MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 56535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008340	GCC	2	6	62025	62030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319221
1002	NC_008340	GCA	2	6	62090	62095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1003	NC_008340	GCG	2	6	62114	62119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1004	NC_008340	GAC	2	6	62193	62198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1005	NC_008340	CTT	2	6	62309	62314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319221
1006	NC_008340	GAG	3	9	62397	62405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319221
1007	NC_008340	CCT	2	6	62537	62542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319221
1008	NC_008340	CAG	2	6	62628	62633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1009	NC_008340	CGC	2	6	62706	62711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319221
1010	NC_008340	CAG	2	6	62718	62723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1011	NC_008340	TGC	2	6	62749	62754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1012	NC_008340	GGT	2	6	62759	62764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319221
1013	NC_008340	CCG	3	9	62807	62815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319221
1014	NC_008340	ACT	2	6	62887	62892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319221
1015	NC_008340	CGA	2	6	62975	62980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1016	NC_008340	CGA	2	6	63179	63184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1017	NC_008340	GAG	2	6	63210	63215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319221
1018	NC_008340	GGC	2	6	63328	63333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1019	NC_008340	GCT	2	6	63344	63349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1020	NC_008340	GCA	2	6	63442	63447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1021	NC_008340	CAG	2	6	63459	63464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1022	NC_008340	CCT	2	6	63503	63508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319221
1023	NC_008340	GGC	2	6	63537	63542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1024	NC_008340	CGC	2	6	63625	63630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319221
1025	NC_008340	GAC	2	6	63726	63731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1026	NC_008340	CGA	2	6	63749	63754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1027	NC_008340	GCT	2	6	63884	63889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1028	NC_008340	CTG	2	6	63915	63920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1029	NC_008340	GAC	2	6	63969	63974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1030	NC_008340	TCG	2	6	63999	64004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1031	NC_008340	GAG	2	6	64071	64076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319221
1032	NC_008340	GCC	2	6	64092	64097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319221
1033	NC_008340	GGC	2	6	64297	64302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1034	NC_008340	GTG	2	6	64309	64314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319221
1035	NC_008340	AGC	2	6	64333	64338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1036	NC_008340	CGG	2	6	64410	64415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1037	NC_008340	GGA	2	6	64427	64432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319221
1038	NC_008340	CTT	2	6	64442	64447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319221
1039	NC_008340	GCG	2	6	64449	64454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1040	NC_008340	GGC	2	6	64455	64460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1041	NC_008340	CTT	2	6	64472	64477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319221
1042	NC_008340	CGA	2	6	64502	64507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1043	NC_008340	CTG	2	6	64518	64523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1044	NC_008340	GCT	2	6	64544	64549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1045	NC_008340	GCT	2	6	64619	64624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1046	NC_008340	GCG	2	6	64670	64675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1047	NC_008340	CGC	2	6	64813	64818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319221
1048	NC_008340	CCA	2	6	64829	64834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319221
1049	NC_008340	CGA	2	6	64862	64867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1050	NC_008340	GTG	2	6	64875	64880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319221
1051	NC_008340	CGG	2	6	65030	65035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1052	NC_008340	AGG	2	6	65409	65414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319222
1053	NC_008340	GCT	2	6	65521	65526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319222
1054	NC_008340	GCC	2	6	65540	65545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319222
1055	NC_008340	TGC	2	6	65553	65558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319222
1056	NC_008340	GGT	2	6	65563	65568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319222
1057	NC_008340	CAC	3	9	65617	65625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319222
1058	NC_008340	CCA	2	6	65637	65642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319222
1059	NC_008340	CGA	2	6	65773	65778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319222
1060	NC_008340	GCC	2	6	65894	65899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319223
1061	NC_008340	GCG	2	6	66134	66139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319223
1062	NC_008340	TGG	2	6	66146	66151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319223
1063	NC_008340	TCC	2	6	66348	66353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319224
1064	NC_008340	TCG	2	6	66444	66449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319224
1065	NC_008340	ATG	2	6	66495	66500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319224
1066	NC_008340	GAT	2	6	66521	66526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319224
1067	NC_008340	TGT	2	6	66534	66539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319224
1068	NC_008340	ACA	2	6	66565	66570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319224
1069	NC_008340	GGA	2	6	66589	66594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319224
1070	NC_008340	TTC	2	6	66693	66698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319224
1071	NC_008340	ACT	2	6	66784	66789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319224
1072	NC_008340	TGA	2	6	66799	66804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319224
1073	NC_008340	CAG	2	6	66851	66856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319224
1074	NC_008340	CCG	2	6	67126	67131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319225
1075	NC_008340	CTG	2	6	67157	67162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319225
1076	NC_008340	GAT	2	6	67274	67279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319225
1077	NC_008340	CGA	2	6	67354	67359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319225
1078	NC_008340	GGT	2	6	67465	67470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319225
1079	NC_008340	TGC	2	6	67509	67514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319225
1080	NC_008340	GTC	2	6	67700	67705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319225
1081	NC_008340	GGC	2	6	67710	67715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319225
1082	NC_008340	GGA	2	6	67729	67734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319225
1083	NC_008340	CGG	2	6	67756	67761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319225
1084	NC_008340	GCA	2	6	67915	67920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319226
1085	NC_008340	CGA	2	6	67945	67950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319226
1086	NC_008340	GCC	2	6	67958	67963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319226
1087	NC_008340	CGG	2	6	68043	68048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319226
1088	NC_008340	CTG	2	6	68120	68125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319226
1089	NC_008340	GCT	4	12	68266	68277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319226
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1091	NC_008340	CGA	2	6	68329	68334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319226
1092	NC_008340	TCA	2	6	68358	68363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319226
1093	NC_008340	AGC	2	6	68400	68405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319226
1094	NC_008340	CGG	2	6	68445	68450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319226
1095	NC_008340	GGC	2	6	68584	68589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319226
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1097	NC_008340	GAC	2	6	68633	68638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319227
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1099	NC_008340	CCG	2	6	68785	68790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319227
1100	NC_008340	CGC	3	9	68794	68802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319227
1101	NC_008340	GCC	2	6	68889	68894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319227
1102	NC_008340	CGG	2	6	68907	68912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1103	NC_008340	CGA	2	6	68965	68970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319227
1104	NC_008340	GCC	2	6	68972	68977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319227
1105	NC_008340	GGA	2	6	68998	69003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319227
1106	NC_008340	CTC	2	6	69049	69054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319227
1107	NC_008340	TGG	2	6	69117	69122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319227
1108	NC_008340	GGT	2	6	69124	69129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319227
1109	NC_008340	CGG	2	6	69149	69154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1110	NC_008340	CGG	2	6	69234	69239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1111	NC_008340	GCG	2	6	69255	69260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1112	NC_008340	TGC	2	6	69345	69350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319227
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1117	NC_008340	GCG	2	6	69516	69521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1118	NC_008340	CTA	2	6	69769	69774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319228
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1120	NC_008340	CGG	2	6	69884	69889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319228
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1122	NC_008340	AGG	2	6	69972	69977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319228
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1489	NC_008340	CCG	2	6	88484	88489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319243
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1493	NC_008340	ATG	2	6	88588	88593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319243
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