MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 56535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008340	ACC	2	6	261890	261895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319389
4502	NC_008340	CCG	2	6	261910	261915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
4503	NC_008340	AAG	2	6	261923	261928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319389
4504	NC_008340	CAA	2	6	261958	261963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319389
4505	NC_008340	CCA	2	6	261966	261971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319389
4506	NC_008340	CGG	2	6	261978	261983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319389
4507	NC_008340	CAG	2	6	262063	262068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
4508	NC_008340	CAG	2	6	262081	262086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
4509	NC_008340	AGC	2	6	262106	262111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
4510	NC_008340	GCC	2	6	262163	262168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
4511	NC_008340	AGC	2	6	262226	262231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
4512	NC_008340	AGC	2	6	262241	262246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
4513	NC_008340	CAG	2	6	262294	262299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
4514	NC_008340	GCG	2	6	262319	262324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319389
4515	NC_008340	ACC	2	6	262406	262411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319389
4516	NC_008340	CAG	2	6	262447	262452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
4517	NC_008340	GAA	2	6	262453	262458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319389
4518	NC_008340	CAG	2	6	262477	262482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
4519	NC_008340	CAT	2	6	262873	262878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319390
4520	NC_008340	GAC	2	6	262957	262962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319390
4521	NC_008340	GTG	3	9	262966	262974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319390
4522	NC_008340	CGG	2	6	262986	262991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319390
4523	NC_008340	CTG	2	6	263041	263046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319390
4524	NC_008340	CTG	2	6	263068	263073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319390
4525	NC_008340	GGC	2	6	263136	263141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319390
4526	NC_008340	CCA	2	6	263159	263164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319390
4527	NC_008340	TGG	2	6	263171	263176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319390
4528	NC_008340	TGG	2	6	263221	263226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319390
4529	NC_008340	CAA	2	6	263259	263264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319390
4530	NC_008340	CGC	2	6	263292	263297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319390
4531	NC_008340	GCG	2	6	263311	263316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319390
4532	NC_008340	CGC	2	6	263408	263413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319390
4533	NC_008340	CAG	2	6	263455	263460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319390
4534	NC_008340	CTG	2	6	263569	263574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319390
4535	NC_008340	GCT	2	6	263640	263645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319390
4536	NC_008340	GTC	2	6	263702	263707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319390
4537	NC_008340	GGC	2	6	263745	263750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319390
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4539	NC_008340	GCC	2	6	263939	263944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319391
4540	NC_008340	CTT	2	6	263954	263959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319391
4541	NC_008340	GCC	2	6	263963	263968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319391
4542	NC_008340	GCC	2	6	263978	263983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319391
4543	NC_008340	CCG	2	6	263985	263990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319391
4544	NC_008340	CGC	2	6	264062	264067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319391
4545	NC_008340	GCG	2	6	264118	264123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319391
4546	NC_008340	GGC	2	6	264580	264585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319392
4547	NC_008340	GTC	2	6	264830	264835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319392
4548	NC_008340	CTG	2	6	264893	264898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319392
4549	NC_008340	GGC	3	9	264899	264907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319392
4550	NC_008340	GTG	2	6	264948	264953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319392
4551	NC_008340	CGA	2	6	265130	265135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319393
4552	NC_008340	ATG	2	6	265188	265193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319393
4553	NC_008340	TCA	2	6	265195	265200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319393
4554	NC_008340	GTT	2	6	265250	265255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319393
4555	NC_008340	CGT	2	6	265354	265359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319394
4556	NC_008340	GGC	2	6	265387	265392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319394
4557	NC_008340	CTG	2	6	265394	265399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319394
4558	NC_008340	GCC	2	6	265520	265525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319394
4559	NC_008340	ACG	2	6	265566	265571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319394
4560	NC_008340	GCA	2	6	265593	265598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319394
4561	NC_008340	CGG	2	6	265599	265604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319394
4562	NC_008340	GCA	2	6	265636	265641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319394
4563	NC_008340	GGT	2	6	265647	265652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319394
4564	NC_008340	CAT	2	6	265666	265671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319394
4565	NC_008340	GGA	2	6	265780	265785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319394
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4567	NC_008340	CTG	2	6	265895	265900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319394
4568	NC_008340	TGC	2	6	265917	265922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319394
4569	NC_008340	ACG	2	6	266013	266018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319394
4570	NC_008340	CGA	3	9	266050	266058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319394
4571	NC_008340	GGA	2	6	266092	266097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319394
4572	NC_008340	TGT	2	6	266274	266279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319394
4573	NC_008340	CGC	2	6	266290	266295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319394
4574	NC_008340	CTG	2	6	266321	266326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319394
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4580	NC_008340	GGT	2	6	266479	266484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319394
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4583	NC_008340	TCT	2	6	266881	266886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319395
4584	NC_008340	ACG	2	6	267007	267012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319395
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4586	NC_008340	CCT	2	6	267162	267167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319396
4587	NC_008340	CCA	2	6	267186	267191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319396
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4589	NC_008340	CTC	2	6	267202	267207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319396
4590	NC_008340	CGG	2	6	267228	267233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319396
4591	NC_008340	GTG	2	6	267316	267321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319396
4592	NC_008340	GTT	2	6	267388	267393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319396
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4601	NC_008340	CAG	2	6	267983	267988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319397
4602	NC_008340	GCG	2	6	268098	268103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319397
4603	NC_008340	CAG	2	6	268106	268111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319397
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4605	NC_008340	GGC	2	6	268283	268288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319397
4606	NC_008340	CGG	2	6	268351	268356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319397
4607	NC_008340	CCA	2	6	268390	268395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319397
4608	NC_008340	CAG	3	9	268409	268417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319397
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4857	NC_008340	TCC	2	6	282630	282635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319409
4858	NC_008340	TGA	2	6	283253	283258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319410
4859	NC_008340	GCT	2	6	283278	283283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319410
4860	NC_008340	CCG	2	6	283301	283306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319410
4861	NC_008340	CCG	2	6	283313	283318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319410
4862	NC_008340	CGC	2	6	283326	283331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319410
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4869	NC_008340	CCG	2	6	283724	283729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319410
4870	NC_008340	CCG	2	6	283782	283787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319410
4871	NC_008340	CGA	2	6	283893	283898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319410
4872	NC_008340	CGG	2	6	284031	284036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319410
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4884	NC_008340	GAC	2	6	284851	284856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319411
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4975	NC_008340	CCA	2	6	291726	291731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319420
4976	NC_008340	CCG	2	6	291889	291894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319421
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4978	NC_008340	GGT	2	6	291983	291988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319421
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