MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 56535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008340	AAC	2	6	233722	233727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319362
4002	NC_008340	AGG	2	6	233762	233767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319362
4003	NC_008340	ACT	2	6	233780	233785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319362
4004	NC_008340	GAG	2	6	233803	233808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319362
4005	NC_008340	GCC	2	6	233819	233824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319362
4006	NC_008340	GGA	2	6	233841	233846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319362
4007	NC_008340	GGA	2	6	233874	233879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319362
4008	NC_008340	GGC	2	6	233949	233954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319362
4009	NC_008340	GGA	2	6	233970	233975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319362
4010	NC_008340	GCC	2	6	234061	234066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319362
4011	NC_008340	TGA	2	6	234138	234143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319362
4012	NC_008340	CAG	2	6	234183	234188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319362
4013	NC_008340	GCG	2	6	234230	234235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319362
4014	NC_008340	CGA	2	6	234297	234302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319362
4015	NC_008340	CTG	2	6	234328	234333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319362
4016	NC_008340	GGA	2	6	234477	234482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319362
4017	NC_008340	CGG	2	6	234544	234549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319362
4018	NC_008340	CAG	2	6	234592	234597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319362
4019	NC_008340	CCA	2	6	234600	234605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319362
4020	NC_008340	GGA	2	6	234615	234620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319362
4021	NC_008340	CCG	2	6	234639	234644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319362
4022	NC_008340	CCG	2	6	234709	234714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319363
4023	NC_008340	CGC	2	6	234755	234760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319363
4024	NC_008340	GGC	2	6	234770	234775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319363
4025	NC_008340	TGG	2	6	234781	234786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319363
4026	NC_008340	TGC	2	6	234805	234810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319363
4027	NC_008340	TGC	2	6	234818	234823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319363
4028	NC_008340	CTG	2	6	234825	234830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319363
4029	NC_008340	TGC	2	6	234892	234897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319363
4030	NC_008340	TTC	2	6	235092	235097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319363
4031	NC_008340	TGA	2	6	235126	235131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319363
4032	NC_008340	ACC	2	6	235167	235172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319363
4033	NC_008340	TCA	2	6	235228	235233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319363
4034	NC_008340	GAG	2	6	235338	235343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319363
4035	NC_008340	CAT	2	6	235544	235549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319363
4036	NC_008340	CTG	2	6	235617	235622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319363
4037	NC_008340	GCG	2	6	235640	235645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319363
4038	NC_008340	GCC	2	6	235660	235665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319363
4039	NC_008340	GTC	2	6	235671	235676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319363
4040	NC_008340	CCG	2	6	235694	235699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319364
4041	NC_008340	GCA	2	6	235710	235715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319364
4042	NC_008340	GTC	2	6	235726	235731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319364
4043	NC_008340	TCG	2	6	235763	235768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319364
4044	NC_008340	AGC	2	6	235989	235994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319365
4045	NC_008340	GGC	2	6	236000	236005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319365
4046	NC_008340	CAG	2	6	236030	236035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319365
4047	NC_008340	CGG	2	6	236080	236085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319365
4048	NC_008340	CCT	2	6	236200	236205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319365
4049	NC_008340	CCA	2	6	236221	236226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319365
4050	NC_008340	CGG	2	6	236236	236241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319365
4051	NC_008340	GCA	2	6	236293	236298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319365
4052	NC_008340	ACC	2	6	236328	236333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319365
4053	NC_008340	CCG	2	6	236337	236342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319365
4054	NC_008340	CCA	2	6	236389	236394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319365
4055	NC_008340	GGC	2	6	236441	236446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319365
4056	NC_008340	GCA	2	6	236473	236478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319365
4057	NC_008340	GAA	2	6	236507	236512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319365
4058	NC_008340	GCG	2	6	236607	236612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319365
4059	NC_008340	CGA	2	6	236725	236730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319365
4060	NC_008340	GGC	2	6	236780	236785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319365
4061	NC_008340	TCA	2	6	236869	236874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319365
4062	NC_008340	CGA	2	6	236878	236883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319365
4063	NC_008340	CCA	2	6	236905	236910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319365
4064	NC_008340	GTA	3	9	237062	237070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319365
4065	NC_008340	CGC	2	6	237074	237079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319365
4066	NC_008340	GCG	3	9	237093	237101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319365
4067	NC_008340	CTG	2	6	237212	237217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319365
