MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002944	GTA	2	6	239238	239243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406323
5002	NC_002944	CGT	2	6	239250	239255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406323
5003	NC_002944	CGT	2	6	239355	239360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406323
5004	NC_002944	AGC	2	6	239375	239380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406323
5005	NC_002944	CGG	2	6	239391	239396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406323
5006	NC_002944	GCA	2	6	239523	239528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406323
5007	NC_002944	CGG	2	6	239556	239561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406323
5008	NC_002944	CAG	2	6	239581	239586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406323
5009	NC_002944	GCG	2	6	239607	239612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406323
5010	NC_002944	CGA	2	6	239775	239780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406323
5011	NC_002944	CAC	2	6	239785	239790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406323
5012	NC_002944	CCG	2	6	239815	239820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406323
5013	NC_002944	CAC	2	6	239845	239850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406323
5014	NC_002944	TCG	2	6	239918	239923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406323
5015	NC_002944	TCA	2	6	239925	239930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406323
5016	NC_002944	GGC	2	6	240093	240098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406324
5017	NC_002944	CCG	2	6	240115	240120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406324
5018	NC_002944	ACC	2	6	240218	240223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406324
5019	NC_002944	TGC	2	6	240246	240251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406324
5020	NC_002944	TGC	2	6	240273	240278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406324
5021	NC_002944	TCA	2	6	240291	240296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406324
5022	NC_002944	CGG	2	6	240313	240318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406324
5023	NC_002944	CGA	2	6	240355	240360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406324
5024	NC_002944	CCG	2	6	240366	240371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406324
5025	NC_002944	CGG	2	6	240386	240391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406324
5026	NC_002944	CGA	2	6	240406	240411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406324
5027	NC_002944	CGG	2	6	240414	240419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406324
5028	NC_002944	GCT	2	6	240421	240426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406324
5029	NC_002944	GGT	2	6	240448	240453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406324
5030	NC_002944	CGA	2	6	240522	240527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406324
5031	NC_002944	CCG	2	6	240529	240534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406324
5032	NC_002944	CCG	2	6	240561	240566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406324
5033	NC_002944	GGC	2	6	240616	240621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406324
5034	NC_002944	GCG	2	6	240626	240631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406324
5035	NC_002944	CGC	2	6	240700	240705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406324
5036	NC_002944	CTA	2	6	240727	240732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406324
5037	NC_002944	CGC	2	6	240751	240756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406324
5038	NC_002944	CAC	2	6	240778	240783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406324
5039	NC_002944	AGG	2	6	240789	240794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406324
5040	NC_002944	CAC	2	6	240919	240924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406325
5041	NC_002944	GAT	2	6	240979	240984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406325
5042	NC_002944	GGT	2	6	240997	241002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406325
5043	NC_002944	ACG	2	6	241107	241112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406325
5044	NC_002944	TTC	2	6	241120	241125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406325
5045	NC_002944	CCA	2	6	241167	241172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406325
5046	NC_002944	GAC	2	6	241210	241215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406325
5047	NC_002944	AGT	2	6	241290	241295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406325
5048	NC_002944	ACG	2	6	241304	241309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406325
5049	NC_002944	GTG	2	6	241310	241315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406325
5050	NC_002944	CGG	2	6	241326	241331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406325
5051	NC_002944	GGA	2	6	241362	241367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406325
5052	NC_002944	GGC	2	6	241381	241386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406325
5053	NC_002944	CGG	2	6	241453	241458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_002944	AAT	2	6	241544	241549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_002944	ACC	2	6	241593	241598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
5056	NC_002944	GCA	3	9	241728	241736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5057	NC_002944	CAG	2	6	241750	241755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5058	NC_002944	TCC	2	6	241772	241777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406326
5059	NC_002944	TCT	2	6	241794	241799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406326
5060	NC_002944	GCA	2	6	241857	241862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5061	NC_002944	GCT	2	6	241866	241871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5062	NC_002944	CGG	2	6	241963	241968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
5063	NC_002944	TCC	2	6	241985	241990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406326
5064	NC_002944	CCA	2	6	242013	242018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
5065	NC_002944	GCT	2	6	242085	242090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5066	NC_002944	CCG	2	6	242138	242143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
5067	NC_002944	CAC	2	6	242167	242172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
5068	NC_002944	GTG	3	9	242188	242196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
5069	NC_002944	CGG	3	9	242223	242231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
5070	NC_002944	CAC	3	9	242233	242241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
5071	NC_002944	CTG	2	6	242299	242304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5072	NC_002944	GGT	2	6	242314	242319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
5073	NC_002944	GCG	2	6	242345	242350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
5074	NC_002944	TGC	2	6	242513	242518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5075	NC_002944	CGC	2	6	242547	242552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
5076	NC_002944	GCG	2	6	242556	242561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
5077	NC_002944	CGA	2	6	242589	242594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5078	NC_002944	CGT	2	6	242598	242603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5079	NC_002944	GCC	2	6	242617	242622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
5080	NC_002944	CCA	2	6	242685	242690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
5081	NC_002944	CGA	2	6	242823	242828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5082	NC_002944	CCG	2	6	242861	242866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
5083	NC_002944	ACC	2	6	242913	242918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
5084	NC_002944	TGG	3	9	242925	242933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
5085	NC_002944	CAT	2	6	242947	242952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406326
5086	NC_002944	CAG	2	6	242956	242961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5087	NC_002944	GCA	2	6	242997	243002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5088	NC_002944	CCG	2	6	243003	243008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
5089	NC_002944	GGT	2	6	243022	243027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
5090	NC_002944	CGC	2	6	243040	243045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
5091	NC_002944	GTG	2	6	243070	243075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
