MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 56535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008340	TGA	2	6	89430	89435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319245
1502	NC_008340	GCA	2	6	89475	89480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319245
1503	NC_008340	GAG	2	6	89557	89562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319245
1504	NC_008340	GGA	2	6	89607	89612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319245
1505	NC_008340	GCC	3	9	89641	89649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319245
1506	NC_008340	CGC	3	9	89664	89672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319245
1507	NC_008340	AAG	2	6	89713	89718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319245
1508	NC_008340	GCC	2	6	89830	89835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
1509	NC_008340	TCG	2	6	89888	89893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319246
1510	NC_008340	CCG	2	6	89906	89911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
1511	NC_008340	CCG	2	6	89999	90004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
1512	NC_008340	GCG	2	6	90017	90022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
1513	NC_008340	TCC	2	6	90053	90058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319246
1514	NC_008340	GCC	2	6	90125	90130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
1515	NC_008340	GCT	2	6	90147	90152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319246
1516	NC_008340	TGG	2	6	90191	90196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319246
1517	NC_008340	CGC	3	9	90399	90407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
1518	NC_008340	CGG	2	6	90408	90413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
1519	NC_008340	CTG	2	6	90424	90429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319246
1520	NC_008340	CCG	2	6	90436	90441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
1521	NC_008340	GGC	2	6	90462	90467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
1522	NC_008340	GGC	3	9	90516	90524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
1523	NC_008340	CCG	2	6	90570	90575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319246
1524	NC_008340	CAC	2	6	90592	90597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319246
1525	NC_008340	GGC	2	6	90609	90614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
1526	NC_008340	CGG	3	9	90621	90629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
1527	NC_008340	GGA	2	6	90990	90995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319246
1528	NC_008340	GGT	2	6	91002	91007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319246
1529	NC_008340	CGG	2	6	91022	91027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319246
1530	NC_008340	AGC	2	6	91145	91150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319246
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1532	NC_008340	TAG	2	6	91330	91335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319247
1533	NC_008340	CAC	2	6	91371	91376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319247
1534	NC_008340	GTC	2	6	91392	91397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319247
1535	NC_008340	GCC	2	6	91407	91412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319247
1536	NC_008340	TGA	2	6	91439	91444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319247
1537	NC_008340	GTT	2	6	91446	91451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319247
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1539	NC_008340	CTC	2	6	91500	91505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319247
1540	NC_008340	GGC	2	6	91554	91559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319247
1541	NC_008340	CTC	2	6	91602	91607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319247
1542	NC_008340	CGG	2	6	91613	91618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319247
1543	NC_008340	TTC	2	6	91620	91625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319247
1544	NC_008340	CGT	2	6	91649	91654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319247
1545	NC_008340	GCC	2	6	91776	91781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319247
1546	NC_008340	CAG	2	6	91824	91829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319247
1547	NC_008340	GAT	3	9	91830	91838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319247
1548	NC_008340	CAG	2	6	92100	92105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319248
1549	NC_008340	GAT	2	6	92130	92135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319248
1550	NC_008340	GCG	2	6	92140	92145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319248
1551	NC_008340	CGC	2	6	92150	92155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319248
1552	NC_008340	GCA	2	6	92189	92194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319248
1553	NC_008340	GCC	2	6	92196	92201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319248
1554	NC_008340	AGC	2	6	92299	92304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319248
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1557	NC_008340	GAT	2	6	92487	92492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319248
1558	NC_008340	CGG	2	6	92507	92512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319248
1559	NC_008340	TGG	2	6	92518	92523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319248
1560	NC_008340	GGC	2	6	92534	92539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319248
1561	NC_008340	GCC	2	6	92553	92558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319248
1562	NC_008340	GCC	2	6	92586	92591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319248
1563	NC_008340	TGA	2	6	92600	92605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319248
1564	NC_008340	TTA	2	6	92620	92625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114319248
1565	NC_008340	CCG	2	6	92632	92637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319248
1566	NC_008340	AGT	2	6	92722	92727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319248
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1569	NC_008340	CGA	2	6	92774	92779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319248
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1571	NC_008340	CGT	2	6	92822	92827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319248
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1573	NC_008340	GAC	2	6	92853	92858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319248
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1579	NC_008340	CAG	3	9	93438	93446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319249
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1592	NC_008340	TCA	2	6	94137	94142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319250
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1594	NC_008340	GAC	2	6	94295	94300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319251
1595	NC_008340	TGA	2	6	94338	94343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319251
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1603	NC_008340	ACG	2	6	94596	94601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319251
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1605	NC_008340	ACG	2	6	94662	94667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319251
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1609	NC_008340	GTG	2	6	94979	94984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319251
1610	NC_008340	GAT	2	6	94994	94999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319251
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1612	NC_008340	GAA	2	6	95083	95088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319251
1613	NC_008340	TGG	2	6	95124	95129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319251
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1618	NC_008340	GGA	2	6	95392	95397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319251
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1620	NC_008340	GTG	2	6	95472	95477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319251
1621	NC_008340	GCT	2	6	95533	95538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319251
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1982	NC_008340	GGT	2	6	116937	116942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319271
1983	NC_008340	TCA	2	6	116954	116959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319271
1984	NC_008340	AGG	2	6	116984	116989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319271
1985	NC_008340	GCG	2	6	117049	117054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319271
1986	NC_008340	CAC	3	9	117102	117110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319271
1987	NC_008340	GCA	2	6	117285	117290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
1988	NC_008340	GGC	2	6	117483	117488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319271
1989	NC_008340	GGC	2	6	117550	117555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319271
1990	NC_008340	GCC	2	6	117564	117569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319271
1991	NC_008340	CGA	2	6	117633	117638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
1992	NC_008340	GCC	2	6	117652	117657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319271
1993	NC_008340	CAG	2	6	117700	117705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
1994	NC_008340	GCC	2	6	117726	117731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319271
1995	NC_008340	ACC	2	6	117793	117798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319271
1996	NC_008340	AGC	2	6	117926	117931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
1997	NC_008340	CAG	2	6	117982	117987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
1998	NC_008340	CAG	2	6	118000	118005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
1999	NC_008340	CAG	2	6	118081	118086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2000	NC_008340	CAG	2	6	118120	118125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271

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