MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 56535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008340	CAC	2	6	118192	118197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319271
2002	NC_008340	GCC	2	6	118242	118247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319271
2003	NC_008340	CAG	2	6	118279	118284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2004	NC_008340	CCG	2	6	118347	118352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319271
2005	NC_008340	CGC	2	6	118363	118368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319271
2006	NC_008340	CGG	2	6	118497	118502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319271
2007	NC_008340	CTG	3	9	118517	118525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2008	NC_008340	GGC	2	6	118564	118569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319271
2009	NC_008340	CGC	2	6	118645	118650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319271
2010	NC_008340	GGC	3	9	118663	118671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319271
2011	NC_008340	GCC	2	6	118693	118698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319271
2012	NC_008340	TGC	2	6	118767	118772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2013	NC_008340	GCA	2	6	118815	118820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2014	NC_008340	GCC	2	6	118839	118844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319271
2015	NC_008340	CAG	2	6	118894	118899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2016	NC_008340	CAG	2	6	118903	118908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2017	NC_008340	TGC	3	9	118946	118954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2018	NC_008340	GCA	2	6	118995	119000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2019	NC_008340	CGC	2	6	119011	119016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319271
2020	NC_008340	GCA	3	9	119031	119039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2021	NC_008340	CAC	2	6	119104	119109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319271
2022	NC_008340	CAG	2	6	119128	119133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2023	NC_008340	CCG	2	6	119187	119192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319271
2024	NC_008340	AGC	2	6	119220	119225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2025	NC_008340	CGT	2	6	119233	119238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2026	NC_008340	GGT	2	6	119251	119256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319271
2027	NC_008340	TCG	2	6	119297	119302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2028	NC_008340	GCA	2	6	119325	119330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2029	NC_008340	ACC	2	6	119348	119353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319271
2030	NC_008340	CCA	2	6	119410	119415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319271
2031	NC_008340	CGG	2	6	119490	119495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319271
2032	NC_008340	CCG	2	6	119496	119501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319271
2033	NC_008340	GTG	2	6	119591	119596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319271
2034	NC_008340	CTG	2	6	119677	119682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319271
2035	NC_008340	ATC	2	6	119752	119757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319271
2036	NC_008340	GCA	2	6	119772	119777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319271
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2038	NC_008340	CGG	3	9	120253	120261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319272
2039	NC_008340	GCG	2	6	120484	120489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319272
2040	NC_008340	CTT	2	6	120560	120565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319272
2041	NC_008340	ACA	2	6	120634	120639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319272
2042	NC_008340	CCA	2	6	120727	120732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319272
2043	NC_008340	GAC	2	6	120747	120752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319272
2044	NC_008340	CGG	2	6	120818	120823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319272
2045	NC_008340	GCT	2	6	120896	120901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319272
2046	NC_008340	CGG	2	6	120955	120960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319272
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2048	NC_008340	CGG	2	6	121343	121348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319273
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2050	NC_008340	TGG	3	9	121403	121411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319273
2051	NC_008340	CCA	2	6	121424	121429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319273
2052	NC_008340	GAG	2	6	121516	121521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319273
2053	NC_008340	CAC	2	6	121563	121568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319273
2054	NC_008340	TGA	2	6	121640	121645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319273
2055	NC_008340	AGG	2	6	121688	121693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319273
2056	NC_008340	GCC	2	6	121699	121704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319273
2057	NC_008340	CTG	2	6	121894	121899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319273
2058	NC_008340	GCC	2	6	121935	121940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319273
2059	NC_008340	GTG	2	6	121984	121989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319273
2060	NC_008340	CGG	2	6	122001	122006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319273
2061	NC_008340	AGG	2	6	122012	122017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319273
2062	NC_008340	ACC	2	6	122020	122025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319273
2063	NC_008340	TGG	2	6	122102	122107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319273
2064	NC_008340	GCG	2	6	122153	122158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319273
2065	NC_008340	ACT	2	6	122183	122188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319273
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2067	NC_008340	GCC	2	6	122257	122262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319273
2068	NC_008340	TGC	2	6	122285	122290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319274
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2070	NC_008340	CTG	2	6	122305	122310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319274
2071	NC_008340	GGC	2	6	122330	122335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319274
2072	NC_008340	ATC	2	6	122351	122356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319274
2073	NC_008340	TGC	2	6	122360	122365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319274
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2075	NC_008340	GCT	2	6	122427	122432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319274
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2089	NC_008340	CGC	2	6	123421	123426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319275
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2102	NC_008340	TGG	2	6	124220	124225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319276
2103	NC_008340	CCG	2	6	124254	124259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319276
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2106	NC_008340	CGG	2	6	124385	124390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319276
2107	NC_008340	ACT	2	6	124404	124409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319276
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2112	NC_008340	TCT	2	6	124747	124752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319276
2113	NC_008340	TGA	2	6	124755	124760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319276
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2116	NC_008340	TCA	2	6	125134	125139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319277
2117	NC_008340	GGC	2	6	125171	125176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319277
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2119	NC_008340	GCG	2	6	125195	125200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319277
2120	NC_008340	CGT	2	6	125237	125242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319277
2121	NC_008340	GTG	2	6	125311	125316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319277
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2239	NC_008340	TGA	2	6	136253	136258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319284
2240	NC_008340	GCG	2	6	136269	136274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319284
2241	NC_008340	CTC	2	6	136302	136307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319284
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2243	NC_008340	CTG	2	6	136360	136365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319284
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2247	NC_008340	CTG	2	6	136492	136497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319284
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2475	NC_008340	GGT	2	6	152017	152022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319294
2476	NC_008340	CCG	2	6	152030	152035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319294
2477	NC_008340	TCA	2	6	152037	152042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319294
2478	NC_008340	CGG	2	6	152046	152051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319294
2479	NC_008340	CAG	2	6	152161	152166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319294
2480	NC_008340	GTC	2	6	152242	152247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319294
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