4068	NC_008340	GGT	2	6	237226	237231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319365
4069	NC_008340	CTC	2	6	237323	237328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319366
4070	NC_008340	CTC	2	6	237356	237361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319366
4071	NC_008340	GCC	2	6	237378	237383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319366
4072	NC_008340	CAC	2	6	237470	237475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319366
4073	NC_008340	GCC	2	6	237661	237666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319366
4074	NC_008340	GCA	2	6	237679	237684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319366
4075	NC_008340	GGC	3	9	237872	237880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319366
4076	NC_008340	GCG	2	6	237933	237938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319366
4077	NC_008340	CGA	2	6	237970	237975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319366
4078	NC_008340	CCA	2	6	238114	238119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319366
4079	NC_008340	AGC	2	6	238155	238160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319366
4080	NC_008340	CGG	2	6	238161	238166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319366
4081	NC_008340	TCG	2	6	238188	238193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319366
4082	NC_008340	CAG	2	6	238214	238219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319366
4083	NC_008340	CAC	2	6	238244	238249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319366
4084	NC_008340	TTC	2	6	238394	238399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319367
4085	NC_008340	TCG	2	6	238445	238450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319367
4086	NC_008340	GGC	2	6	238517	238522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319367
4087	NC_008340	CGG	2	6	238533	238538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319367
4088	NC_008340	ATG	3	9	238574	238582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319367
4089	NC_008340	CGT	2	6	238698	238703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319367
4090	NC_008340	TGC	2	6	238737	238742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319367
4091	NC_008340	CAC	2	6	238777	238782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319367
4092	NC_008340	TCG	2	6	238844	238849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319367
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4095	NC_008340	CAG	2	6	239139	239144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319368
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4100	NC_008340	GTA	2	6	239339	239344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319368
4101	NC_008340	TCG	2	6	239383	239388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319368
4102	NC_008340	CCA	2	6	239447	239452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319368
4103	NC_008340	CAG	2	6	239490	239495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319368
4104	NC_008340	GGC	2	6	239507	239512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319368
4105	NC_008340	CCA	2	6	239525	239530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319368
4106	NC_008340	GCA	2	6	239753	239758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319368
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4108	NC_008340	GCT	2	6	239985	239990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319369
4109	NC_008340	CTT	2	6	240021	240026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319369
4110	NC_008340	GAT	2	6	240040	240045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319369
4111	NC_008340	AGA	2	6	240090	240095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319369
4112	NC_008340	CGG	2	6	240102	240107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319369
4113	NC_008340	TGG	2	6	240360	240365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319369
4114	NC_008340	GGC	2	6	240522	240527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319370
4115	NC_008340	GGC	2	6	240584	240589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319370
4116	NC_008340	GCC	2	6	240598	240603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319370
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4118	NC_008340	CAG	3	9	240618	240626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319370
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4237	NC_008340	TGT	2	6	248352	248357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319378
4238	NC_008340	CTT	2	6	248413	248418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319378
4239	NC_008340	CGG	2	6	248490	248495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319378
4240	NC_008340	GCA	2	6	248505	248510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319378
4241	NC_008340	GTA	2	6	248536	248541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319378
4242	NC_008340	GAT	2	6	248578	248583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319378
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4474	NC_008340	GTG	2	6	260504	260509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319387
4475	NC_008340	TAC	2	6	260561	260566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319387
4476	NC_008340	CGG	2	6	260595	260600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319387
4477	NC_008340	CGC	2	6	260602	260607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319387
4478	NC_008340	GCG	2	6	260645	260650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319387
4479	NC_008340	CCA	2	6	260915	260920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319388
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4482	NC_008340	TGC	2	6	261074	261079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319388
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4494	NC_008340	CGC	2	6	261658	261663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
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4496	NC_008340	AGC	2	6	261716	261721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
4497	NC_008340	GCC	2	6	261744	261749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
4498	NC_008340	CAG	2	6	261823	261828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
4499	NC_008340	CGC	3	9	261859	261867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
4500	NC_008340	GCA	2	6	261873	261878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389

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