NC_002944	GGT	2	6	150457	150462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406243
3037	NC_002944	CGC	2	6	150463	150468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406243
3038	NC_002944	AGC	2	6	150497	150502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3039	NC_002944	CAC	2	6	150505	150510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406243
3040	NC_002944	GAC	2	6	150511	150516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3041	NC_002944	TAC	2	6	150542	150547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406243
3042	NC_002944	CAG	2	6	150575	150580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3043	NC_002944	CTG	2	6	150581	150586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3044	NC_002944	GAA	2	6	150589	150594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406243
3045	NC_002944	GCA	2	6	150627	150632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3046	NC_002944	CGG	2	6	150682	150687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406243
3047	NC_002944	CTG	2	6	150698	150703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3048	NC_002944	TGG	2	6	150768	150773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406243
3049	NC_002944	AAG	2	6	150818	150823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406243
3050	NC_002944	GCG	2	6	150951	150956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406243
3051	NC_002944	CAG	3	9	151004	151012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3052	NC_002944	CAT	2	6	151021	151026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406243
3053	NC_002944	GGT	2	6	151052	151057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406243
3054	NC_002944	TCA	2	6	151080	151085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406243
3055	NC_002944	TGG	2	6	151110	151115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406243
3056	NC_002944	GAG	2	6	151127	151132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406243
3057	NC_002944	GGC	2	6	151168	151173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406243
3058	NC_002944	AGG	2	6	151215	151220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406243
3059	NC_002944	CGA	2	6	151327	151332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3060	NC_002944	CGC	2	6	151394	151399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_002944	CGG	2	6	151405	151410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_002944	GCT	3	9	151446	151454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_002944	CCG	2	6	151475	151480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406244
3064	NC_002944	GTG	2	6	151525	151530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406244
3065	NC_002944	GGC	2	6	151620	151625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406244
3066	NC_002944	TCG	2	6	151649	151654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3067	NC_002944	GCT	2	6	151677	151682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3068	NC_002944	TGC	2	6	151736	151741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3069	NC_002944	CGA	2	6	151758	151763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3070	NC_002944	TGG	2	6	151781	151786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406244
3071	NC_002944	ACG	3	9	151813	151821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3072	NC_002944	TGC	3	9	151907	151915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3073	NC_002944	CCG	2	6	151916	151921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406244
3074	NC_002944	GTG	2	6	151978	151983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406244
3075	NC_002944	CCT	2	6	152000	152005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406244
3076	NC_002944	CTG	2	6	152023	152028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3077	NC_002944	TGC	2	6	152063	152068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3078	NC_002944	TGC	2	6	152078	152083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3079	NC_002944	CGC	2	6	152109	152114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406244
3080	NC_002944	CGG	2	6	152143	152148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406244
3081	NC_002944	AGC	3	9	152161	152169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3082	NC_002944	GTC	2	6	152181	152186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3083	NC_002944	CAG	2	6	152205	152210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3084	NC_002944	AGC	2	6	152218	152223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3085	NC_002944	TCA	2	6	152234	152239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406245
3086	NC_002944	CGA	2	6	152249	152254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3087	NC_002944	CGC	2	6	152272	152277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406245
3088	NC_002944	CCA	2	6	152351	152356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406245
3089	NC_002944	CCT	2	6	152396	152401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406245
3090	NC_002944	GCC	2	6	152424	152429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406245
3091	NC_002944	CGC	2	6	152466	152471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406245
3092	NC_002944	TGC	2	6	152615	152620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3093	NC_002944	ACC	2	6	152638	152643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406245
3094	NC_002944	CGC	2	6	152645	152650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406245
3095	NC_002944	GAC	2	6	152658	152663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3096	NC_002944	GCG	2	6	152664	152669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406245
3097	NC_002944	GCC	2	6	152706	152711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406245
3098	NC_002944	CCG	2	6	152834	152839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406245
3099	NC_002944	CGG	2	6	152846	152851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406245
3100	NC_002944	CAG	2	6	152871	152876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3101	NC_002944	GGC	2	6	152922	152927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406245
3102	NC_002944	CGG	2	6	152987	152992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406245
3103	NC_002944	CGT	3	9	153032	153040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3104	NC_002944	GGC	2	6	153063	153068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406245
3105	NC_002944	ATC	2	6	153103	153108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406245
3106	NC_002944	AGA	3	9	153109	153117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406246
3107	NC_002944	GCG	2	6	153127	153132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406246
3108	NC_002944	GTG	2	6	153222	153227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406246
3109	NC_002944	CCG	2	6	153228	153233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406246
3110	NC_002944	AGC	2	6	153234	153239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406246
3111	NC_002944	CGG	2	6	153241	153246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406246
3112	NC_002944	GCA	2	6	153337	153342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406247
3113	NC_002944	TCG	2	6	153372	153377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406247
3114	NC_002944	GGC	2	6	153392	153397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406247
3115	NC_002944	GCC	2	6	153402	153407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406247
3116	NC_002944	TCG	2	6	153435	153440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406247
3117	NC_002944	CAG	2	6	153476	153481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406247
3118	NC_002944	GCA	2	6	153505	153510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406247
3119	NC_002944	GCA	2	6	153556	153561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406247
3120	NC_002944	CGG	2	6	153577	153582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406247
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3240	NC_002944	TTC	2	6	159349	159354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406254
3241	NC_002944	CGG	2	6	159434	159439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406254
3242	NC_002944	GGC	2	6	159472	159477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406254
3243	NC_002944	CGC	2	6	159491	159496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406254
3244	NC_002944	CCA	2	6	159576	159581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406254
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3249	NC_002944	GTC	2	6	160057	160062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406255
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3272	NC_002944	GAT	2	6	161016	161021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406256
3273	NC_002944	GCG	2	6	161062	161067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406256
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3281	NC_002944	GCC	2	6	161509	161514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406257
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3362	NC_002944	TGA	2	6	165310	165315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406261
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3481	NC_002944	CGT	2	6	170127	170132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406264
3482	NC_002944	ACC	2	6	170158	170163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406264
3483	NC_002944	GTG	2	6	170170	170175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406264
3484	NC_002944	CAC	2	6	170265	170270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406264
3485	NC_002944	ATC	2	6	170305	170310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406264
3486	NC_002944	GGT	2	6	170328	170333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406264
3487	NC_002944	GCG	2	6	170344	170349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406264
3488	NC_002944	GAA	2	6	170352	170357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406264
3489	NC_002944	GCC	2	6	170524	170529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
3490	NC_002944	TCG	2	6	170557	170562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3491	NC_002944	GCG	2	6	170617	170622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406265
3492	NC_002944	CCA	2	6	170656	170661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406265
3493	NC_002944	ACC	2	6	170682	170687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406265
3494	NC_002944	GCC	2	6	170706	170711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
3495	NC_002944	GTC	2	6	170777	170782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
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