MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 56535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008340	GCC	2	6	321418	321423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319441
5502	NC_008340	GTG	2	6	321433	321438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319441
5503	NC_008340	TGC	2	6	321451	321456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319441
5504	NC_008340	GCC	2	6	321460	321465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319441
5505	NC_008340	GCT	2	6	321742	321747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319442
5506	NC_008340	GCC	2	6	321823	321828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319442
5507	NC_008340	GGT	2	6	321835	321840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319442
5508	NC_008340	GAC	2	6	321863	321868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319442
5509	NC_008340	GCT	2	6	321880	321885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319442
5510	NC_008340	ATG	2	6	321893	321898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319442
5511	NC_008340	GCC	2	6	321944	321949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319442
5512	NC_008340	ATC	2	6	322013	322018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319442
5513	NC_008340	CGA	2	6	322030	322035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319442
5514	NC_008340	GGC	2	6	322042	322047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319442
5515	NC_008340	GAC	2	6	322073	322078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319442
5516	NC_008340	GCT	2	6	322096	322101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319442
5517	NC_008340	GTT	2	6	322105	322110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319442
5518	NC_008340	ACC	3	9	322143	322151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319442
5519	NC_008340	ACG	2	6	322239	322244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319442
5520	NC_008340	GGC	2	6	322315	322320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319442
5521	NC_008340	GCC	2	6	322367	322372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319442
5522	NC_008340	GCC	2	6	322445	322450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319442
5523	NC_008340	GTG	2	6	322457	322462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319442
5524	NC_008340	GCT	2	6	322468	322473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319442
5525	NC_008340	TGC	2	6	322506	322511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319442
5526	NC_008340	CTG	2	6	322520	322525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319442
5527	NC_008340	GGA	2	6	322555	322560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319442
5528	NC_008340	AGG	2	6	322734	322739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319442
5529	NC_008340	GAG	2	6	322748	322753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319442
5530	NC_008340	GAC	2	6	322829	322834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319442
5531	NC_008340	GGC	2	6	322864	322869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319442
5532	NC_008340	CGG	2	6	322887	322892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319442
5533	NC_008340	AGG	2	6	322914	322919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319442
5534	NC_008340	TGT	2	6	322926	322931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319442
5535	NC_008340	GAC	2	6	323096	323101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319442
5536	NC_008340	GGA	2	6	323155	323160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319442
5537	NC_008340	GCC	2	6	323349	323354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319442
5538	NC_008340	GAG	2	6	323357	323362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319442
5539	NC_008340	GCC	2	6	323381	323386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319442
5540	NC_008340	ACC	2	6	323403	323408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319442
5541	NC_008340	GGC	2	6	323475	323480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319443
5542	NC_008340	GAC	2	6	323521	323526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319443
5543	NC_008340	AGG	2	6	323543	323548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319443
5544	NC_008340	GCC	2	6	323596	323601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319443
5545	NC_008340	ACC	2	6	323737	323742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319443
5546	NC_008340	TGG	2	6	323783	323788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319443
5547	NC_008340	GGT	2	6	323928	323933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319443
5548	NC_008340	CGG	2	6	323974	323979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319443
5549	NC_008340	GTG	2	6	324013	324018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319443
5550	NC_008340	GCC	3	9	324103	324111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319444
5551	NC_008340	ATC	2	6	324121	324126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319444
5552	NC_008340	GCG	2	6	324200	324205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319444
5553	NC_008340	GCC	2	6	324227	324232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319444
5554	NC_008340	CTG	2	6	324264	324269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319444
5555	NC_008340	ACC	2	6	324276	324281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319444
5556	NC_008340	GGC	3	9	324330	324338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319444
5557	NC_008340	GCG	2	6	324343	324348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319444
5558	NC_008340	CGC	2	6	324359	324364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319444
5559	NC_008340	TGC	2	6	324370	324375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319444
5560	NC_008340	TGG	2	6	324541	324546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319444
5561	NC_008340	CCG	2	6	324571	324576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319444
5562	NC_008340	CGC	2	6	324584	324589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319444
5563	NC_008340	CTC	2	6	324854	324859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319444
5564	NC_008340	GTG	2	6	324877	324882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319444
5565	NC_008340	ATG	2	6	325097	325102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319445
5566	NC_008340	TGG	2	6	325209	325214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319445
5567	NC_008340	TCA	2	6	325302	325307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319445
5568	NC_008340	TCC	2	6	325325	325330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319445
5569	NC_008340	GCC	2	6	325331	325336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319445
5570	NC_008340	CCG	2	6	325381	325386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319445
5571	NC_008340	TGG	2	6	325422	325427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319445
5572	NC_008340	GGC	2	6	325441	325446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319445
5573	NC_008340	TGC	2	6	325539	325544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319445
5574	NC_008340	TCG	2	6	325581	325586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319445
5575	NC_008340	GCG	2	6	325602	325607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319445
5576	NC_008340	GAC	2	6	325640	325645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319445
5577	NC_008340	CAT	2	6	325705	325710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319445
5578	NC_008340	CAT	2	6	325735	325740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319445
5579	NC_008340	CGA	2	6	325744	325749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319445
5580	NC_008340	TGG	2	6	325752	325757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319445
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5582	NC_008340	GGC	2	6	325780	325785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319445
5583	NC_008340	GGT	2	6	325816	325821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319445
5584	NC_008340	TGG	2	6	325893	325898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319445
5585	NC_008340	AGC	2	6	325919	325924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319445
5586	NC_008340	GCG	2	6	325987	325992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319445
5587	NC_008340	GCC	3	9	326196	326204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319446
5588	NC_008340	CAT	2	6	326230	326235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319446
5589	NC_008340	CGG	2	6	326239	326244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319446
5590	NC_008340	CTG	2	6	326276	326281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319446
5591	NC_008340	GTG	2	6	326426	326431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319446
5592	NC_008340	CGG	2	6	326503	326508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319446
5593	NC_008340	ATC	2	6	326510	326515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319446
5594	NC_008340	CAC	2	6	326516	326521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319446
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5598	NC_008340	GAG	2	6	326759	326764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319446
5599	NC_008340	TCG	2	6	326843	326848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319447
5600	NC_008340	GCC	2	6	326924	326929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319447
5601	NC_008340	CGG	2	6	326931	326936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319447
5602	NC_008340	TTC	2	6	327067	327072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319447
5603	NC_008340	TGG	2	6	327095	327100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319447
5604	NC_008340	ACG	2	6	327104	327109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319447
5605	NC_008340	GCC	2	6	327120	327125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319447
5606	NC_008340	GCG	2	6	327149	327154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319447
5607	NC_008340	GTG	2	6	327262	327267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319447
5608	NC_008340	CGA	2	6	327294	327299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319447
5609	NC_008340	GGA	2	6	327324	327329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319447
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