MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 56535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008340	TGG	2	6	28591	28596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319191
502	NC_008340	CAT	2	6	28679	28684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319191
503	NC_008340	TGG	2	6	28747	28752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319191
504	NC_008340	GTT	2	6	28784	28789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319191
505	NC_008340	CAT	2	6	28790	28795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319191
506	NC_008340	TCG	2	6	28918	28923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319192
507	NC_008340	CGA	2	6	28956	28961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319192
508	NC_008340	GCC	2	6	28977	28982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319192
509	NC_008340	CCG	2	6	28988	28993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319192
510	NC_008340	CAT	2	6	29016	29021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319192
511	NC_008340	GCC	2	6	29026	29031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319192
512	NC_008340	GCC	2	6	29173	29178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319192
513	NC_008340	GGC	2	6	29193	29198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319192
514	NC_008340	CGG	2	6	29223	29228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319192
515	NC_008340	GGC	4	12	29308	29319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319192
516	NC_008340	GTG	2	6	29332	29337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319192
517	NC_008340	GCT	2	6	29352	29357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319192
518	NC_008340	GCG	2	6	29520	29525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319192
519	NC_008340	GGT	2	6	29535	29540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319192
520	NC_008340	GAG	3	9	29569	29577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319192
521	NC_008340	CGC	2	6	29578	29583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319192
522	NC_008340	TTC	2	6	29674	29679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319192
523	NC_008340	GAT	2	6	29724	29729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319192
524	NC_008340	TGG	2	6	29762	29767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319192
525	NC_008340	AGG	2	6	29795	29800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319192
526	NC_008340	GCC	2	6	29952	29957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319192
527	NC_008340	CTA	2	6	29958	29963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319192
528	NC_008340	GGT	2	6	30045	30050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319192
529	NC_008340	CAT	2	6	30090	30095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319192
530	NC_008340	AAG	2	6	30145	30150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319192
531	NC_008340	CCG	2	6	30250	30255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319193
532	NC_008340	TGA	2	6	30296	30301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319193
533	NC_008340	CGG	2	6	30485	30490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319193
534	NC_008340	CAC	2	6	30611	30616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319193
535	NC_008340	GGC	2	6	30652	30657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319193
536	NC_008340	GGC	2	6	30677	30682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319193
537	NC_008340	GAG	2	6	30828	30833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319194
538	NC_008340	AGG	2	6	30844	30849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319194
539	NC_008340	AGC	2	6	30871	30876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319194
540	NC_008340	GAT	2	6	30957	30962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319194
541	NC_008340	GCC	3	9	31042	31050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319194
542	NC_008340	CCA	2	6	31052	31057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319194
543	NC_008340	GGC	2	6	31077	31082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319194
544	NC_008340	CAG	2	6	31125	31130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319194
545	NC_008340	CCG	2	6	31147	31152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319194
546	NC_008340	CAG	2	6	31161	31166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319194
547	NC_008340	CGA	2	6	31167	31172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319194
548	NC_008340	CAG	2	6	31281	31286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319194
549	NC_008340	CGC	2	6	31299	31304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319194
550	NC_008340	CGC	2	6	31371	31376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319194
551	NC_008340	GGA	2	6	31382	31387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319194
552	NC_008340	CCG	2	6	31405	31410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319194
553	NC_008340	CGC	2	6	31411	31416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319194
554	NC_008340	TGG	2	6	31454	31459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319194
555	NC_008340	AGC	2	6	31528	31533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319194
556	NC_008340	CCG	2	6	31555	31560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319194
557	NC_008340	CAG	2	6	31578	31583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319194
558	NC_008340	CGG	2	6	31774	31779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319195
559	NC_008340	CAC	2	6	31795	31800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319195
560	NC_008340	GGC	2	6	31809	31814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319195
561	NC_008340	GCC	2	6	31866	31871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319195
562	NC_008340	TGC	2	6	31875	31880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319195
563	NC_008340	GGT	2	6	31897	31902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319195
564	NC_008340	ACG	2	6	31917	31922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319195
565	NC_008340	TCA	2	6	31962	31967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319195
566	NC_008340	TGG	2	6	31971	31976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319195
567	NC_008340	CCG	2	6	32017	32022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319195
568	NC_008340	CAG	2	6	32135	32140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319195
569	NC_008340	GGT	2	6	32215	32220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319195
570	NC_008340	CTT	2	6	32239	32244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319195
571	NC_008340	ACG	2	6	32331	32336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319195
572	NC_008340	GGA	2	6	32362	32367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319195
573	NC_008340	CGG	2	6	32377	32382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319195
574	NC_008340	TGG	2	6	32397	32402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319195
575	NC_008340	CGA	2	6	32584	32589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319195
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577	NC_008340	GGT	2	6	32635	32640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319195
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580	NC_008340	GAG	2	6	32879	32884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319196
581	NC_008340	CGG	2	6	32981	32986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319196
582	NC_008340	CGA	2	6	33016	33021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319196
583	NC_008340	CGC	2	6	33050	33055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319196
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589	NC_008340	TGC	2	6	33330	33335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319196
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591	NC_008340	TGC	2	6	33471	33476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319196
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593	NC_008340	CTG	2	6	33668	33673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319196
594	NC_008340	CCG	2	6	33700	33705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319196
595	NC_008340	GGA	2	6	33769	33774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319196
596	NC_008340	CGC	2	6	33820	33825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319196
597	NC_008340	GCC	2	6	33867	33872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319196
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599	NC_008340	CAG	2	6	34151	34156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319197
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602	NC_008340	ACC	2	6	34368	34373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319197
603	NC_008340	CAG	3	9	34394	34402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319197
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605	NC_008340	CAG	2	6	34430	34435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319197
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609	NC_008340	GCA	2	6	34693	34698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319197
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612	NC_008340	CAG	2	6	34931	34936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319197
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614	NC_008340	GCG	2	6	35015	35020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319197
615	NC_008340	AGT	2	6	35062	35067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319197
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997	NC_008340	ATT	2	6	61689	61694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114319221
998	NC_008340	CGA	2	6	61739	61744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
999	NC_008340	CCG	2	6	61777	61782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319221
1000	NC_008340	GCG	2	6	61820	61825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221

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