MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 56535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008340	GCA	2	6	179110	179115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319316
3002	NC_008340	GTG	2	6	179186	179191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
3003	NC_008340	CGG	2	6	179196	179201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319316
3004	NC_008340	CTT	2	6	179266	179271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319316
3005	NC_008340	CGA	2	6	179272	179277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319316
3006	NC_008340	GGA	2	6	179311	179316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319316
3007	NC_008340	GGT	2	6	179344	179349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
3008	NC_008340	TGG	2	6	179469	179474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
3009	NC_008340	GAG	2	6	179498	179503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319316
3010	NC_008340	ACG	2	6	179565	179570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319316
3011	NC_008340	GTG	2	6	179588	179593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
3012	NC_008340	CCG	2	6	179699	179704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
3013	NC_008340	GCT	2	6	179761	179766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
3014	NC_008340	GTG	2	6	179798	179803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
3015	NC_008340	GCT	2	6	179806	179811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
3016	NC_008340	GCC	2	6	179852	179857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
3017	NC_008340	TCT	2	6	179895	179900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319316
3018	NC_008340	CTG	2	6	179912	179917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
3019	NC_008340	GAC	2	6	179978	179983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319316
3020	NC_008340	TCC	2	6	179994	179999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319316
3021	NC_008340	GCC	2	6	180012	180017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
3022	NC_008340	CGG	2	6	180033	180038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319316
3023	NC_008340	CCA	2	6	180087	180092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319316
3024	NC_008340	CTG	2	6	180116	180121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
3025	NC_008340	GCG	2	6	180185	180190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319316
3026	NC_008340	CTG	2	6	180203	180208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
3027	NC_008340	TGC	2	6	180210	180215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
3028	NC_008340	CGG	3	9	180703	180711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319317
3029	NC_008340	ATC	2	6	180714	180719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319317
3030	NC_008340	CGG	2	6	180745	180750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319317
3031	NC_008340	GCG	2	6	180757	180762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319317
3032	NC_008340	TTC	2	6	180858	180863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319317
3033	NC_008340	GGT	2	6	180906	180911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319317
3034	NC_008340	CCG	2	6	180913	180918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319317
3035	NC_008340	GGA	2	6	180930	180935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319317
3036	NC_008340	GCT	2	6	180965	180970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319317
3037	NC_008340	CGG	2	6	181000	181005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319317
3038	NC_008340	GCC	2	6	181014	181019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319317
3039	NC_008340	GTG	2	6	181029	181034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319317
3040	NC_008340	CCG	2	6	181036	181041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319317
3041	NC_008340	CAA	2	6	181061	181066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319317
3042	NC_008340	GTT	2	6	181073	181078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319317
3043	NC_008340	GCC	3	9	181122	181130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319317
3044	NC_008340	GCC	3	9	181379	181387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319317
3045	NC_008340	CTT	2	6	181394	181399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319317
3046	NC_008340	CGA	2	6	181430	181435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319317
3047	NC_008340	CTG	2	6	181539	181544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319317
3048	NC_008340	CCT	2	6	181556	181561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319317
3049	NC_008340	CCG	3	9	181577	181585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319317
3050	NC_008340	TCC	2	6	182173	182178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319318
3051	NC_008340	CAT	2	6	182192	182197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319318
3052	NC_008340	GCC	2	6	182251	182256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3053	NC_008340	GGT	2	6	182291	182296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319318
3054	NC_008340	TGG	2	6	182303	182308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319318
3055	NC_008340	CAC	2	6	182382	182387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319318
3056	NC_008340	CGG	2	6	182437	182442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
3057	NC_008340	GGC	2	6	182487	182492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
3058	NC_008340	GTT	2	6	182493	182498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319318
3059	NC_008340	CGT	2	6	182510	182515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3060	NC_008340	CCG	2	6	182558	182563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3061	NC_008340	TCC	2	6	182614	182619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319318
3062	NC_008340	CGG	2	6	182672	182677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
3063	NC_008340	CTG	2	6	182742	182747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3064	NC_008340	GTC	2	6	182775	182780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3065	NC_008340	CAG	2	6	182940	182945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3066	NC_008340	GTC	2	6	182976	182981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3067	NC_008340	CCG	2	6	183044	183049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3068	NC_008340	ACG	2	6	183061	183066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3069	NC_008340	TCG	2	6	183070	183075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3070	NC_008340	GTG	2	6	183135	183140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319318
