MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 56535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_008340	CAG	2	6	3273905	3273910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114322029
56502	NC_008340	TCT	2	6	3273979	3273984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114322029
56503	NC_008340	CAT	2	6	3274001	3274006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114322029
56504	NC_008340	GCT	2	6	3274051	3274056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114322029
56505	NC_008340	TGG	2	6	3274102	3274107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114322029
56506	NC_008340	GAT	2	6	3274151	3274156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114322029
56507	NC_008340	CGA	2	6	3274174	3274179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114322029
56508	NC_008340	CGC	2	6	3274330	3274335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322029
56509	NC_008340	GTA	2	6	3274403	3274408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114322029
56510	NC_008340	GCC	2	6	3274467	3274472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322029
56511	NC_008340	GTC	2	6	3274505	3274510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114322029
56512	NC_008340	GTC	2	6	3274514	3274519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114322029
56513	NC_008340	TCT	2	6	3274528	3274533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114322029
56514	NC_008340	CCG	2	6	3274563	3274568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322029
56515	NC_008340	GTG	2	6	3274593	3274598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114322029
56516	NC_008340	ACG	2	6	3274616	3274621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114322029
56517	NC_008340	TGG	2	6	3274674	3274679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114322029
56518	NC_008340	GGT	2	6	3274831	3274836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114322029
56519	NC_008340	GTC	2	6	3274895	3274900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114322029
56520	NC_008340	CGG	2	6	3274962	3274967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114322029
56521	NC_008340	CCG	2	6	3274974	3274979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322029
56522	NC_008340	ACC	2	6	3275013	3275018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114322029
56523	NC_008340	TCC	2	6	3275034	3275039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114322029
56524	NC_008340	CCG	2	6	3275074	3275079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322029
56525	NC_008340	CGT	2	6	3275119	3275124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114322029
56526	NC_008340	ACC	2	6	3275136	3275141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114322029
56527	NC_008340	AGC	2	6	3275190	3275195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114322029
56528	NC_008340	CGT	2	6	3275331	3275336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114322030
56529	NC_008340	GCC	2	6	3275352	3275357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322030
56530	NC_008340	CGC	2	6	3275395	3275400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322030
56531	NC_008340	GCC	2	6	3275438	3275443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322030
56532	NC_008340	CGG	2	6	3275586	3275591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114322030
56533	NC_008340	GCC	2	6	3275681	3275686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322030
56534	NC_008340	CGC	2	6	3275727	3275732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114322031
56535	NC_008340	TGG	2	6	3275755	3275760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114322031

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.