5092	NC_002944	TGG	2	6	243084	243089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
5093	NC_002944	GCC	2	6	243135	243140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
5094	NC_002944	ATG	2	6	243185	243190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406326
5095	NC_002944	CCG	2	6	243235	243240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
5096	NC_002944	GTA	3	9	243274	243282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406326
5097	NC_002944	TGG	2	6	243336	243341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
5098	NC_002944	ACC	2	6	243377	243382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
5099	NC_002944	CGG	2	6	243399	243404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
5100	NC_002944	CCA	2	6	243417	243422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
5101	NC_002944	CAC	2	6	243436	243441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
5102	NC_002944	CGG	2	6	243449	243454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
5103	NC_002944	ACC	2	6	243478	243483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406326
5104	NC_002944	GGC	2	6	243538	243543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
5105	NC_002944	TGA	2	6	243546	243551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406326
5106	NC_002944	GAT	2	6	243631	243636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406326
5107	NC_002944	CGC	2	6	243694	243699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
5108	NC_002944	GGC	2	6	243718	243723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406326
5109	NC_002944	CCG	2	6	243726	243731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
5110	NC_002944	GCA	2	6	243744	243749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5111	NC_002944	TCA	2	6	243834	243839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406326
5112	NC_002944	CAG	2	6	243844	243849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5113	NC_002944	GTA	2	6	243853	243858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406326
5114	NC_002944	AGT	2	6	243897	243902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406326
5115	NC_002944	CGT	2	6	243954	243959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5116	NC_002944	CGA	2	6	243961	243966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5117	NC_002944	GCC	2	6	244086	244091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
5118	NC_002944	CGA	2	6	244107	244112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
5119	NC_002944	TGG	2	6	244113	244118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
5120	NC_002944	CGC	2	6	244138	244143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
5121	NC_002944	GTG	2	6	244163	244168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406326
5122	NC_002944	CGA	2	6	244242	244247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406326
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5124	NC_002944	CCG	2	6	244296	244301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406326
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5149	NC_002944	TGC	2	6	245330	245335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406327
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5198	NC_002944	GTA	2	6	247167	247172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406327
5199	NC_002944	CGA	2	6	247175	247180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406327
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5221	NC_002944	CGG	2	6	247835	247840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406327
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5223	NC_002944	CAG	3	9	248004	248012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406327
5224	NC_002944	CGG	2	6	248030	248035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406327
5225	NC_002944	CGT	2	6	248072	248077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406327
5226	NC_002944	CCG	2	6	248149	248154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5227	NC_002944	CGC	2	6	248214	248219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5228	NC_002944	CTG	2	6	248240	248245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5229	NC_002944	AGG	2	6	248246	248251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_002944	CCG	2	6	248311	248316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406328
5231	NC_002944	GCG	2	6	248317	248322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406328
5232	NC_002944	TGC	2	6	248368	248373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406328
5233	NC_002944	GCG	2	6	248430	248435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406328
5234	NC_002944	CGG	2	6	248443	248448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406328
5235	NC_002944	GCT	2	6	248489	248494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406328
5236	NC_002944	GCC	2	6	248619	248624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406328
5237	NC_002944	GAG	2	6	248640	248645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406328
5238	NC_002944	GGC	3	9	248660	248668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406328
5239	NC_002944	CGA	2	6	248696	248701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406328
5240	NC_002944	TCG	2	6	248719	248724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406328
5241	NC_002944	CTG	2	6	248739	248744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406328
5242	NC_002944	GAG	2	6	248748	248753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406328
5243	NC_002944	CTA	2	6	248888	248893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406328
5244	NC_002944	CGG	2	6	248931	248936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406328
5245	NC_002944	GCA	2	6	248996	249001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406328
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5260	NC_002944	CCG	2	6	249733	249738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406329
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5262	NC_002944	GCG	2	6	249797	249802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406329
5263	NC_002944	TCG	2	6	249817	249822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406329
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5267	NC_002944	CGC	2	6	250375	250380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5268	NC_002944	CTT	2	6	250384	250389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5269	NC_002944	GCG	2	6	250508	250513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406330
5270	NC_002944	CAG	3	9	250548	250556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406330
5271	NC_002944	GTC	2	6	250623	250628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406330
5272	NC_002944	TGG	3	9	250646	250654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406330
5273	NC_002944	CAG	2	6	250662	250667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406330
5274	NC_002944	GCC	3	9	250686	250694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406330
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5357	NC_002944	GCA	2	6	254000	254005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406331
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5362	NC_002944	CGT	2	6	254195	254200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406331
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5481	NC_002944	CGT	3	9	260034	260042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406336
5482	NC_002944	TCA	2	6	260141	260146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406336
5483	NC_002944	CTC	2	6	260182	260187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406336
5484	NC_002944	CGC	2	6	260191	260196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406336
5485	NC_002944	GCC	2	6	260366	260371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406337
5486	NC_002944	AGC	2	6	260372	260377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406337
5487	NC_002944	CCG	2	6	260385	260390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406337
5488	NC_002944	CAG	2	6	260437	260442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406337
5489	NC_002944	CAA	2	6	260470	260475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406337
5490	NC_002944	CGA	2	6	260487	260492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406337
5491	NC_002944	CTG	2	6	260515	260520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406337
5492	NC_002944	GTC	2	6	260530	260535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406337
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