MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 56535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008340	CAT	2	6	205869	205874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319336
3502	NC_008340	GCC	2	6	205895	205900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319336
3503	NC_008340	ACC	2	6	205933	205938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319336
3504	NC_008340	TTC	2	6	205969	205974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319336
3505	NC_008340	TGG	2	6	206003	206008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319336
3506	NC_008340	GAG	2	6	206011	206016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319336
3507	NC_008340	CAG	2	6	206082	206087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319336
3508	NC_008340	ACT	2	6	206174	206179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319336
3509	NC_008340	GCC	2	6	206308	206313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319336
3510	NC_008340	GCT	2	6	206361	206366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319336
3511	NC_008340	TCA	2	6	206423	206428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319336
3512	NC_008340	GCT	2	6	206554	206559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319337
3513	NC_008340	CCG	2	6	206634	206639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319337
3514	NC_008340	AGG	2	6	206764	206769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319337
3515	NC_008340	CCT	2	6	206776	206781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319337
3516	NC_008340	GGT	2	6	206915	206920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319337
3517	NC_008340	CAT	2	6	206960	206965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319337
3518	NC_008340	CGG	2	6	206980	206985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319337
3519	NC_008340	TGG	2	6	207001	207006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319337
3520	NC_008340	CGG	2	6	207046	207051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319337
3521	NC_008340	CCG	2	6	207088	207093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319337
3522	NC_008340	GAT	2	6	207123	207128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319337
3523	NC_008340	CGC	2	6	207140	207145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319337
3524	NC_008340	CGG	2	6	207154	207159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319337
3525	NC_008340	TGG	2	6	207184	207189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319337
3526	NC_008340	GCC	3	9	207216	207224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319337
3527	NC_008340	AGG	2	6	207292	207297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319337
3528	NC_008340	TGA	2	6	207317	207322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319337
3529	NC_008340	CGG	2	6	207636	207641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319338
3530	NC_008340	GCG	2	6	207656	207661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319338
3531	NC_008340	AAC	2	6	207707	207712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319338
3532	NC_008340	CGA	2	6	207715	207720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319338
3533	NC_008340	GAT	2	6	207748	207753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319338
3534	NC_008340	TCA	2	6	207906	207911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319338
3535	NC_008340	TGA	2	6	207984	207989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319338
3536	NC_008340	AGC	2	6	208002	208007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319338
3537	NC_008340	CGA	2	6	208051	208056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319338
3538	NC_008340	CCT	2	6	208087	208092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319338
3539	NC_008340	TAC	2	6	208124	208129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319338
3540	NC_008340	GCC	2	6	208241	208246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319338
3541	NC_008340	GCC	2	6	208259	208264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319338
3542	NC_008340	CCG	2	6	208266	208271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319338
3543	NC_008340	GTG	2	6	208298	208303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319338
3544	NC_008340	GCT	2	6	208348	208353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319338
3545	NC_008340	TTC	2	6	208370	208375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319338
3546	NC_008340	GAG	2	6	208403	208408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319338
3547	NC_008340	GGA	2	6	208441	208446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319338
3548	NC_008340	CCG	2	6	208489	208494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319338
3549	NC_008340	GCC	2	6	208572	208577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319338
3550	NC_008340	ATC	2	6	208580	208585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319338
3551	NC_008340	GAG	2	6	208610	208615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319338
3552	NC_008340	CTG	2	6	208619	208624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319338
3553	NC_008340	TGG	2	6	208665	208670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319338
3554	NC_008340	CTG	2	6	208679	208684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319338
3555	NC_008340	GGT	2	6	208809	208814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319339
3556	NC_008340	GCC	2	6	208829	208834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319339
3557	NC_008340	GCT	2	6	208938	208943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319339
3558	NC_008340	GGC	2	6	208944	208949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319339
3559	NC_008340	AGC	2	6	209003	209008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319339
3560	NC_008340	GCC	2	6	209079	209084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319339
3561	NC_008340	CCG	2	6	209105	209110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319339
3562	NC_008340	CTG	2	6	209161	209166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319339
3563	NC_008340	TGC	3	9	209174	209182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319339
3564	NC_008340	CAG	2	6	209185	209190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319339
3565	NC_008340	GCT	3	9	209217	209225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319339
3566	NC_008340	GGC	2	6	209250	209255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319339
3567	NC_008340	GTG	2	6	209269	209274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319339
3568	NC_008340	CGC	2	6	209294	209299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319339
3569	NC_008340	CTG	2	6	209314	209319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319339
3570	NC_008340	CAC	2	6	209382	209387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319339
3571	NC_008340	GAG	2	6	209398	209403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319339
3572	NC_008340	CCA	2	6	209438	209443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319339
3573	NC_008340	GCT	2	6	209448	209453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319339
3574	NC_008340	GGC	2	6	209510	209515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319339
3575	NC_008340	CGA	2	6	209532	209537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319339
3576	NC_008340	GGC	2	6	209544	209549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319339
3577	NC_008340	GCC	2	6	209554	209559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319339
3578	NC_008340	CAG	2	6	209576	209581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319340
3579	NC_008340	CGA	2	6	209584	209589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319340
3580	NC_008340	ACA	2	6	209592	209597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319340
3581	NC_008340	CCA	2	6	209763	209768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319340
3582	NC_008340	TGA	2	6	209835	209840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319340
3583	NC_008340	CGA	2	6	210381	210386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319341
3584	NC_008340	GGT	2	6	210417	210422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319341
3585	NC_008340	CCG	2	6	210430	210435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319341
3586	NC_008340	GGT	2	6	210495	210500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319341
3587	NC_008340	GGC	2	6	210514	210519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319341
3588	NC_008340	CTG	2	6	210562	210567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319341
3589	NC_008340	CTG	2	6	210634	210639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319341
3590	NC_008340	GAC	2	6	210670	210675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319341
3591	NC_008340	CTG	2	6	210835	210840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319341
3592	NC_008340	TCG	2	6	210908	210913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319341
3593	NC_008340	CGG	2	6	210924	210929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319341
3594	NC_008340	CTG	2	6	211147	211152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319342
3595	NC_008340	GGC	2	6	211161	211166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319342
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3598	NC_008340	CTG	2	6	211330	211335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319342
3599	NC_008340	TGG	2	6	211400	211405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319342
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3601	NC_008340	TGG	2	6	211451	211456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319342
3602	NC_008340	CTG	2	6	211585	211590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319342
3603	NC_008340	CGG	2	6	211610	211615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319342
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3605	NC_008340	TCG	2	6	211709	211714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319342
3606	NC_008340	CAA	2	6	211748	211753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319343
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3608	NC_008340	CGG	2	6	211838	211843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319343
3609	NC_008340	CGA	2	6	211865	211870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319343
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3613	NC_008340	TGA	2	6	212016	212021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319343
3614	NC_008340	GGC	2	6	212032	212037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319343
3615	NC_008340	CTC	2	6	212050	212055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319343
3616	NC_008340	TCC	2	6	212133	212138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319343
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3618	NC_008340	GTG	2	6	212235	212240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319343
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3975	NC_008340	GAC	2	6	231998	232003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319361
3976	NC_008340	ACC	2	6	232023	232028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319361
3977	NC_008340	CTG	2	6	232115	232120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319361
3978	NC_008340	GGC	2	6	232186	232191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319361
3979	NC_008340	GAC	3	9	232217	232225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319361
3980	NC_008340	CGG	2	6	232431	232436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319361
3981	NC_008340	GAC	2	6	232466	232471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319361
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