MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 104301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_002944	CGA	2	6	99973	99978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406190
2002	NC_002944	CCA	2	6	100002	100007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406190
2003	NC_002944	GGC	2	6	100171	100176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406190
2004	NC_002944	CGG	2	6	100179	100184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406190
2005	NC_002944	TGG	2	6	100200	100205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406190
2006	NC_002944	CTG	2	6	100244	100249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406190
2007	NC_002944	GCC	2	6	100313	100318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406190
2008	NC_002944	TGG	2	6	100323	100328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406190
2009	NC_002944	CCG	2	6	100368	100373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406190
2010	NC_002944	CCG	2	6	100438	100443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406190
2011	NC_002944	TGG	2	6	100446	100451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406190
2012	NC_002944	CGC	2	6	100462	100467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406190
2013	NC_002944	TCG	2	6	100509	100514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406190
2014	NC_002944	CCA	2	6	100596	100601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406190
2015	NC_002944	TCG	2	6	100614	100619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406190
2016	NC_002944	GCT	2	6	100621	100626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406190
2017	NC_002944	TCG	2	6	100650	100655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406190
2018	NC_002944	CGG	2	6	100698	100703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406190
2019	NC_002944	GTG	2	6	100730	100735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406190
2020	NC_002944	TGA	2	6	100752	100757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406190
2021	NC_002944	ACA	2	6	100785	100790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406190
2022	NC_002944	TCG	2	6	100858	100863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406191
2023	NC_002944	CGC	3	9	100877	100885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406191
2024	NC_002944	TCT	2	6	100915	100920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406191
2025	NC_002944	TGC	2	6	100951	100956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406191
2026	NC_002944	CGG	3	9	101024	101032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406191
2027	NC_002944	GGT	2	6	101048	101053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406191
2028	NC_002944	CCG	2	6	101065	101070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406191
2029	NC_002944	TGG	2	6	101077	101082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406191
2030	NC_002944	CAT	2	6	101135	101140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406191
2031	NC_002944	CGG	2	6	101358	101363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_002944	TTG	2	6	101425	101430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_002944	CGG	2	6	101454	101459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_002944	TCG	2	6	101592	101597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406192
2035	NC_002944	CCG	2	6	101598	101603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406192
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2038	NC_002944	GCT	2	6	101802	101807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406192
2039	NC_002944	TTG	2	6	101852	101857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_002944	CGG	2	6	101881	101886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2041	NC_002944	CGT	2	6	101931	101936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_002944	CAT	2	6	101940	101945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_002944	CGG	2	6	101974	101979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_002944	CGC	2	6	101980	101985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2045	NC_002944	GTC	2	6	102027	102032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2046	NC_002944	GGC	2	6	102033	102038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_002944	CGG	2	6	102087	102092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2048	NC_002944	GAC	2	6	102180	102185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2049	NC_002944	GCC	2	6	102201	102206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2050	NC_002944	CGG	2	6	102251	102256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_002944	CAC	2	6	102280	102285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2052	NC_002944	CGC	2	6	102302	102307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2053	NC_002944	TCA	2	6	102325	102330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2054	NC_002944	ACC	2	6	102376	102381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2055	NC_002944	GCG	2	6	102382	102387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_002944	TGC	2	6	102401	102406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_002944	GCG	2	6	102472	102477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_002944	GCC	2	6	102486	102491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2059	NC_002944	GGC	2	6	102524	102529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2060	NC_002944	CTG	2	6	102582	102587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2061	NC_002944	GCC	2	6	102615	102620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2062	NC_002944	CGA	2	6	102647	102652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_002944	TGT	2	6	102693	102698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_002944	CAC	2	6	102774	102779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2065	NC_002944	GAC	2	6	102780	102785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2066	NC_002944	CGC	2	6	102794	102799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2067	NC_002944	CAT	2	6	102861	102866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_002944	TGG	2	6	102927	102932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2073	NC_002944	TGC	2	6	103027	103032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406193
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2083	NC_002944	CTG	2	6	103538	103543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2089	NC_002944	GCA	2	6	104142	104147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406195
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2092	NC_002944	GAG	2	6	104289	104294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406195
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2095	NC_002944	GGC	2	6	104456	104461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406195
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2099	NC_002944	TTG	2	6	104760	104765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406196
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2101	NC_002944	GCG	2	6	104788	104793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406196
2102	NC_002944	TCC	2	6	104959	104964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406196
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2107	NC_002944	CAC	2	6	105162	105167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406196
2108	NC_002944	CGA	2	6	105275	105280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406196
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2113	NC_002944	TGC	2	6	105516	105521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2114	NC_002944	AGT	2	6	105610	105615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_002944	CGA	2	6	105651	105656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_002944	GCC	2	6	105694	105699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2117	NC_002944	GGT	2	6	105736	105741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_002944	GCC	2	6	105931	105936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2119	NC_002944	GCC	2	6	106077	106082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406197
2120	NC_002944	GAA	2	6	106094	106099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406197
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2122	NC_002944	ATC	2	6	106267	106272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_002944	GCT	2	6	106299	106304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2124	NC_002944	TGT	2	6	106341	106346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_002944	CTG	2	6	106366	106371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2127	NC_002944	ACT	3	9	106433	106441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2129	NC_002944	TCG	2	6	106628	106633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2481	NC_002944	GCC	2	6	124887	124892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406211
2482	NC_002944	ACC	2	6	124915	124920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406211
2483	NC_002944	CGG	2	6	124962	124967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406211
2484	NC_002944	TGC	2	6	124973	124978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406211
2485	NC_002944	GCC	2	6	124986	124991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406211
2486	NC_002944	ACA	2	6	125022	125027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2487	NC_002944	CCG	2	6	125040	125045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406212
2488	NC_002944	CCG	2	6	125061	125066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406212
2489	NC_002944	AGC	2	6	125076	125081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406212
2490	NC_002944	CGA	2	6	125086	125091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406212
2491	NC_002944	CGG	2	6	125106	125111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406212
2492	NC_002944	TCG	3	9	125175	125183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406212
2493	NC_002944	GGC	2	6	125266	125271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406212
2494	NC_002944	CGG	2	6	125353	125358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406212
2495	NC_002944	ACA	2	6	125424	125429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406212
2496	NC_002944	GTG	2	6	125450	125455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406212
2497	NC_002944	GTG	3	9	125489	125497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406212
2498	NC_002944	TGG	2	6	125505	125510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406212
2499	NC_002944	CGG	2	6	125587	125592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406212
2500	NC_002944	GCG	3	9	125667	125675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406213

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