MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002944	TCG	2	6	23445	23450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119
502	NC_002944	ACG	2	6	23517	23522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406119
503	NC_002944	GCC	3	9	23537	23545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406119
504	NC_002944	GGC	2	6	23573	23578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406119
505	NC_002944	TCG	2	6	23619	23624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119
506	NC_002944	CAG	2	6	23654	23659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406119
507	NC_002944	CCT	2	6	23761	23766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406119
508	NC_002944	TCG	2	6	23784	23789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119
509	NC_002944	GTC	2	6	23810	23815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119
510	NC_002944	GCA	2	6	23845	23850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406119
511	NC_002944	GTG	2	6	23919	23924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406119
512	NC_002944	GCG	2	6	23961	23966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406119
513	NC_002944	TCG	2	6	23994	23999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119
514	NC_002944	CAG	2	6	24008	24013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406119
515	NC_002944	CGC	2	6	24016	24021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406119
516	NC_002944	TCG	4	12	24027	24038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119
517	NC_002944	GCG	2	6	24051	24056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406119
518	NC_002944	CGG	2	6	24082	24087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406119
519	NC_002944	GCC	2	6	24092	24097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406119
520	NC_002944	AGC	2	6	24117	24122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406119
521	NC_002944	GTT	2	6	24149	24154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406119
522	NC_002944	CGG	2	6	24228	24233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_002944	CCG	2	6	24240	24245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_002944	GTC	2	6	24447	24452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406120
525	NC_002944	GTC	2	6	24471	24476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406120
526	NC_002944	CCG	2	6	24520	24525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406120
527	NC_002944	CAC	2	6	24543	24548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406120
528	NC_002944	GGC	2	6	24566	24571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406120
529	NC_002944	CAG	2	6	24585	24590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406120
530	NC_002944	TGC	2	6	24593	24598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406120
531	NC_002944	GCA	2	6	24665	24670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406120
532	NC_002944	CGT	2	6	24762	24767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_002944	GAT	2	6	24880	24885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406121
534	NC_002944	GTT	2	6	24946	24951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406121
535	NC_002944	GTG	2	6	24956	24961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406121
536	NC_002944	TGG	2	6	24966	24971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406121
537	NC_002944	CAG	2	6	24985	24990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406121
538	NC_002944	GAT	2	6	25078	25083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406121
539	NC_002944	CGT	2	6	25122	25127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
540	NC_002944	GTG	2	6	25145	25150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406121
541	NC_002944	GCC	2	6	25165	25170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
542	NC_002944	CCG	2	6	25181	25186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
543	NC_002944	GCC	2	6	25189	25194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
544	NC_002944	CGG	2	6	25212	25217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406121
545	NC_002944	GCT	2	6	25251	25256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
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547	NC_002944	GCC	3	9	25312	25320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
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549	NC_002944	GGC	2	6	25389	25394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406121
550	NC_002944	GCC	3	9	25429	25437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
551	NC_002944	GCT	2	6	25458	25463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
552	NC_002944	GCC	2	6	25477	25482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
553	NC_002944	CCG	2	6	25523	25528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
554	NC_002944	GCC	2	6	25540	25545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
555	NC_002944	GCC	2	6	25555	25560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
556	NC_002944	GCC	2	6	25573	25578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
557	NC_002944	CGG	2	6	25621	25626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406121
558	NC_002944	GCC	2	6	25660	25665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
559	NC_002944	TGC	2	6	25706	25711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
560	NC_002944	GCC	2	6	25723	25728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
561	NC_002944	GCC	2	6	25747	25752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
562	NC_002944	CCG	2	6	25769	25774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
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569	NC_002944	TCG	2	6	25979	25984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
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572	NC_002944	GTC	2	6	26089	26094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
573	NC_002944	CAC	2	6	26130	26135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406121
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575	NC_002944	ACC	2	6	26186	26191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406121
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580	NC_002944	GCG	2	6	26698	26703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_002944	GTT	2	6	26742	26747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_002944	CCG	2	6	27202	27207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406122
590	NC_002944	CGC	2	6	27208	27213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406122
591	NC_002944	GCG	2	6	27270	27275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406122
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593	NC_002944	GAC	2	6	27334	27339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406122
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595	NC_002944	ATG	2	6	27436	27441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406122
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598	NC_002944	CCA	2	6	27663	27668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406123
599	NC_002944	GAT	2	6	27684	27689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406123
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610	NC_002944	CGG	2	6	28219	28224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406124
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614	NC_002944	GGC	2	6	28315	28320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406124
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619	NC_002944	CGC	2	6	28605	28610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406124
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621	NC_002944	GAT	2	6	28678	28683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406124
622	NC_002944	GCC	2	6	28820	28825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406124
623	NC_002944	CGA	2	6	28897	28902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406124
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625	NC_002944	TCG	2	6	29030	29035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406124
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