MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002944	GCC	2	6	170948	170953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
3502	NC_002944	CAT	3	9	170960	170968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406265
3503	NC_002944	CGG	2	6	170971	170976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406265
3504	NC_002944	CGC	3	9	171008	171016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
3505	NC_002944	CGT	2	6	171085	171090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3506	NC_002944	GCT	2	6	171143	171148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3507	NC_002944	GAG	2	6	171198	171203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406265
3508	NC_002944	CCA	2	6	171232	171237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406265
3509	NC_002944	AGG	2	6	171265	171270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406265
3510	NC_002944	CGA	2	6	171305	171310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3511	NC_002944	TCG	2	6	171348	171353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3512	NC_002944	CGA	2	6	171365	171370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3513	NC_002944	GAC	2	6	171378	171383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3514	NC_002944	GCC	3	9	171384	171392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
3515	NC_002944	GCT	2	6	171407	171412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3516	NC_002944	GCC	2	6	171421	171426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
3517	NC_002944	GCT	2	6	171428	171433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3518	NC_002944	CGC	2	6	171473	171478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
3519	NC_002944	GGA	2	6	171482	171487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406265
3520	NC_002944	GAT	2	6	171503	171508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406265
3521	NC_002944	TGC	2	6	171553	171558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3522	NC_002944	CCG	2	6	171567	171572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
3523	NC_002944	GAC	2	6	171584	171589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3524	NC_002944	CCG	2	6	171592	171597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
3525	NC_002944	GCT	2	6	171827	171832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3526	NC_002944	TCG	2	6	171979	171984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3527	NC_002944	CGA	2	6	172025	172030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3528	NC_002944	GCT	2	6	172046	172051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3529	NC_002944	ACC	2	6	172062	172067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406265
3530	NC_002944	CGG	2	6	172088	172093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406265
3531	NC_002944	CGT	2	6	172139	172144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
3532	NC_002944	GGT	2	6	172175	172180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406265
3533	NC_002944	ATC	2	6	172227	172232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406265
3534	NC_002944	CCG	3	9	172234	172242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
3535	NC_002944	GGC	2	6	172250	172255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406265
3536	NC_002944	GCC	2	6	172290	172295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
3537	NC_002944	GCG	2	6	172308	172313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_002944	CCG	2	6	172315	172320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_002944	TCG	2	6	172373	172378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406266
3540	NC_002944	GCA	2	6	172452	172457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406266
3541	NC_002944	TCG	2	6	172469	172474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406266
3542	NC_002944	CGA	2	6	172485	172490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406266
3543	NC_002944	CCG	2	6	172507	172512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406266
3544	NC_002944	GCC	2	6	172553	172558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406266
3545	NC_002944	CCA	2	6	172581	172586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406266
3546	NC_002944	GCC	2	6	172594	172599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406266
3547	NC_002944	TGC	2	6	172626	172631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406266
3548	NC_002944	CAT	2	6	172708	172713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406266
3549	NC_002944	GCG	2	6	172787	172792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406267
3550	NC_002944	CGT	2	6	172864	172869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406267
3551	NC_002944	CGA	2	6	172951	172956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406267
3552	NC_002944	GCG	2	6	172974	172979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406267
3553	NC_002944	CGA	2	6	173137	173142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406267
3554	NC_002944	CGC	3	9	173156	173164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406267
3555	NC_002944	TCG	2	6	173224	173229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406267
3556	NC_002944	CGC	2	6	173305	173310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406267
3557	NC_002944	GTC	3	9	173336	173344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406267
3558	NC_002944	CGC	2	6	173383	173388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406267
3559	NC_002944	ACG	2	6	173403	173408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406267
3560	NC_002944	CGG	3	9	173473	173481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406267
3561	NC_002944	CGG	2	6	173526	173531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406267
3562	NC_002944	CGG	2	6	173554	173559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406267
3563	NC_002944	AGC	2	6	173562	173567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406267
3564	NC_002944	GAC	2	6	173609	173614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406267
3565	NC_002944	CTG	2	6	173653	173658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_002944	GCA	2	6	173715	173720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_002944	TCG	2	6	173723	173728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_002944	CGA	2	6	173756	173761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406268
3569	NC_002944	CGT	2	6	173781	173786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406268
3570	NC_002944	AGG	2	6	173857	173862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406268
3571	NC_002944	CCG	2	6	173878	173883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406268
3572	NC_002944	CGA	2	6	173894	173899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406268
3573	NC_002944	GTG	2	6	173919	173924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406268
3574	NC_002944	AGC	2	6	173995	174000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406268
3575	NC_002944	CGC	2	6	174007	174012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406268
3576	NC_002944	CGA	3	9	174041	174049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406268
3577	NC_002944	GCT	2	6	174062	174067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406268
3578	NC_002944	TGC	2	6	174073	174078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406268
3579	NC_002944	TGC	2	6	174112	174117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406268
3580	NC_002944	ACG	2	6	174118	174123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406268
3581	NC_002944	GCC	2	6	174163	174168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406268
3582	NC_002944	GCC	2	6	174181	174186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406268
3583	NC_002944	TCA	2	6	174280	174285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406268
3584	NC_002944	GCC	2	6	174318	174323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406268
3585	NC_002944	CGC	3	9	174376	174384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406268
3586	NC_002944	CCA	2	6	174412	174417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406268
3587	NC_002944	CGG	2	6	174455	174460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406268
3588	NC_002944	TGC	2	6	174478	174483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406268
3589	NC_002944	GGT	2	6	174542	174547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406268
3590	NC_002944	CGG	2	6	174571	174576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406268
3591	NC_002944	CGG	2	6	174599	174604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406269
3592	NC_002944	CGG	2	6	174613	174618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406269
3593	NC_002944	GCG	2	6	174629	174634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406269
3594	NC_002944	TCG	2	6	174652	174657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406269
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3598	NC_002944	CAC	2	6	174839	174844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406269
3599	NC_002944	CAG	2	6	174857	174862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406269
3600	NC_002944	CGT	2	6	174863	174868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406269
3601	NC_002944	CGG	2	6	174904	174909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406269
3602	NC_002944	GCA	2	6	174964	174969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406269
3603	NC_002944	CCT	2	6	174970	174975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406269
3604	NC_002944	GCG	2	6	174982	174987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406269
3605	NC_002944	GCC	2	6	175039	175044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406269
3606	NC_002944	CGG	2	6	175080	175085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406269
3607	NC_002944	CGC	2	6	175102	175107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406269
3608	NC_002944	CCA	2	6	175147	175152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406269
3609	NC_002944	CGT	2	6	175153	175158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406269
3610	NC_002944	CGG	2	6	175180	175185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406269
3611	NC_002944	GCC	2	6	175234	175239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406269
3612	NC_002944	ACG	2	6	175266	175271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406269
3613	NC_002944	GGC	2	6	175313	175318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406269
3614	NC_002944	GCG	2	6	175498	175503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406269
3615	NC_002944	CGC	2	6	175535	175540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406269
3616	NC_002944	CGG	2	6	175555	175560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406269
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3801	NC_002944	CGG	2	6	184135	184140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3802	NC_002944	TAC	2	6	184232	184237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406275
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3852	NC_002944	GGC	2	6	186435	186440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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