MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 56535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008340	CCA	2	6	292919	292924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319423
5002	NC_008340	CGG	2	6	292933	292938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5003	NC_008340	TCG	2	6	292948	292953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5004	NC_008340	GGC	2	6	292958	292963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5005	NC_008340	AGC	2	6	292972	292977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5006	NC_008340	GCA	2	6	292985	292990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5007	NC_008340	GCT	2	6	293120	293125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5008	NC_008340	GGC	2	6	293156	293161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5009	NC_008340	CCA	2	6	293210	293215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319423
5010	NC_008340	GAA	2	6	293232	293237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319423
5011	NC_008340	CTG	2	6	293244	293249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5012	NC_008340	TCC	3	9	293278	293286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319423
5013	NC_008340	GCA	2	6	293327	293332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5014	NC_008340	GGC	2	6	293460	293465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5015	NC_008340	CGG	2	6	293606	293611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5016	NC_008340	GGC	2	6	293713	293718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5017	NC_008340	CGG	2	6	293729	293734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5018	NC_008340	CCG	3	9	293746	293754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319423
5019	NC_008340	CCA	2	6	293819	293824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319423
5020	NC_008340	CCT	2	6	293828	293833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319423
5021	NC_008340	TGG	2	6	293911	293916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319423
5022	NC_008340	CCG	2	6	293917	293922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319423
5023	NC_008340	CGG	2	6	293969	293974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5024	NC_008340	GCA	2	6	294047	294052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5025	NC_008340	ATG	2	6	294094	294099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319423
5026	NC_008340	CGG	2	6	294158	294163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5027	NC_008340	CCT	2	6	294164	294169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319423
5028	NC_008340	GTC	2	6	294183	294188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5029	NC_008340	CCT	2	6	294242	294247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319423
5030	NC_008340	CAG	2	6	294444	294449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5031	NC_008340	TCC	2	6	294463	294468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319423
5032	NC_008340	AGC	2	6	294565	294570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5033	NC_008340	CCA	2	6	294596	294601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319423
5034	NC_008340	TGA	2	6	294644	294649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319423
5035	NC_008340	GGC	2	6	294678	294683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5036	NC_008340	GCG	2	6	294784	294789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5037	NC_008340	CGG	4	12	294922	294933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5038	NC_008340	TCG	2	6	294937	294942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5039	NC_008340	GAT	2	6	294957	294962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319423
5040	NC_008340	CGG	2	6	294977	294982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5041	NC_008340	CCT	2	6	294986	294991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319423
5042	NC_008340	TCG	2	6	294997	295002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5043	NC_008340	CAG	2	6	295032	295037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5044	NC_008340	GCA	2	6	295061	295066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319423
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5046	NC_008340	GCA	2	6	295166	295171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5047	NC_008340	CGG	2	6	295361	295366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
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5049	NC_008340	GTC	2	6	295488	295493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319423
5050	NC_008340	GGC	2	6	295500	295505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
5051	NC_008340	GAT	2	6	296204	296209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319424
5052	NC_008340	TTG	4	12	296220	296231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319424
5053	NC_008340	ACC	2	6	296238	296243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319424
5054	NC_008340	CGG	2	6	296247	296252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319424
5055	NC_008340	GTG	2	6	296307	296312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319424
5056	NC_008340	CGG	2	6	296497	296502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319424
5057	NC_008340	TCA	2	6	296524	296529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319424
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5059	NC_008340	ATC	2	6	296565	296570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319424
5060	NC_008340	TCC	2	6	296571	296576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319424
5061	NC_008340	CCA	2	6	296584	296589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319424
5062	NC_008340	GCT	2	6	296596	296601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319424
5063	NC_008340	CGG	2	6	296643	296648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319424
5064	NC_008340	GAT	2	6	296684	296689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319424
5065	NC_008340	GCG	2	6	296787	296792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319424
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5067	NC_008340	CAG	2	6	296831	296836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319424
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5070	NC_008340	TGG	2	6	297019	297024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319424
5071	NC_008340	GCA	2	6	297055	297060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319424
5072	NC_008340	GAT	2	6	297068	297073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319424
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5087	NC_008340	TCG	2	6	297657	297662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319424
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5089	NC_008340	CGT	2	6	297676	297681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319424
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5102	NC_008340	CTT	2	6	298919	298924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319425
5103	NC_008340	CTT	2	6	298940	298945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319425
5104	NC_008340	GCT	2	6	298971	298976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319425
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5475	NC_008340	GCC	2	6	319805	319810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319440
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