3071	NC_008340	CAG	2	6	183153	183158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3072	NC_008340	GCC	2	6	183169	183174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3073	NC_008340	CGG	2	6	183178	183183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
3074	NC_008340	TCC	2	6	183190	183195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319318
3075	NC_008340	CTT	2	6	183456	183461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319318
3076	NC_008340	CCT	2	6	183476	183481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319318
3077	NC_008340	GCA	2	6	183554	183559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3078	NC_008340	CCT	2	6	183578	183583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319318
3079	NC_008340	TGG	2	6	183617	183622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319318
3080	NC_008340	GCT	2	6	183629	183634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3081	NC_008340	CGC	2	6	183692	183697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3082	NC_008340	GCA	2	6	183701	183706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3083	NC_008340	CAG	2	6	183717	183722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3084	NC_008340	CAT	2	6	183804	183809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319318
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3086	NC_008340	CGG	2	6	183836	183841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
3087	NC_008340	CGT	2	6	183887	183892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3088	NC_008340	TCG	2	6	183994	183999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3089	NC_008340	CGG	2	6	184009	184014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
3090	NC_008340	CAG	2	6	184032	184037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3091	NC_008340	CGC	2	6	184038	184043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3092	NC_008340	CGC	2	6	184231	184236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3093	NC_008340	GCC	2	6	184255	184260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3094	NC_008340	GCC	2	6	184285	184290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3095	NC_008340	ATG	2	6	184312	184317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319318
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3097	NC_008340	CAG	2	6	184332	184337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3098	NC_008340	GCG	2	6	184453	184458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
3099	NC_008340	CGG	2	6	184478	184483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
3100	NC_008340	GGC	2	6	184518	184523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
3101	NC_008340	TCG	2	6	184660	184665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
3102	NC_008340	CTC	2	6	184671	184676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319318
3103	NC_008340	GCG	2	6	184683	184688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
3104	NC_008340	CGG	2	6	184696	184701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
3105	NC_008340	CCG	2	6	184746	184751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3106	NC_008340	CCG	2	6	184757	184762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3107	NC_008340	TCC	3	9	184855	184863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319318
3108	NC_008340	TGT	2	6	184877	184882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319318
3109	NC_008340	GCC	3	9	184896	184904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3110	NC_008340	GCC	3	9	184937	184945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
3111	NC_008340	ATG	2	6	185026	185031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319318
3112	NC_008340	CAG	2	6	185090	185095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319319
3113	NC_008340	GCC	2	6	185100	185105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319319
3114	NC_008340	CGT	2	6	185149	185154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319319
3115	NC_008340	GCA	2	6	185179	185184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319319
3116	NC_008340	AGA	2	6	185207	185212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319319
3117	NC_008340	CGG	2	6	185230	185235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319319
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3119	NC_008340	GCT	2	6	185365	185370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319319
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3473	NC_008340	TGG	2	6	204760	204765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319335
3474	NC_008340	GCC	2	6	204783	204788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319335
3475	NC_008340	CCG	2	6	204869	204874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319335
3476	NC_008340	TTC	2	6	204895	204900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319335
3477	NC_008340	CTG	2	6	204943	204948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319335
3478	NC_008340	CGC	3	9	204957	204965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319335
3479	NC_008340	GCT	2	6	204972	204977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319335
3480	NC_008340	TTC	2	6	204982	204987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319335
3481	NC_008340	CAT	2	6	205065	205070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319335
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3483	NC_008340	GTT	2	6	205101	205106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319335
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3485	NC_008340	TGG	2	6	205205	205210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319335
3486	NC_008340	GTG	2	6	205213	205218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319335
3487	NC_008340	GCT	2	6	205221	205226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319335
3488	NC_008340	TCG	2	6	205244	205249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319335
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3497	NC_008340	TGG	2	6	205670	205675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319336
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