MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 30843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020834	ACA	2	6	329013	329018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335574
4002	NC_020834	CTG	2	6	329101	329106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335574
4003	NC_020834	CGT	2	6	329123	329128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335574
4004	NC_020834	AAT	2	6	329168	329173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335574
4005	NC_020834	CAT	2	6	329227	329232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_020834	TAC	2	6	329339	329344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335575
4007	NC_020834	CTG	2	6	329351	329356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335575
4008	NC_020834	TAA	2	6	329451	329456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335575
4009	NC_020834	CAA	3	9	329492	329500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335575
4010	NC_020834	TCT	2	6	329710	329715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335575
4011	NC_020834	AGT	2	6	329784	329789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335575
4012	NC_020834	CAT	2	6	329823	329828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335575
4013	NC_020834	ACC	2	6	329889	329894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335575
4014	NC_020834	CTT	2	6	329906	329911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335575
4015	NC_020834	GTG	2	6	329918	329923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335575
4016	NC_020834	TCC	2	6	329946	329951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335575
4017	NC_020834	GCT	2	6	329989	329994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335575
4018	NC_020834	ATT	2	6	330096	330101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335575
4019	NC_020834	TAA	3	9	330218	330226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335575
4020	NC_020834	CGG	2	6	330242	330247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335575
4021	NC_020834	GGT	2	6	330407	330412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_020834	ACC	2	6	330923	330928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335576
4023	NC_020834	GAA	2	6	331021	331026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335576
4024	NC_020834	GGT	2	6	331156	331161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335576
4025	NC_020834	TGG	2	6	331290	331295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335576
4026	NC_020834	ATT	2	6	331322	331327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335576
4027	NC_020834	GTG	2	6	331355	331360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335576
4028	NC_020834	CTT	2	6	331431	331436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335576
4029	NC_020834	GTA	2	6	331561	331566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335576
4030	NC_020834	TGG	2	6	331581	331586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335576
4031	NC_020834	ATG	2	6	331828	331833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335576
4032	NC_020834	TTG	2	6	331844	331849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335576
4033	NC_020834	TTA	2	6	331942	331947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335576
4034	NC_020834	TTA	2	6	332024	332029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335576
4035	NC_020834	AAT	2	6	332165	332170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335577
4036	NC_020834	AGA	2	6	332282	332287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335577
4037	NC_020834	TGG	2	6	332389	332394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335577
4038	NC_020834	CAC	2	6	332424	332429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335577
4039	NC_020834	CCA	2	6	332500	332505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335577
4040	NC_020834	GGT	2	6	332625	332630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335577
4041	NC_020834	TAT	2	6	332653	332658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335577
4042	NC_020834	ATG	2	6	332811	332816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335577
4043	NC_020834	TCG	2	6	332935	332940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335577
4044	NC_020834	GAC	2	6	332951	332956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335577
4045	NC_020834	TGA	2	6	332972	332977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335577
4046	NC_020834	TGC	2	6	333032	333037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335577
4047	NC_020834	GTG	2	6	333043	333048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335577
4048	NC_020834	ATT	2	6	333050	333055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335577
4049	NC_020834	CTT	2	6	333077	333082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335577
4050	NC_020834	GAA	2	6	333231	333236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335577
4051	NC_020834	CCG	2	6	333278	333283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335577
4052	NC_020834	GAG	2	6	333327	333332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335577
4053	NC_020834	AAG	2	6	333373	333378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335577
4054	NC_020834	ACT	2	6	333582	333587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335577
4055	NC_020834	ATT	2	6	333623	333628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335577
4056	NC_020834	TTC	2	6	333878	333883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335578
4057	NC_020834	GCA	2	6	333942	333947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335578
4058	NC_020834	AGA	2	6	334168	334173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335578
4059	NC_020834	TGC	2	6	334305	334310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335579
4060	NC_020834	TGC	2	6	334421	334426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335579
4061	NC_020834	TTG	2	6	334478	334483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335579
4062	NC_020834	CCA	2	6	334595	334600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335579
4063	NC_020834	ACC	2	6	334749	334754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335579
4064	NC_020834	GCT	2	6	334770	334775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335579
4065	NC_020834	AAT	2	6	334829	334834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335579
4066	NC_020834	CTA	2	6	334875	334880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_020834	TAT	2	6	334992	334997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_020834	TGA	2	6	335000	335005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_020834	ATT	2	6	335211	335216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335580
4070	NC_020834	TGC	2	6	335225	335230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335580
4071	NC_020834	GTG	2	6	335257	335262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335580
4072	NC_020834	TTA	2	6	335367	335372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335580
4073	NC_020834	GTG	2	6	335611	335616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335581
4074	NC_020834	GAA	2	6	335638	335643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335581
4075	NC_020834	TGA	2	6	335817	335822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335581
4076	NC_020834	ATT	2	6	335836	335841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_020834	CGC	2	6	335903	335908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335582
4078	NC_020834	GCT	2	6	335916	335921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335582
4079	NC_020834	AGT	2	6	336050	336055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335582
4080	NC_020834	ATG	2	6	336129	336134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335582
4081	NC_020834	TCA	2	6	336300	336305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335582
4082	NC_020834	AAC	2	6	336311	336316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335582
4083	NC_020834	GGT	2	6	336354	336359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335582
4084	NC_020834	GCT	2	6	336454	336459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335582
4085	NC_020834	ACA	2	6	336788	336793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335582
4086	NC_020834	AGA	2	6	336875	336880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335582
4087	NC_020834	GTG	2	6	336997	337002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335582
4088	NC_020834	ATG	2	6	337017	337022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335582
4089	NC_020834	TTA	2	6	337035	337040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335582
4090	NC_020834	TGG	2	6	337153	337158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335582
4091	NC_020834	CAA	2	6	337304	337309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335582
4092	NC_020834	GGC	2	6	337317	337322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335582
4093	NC_020834	CAG	2	6	337405	337410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335582
4094	NC_020834	GCT	2	6	337413	337418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335582
4095	NC_020834	TTC	2	6	337426	337431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335582
4096	NC_020834	AAG	2	6	337453	337458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335582
4097	NC_020834	TAG	2	6	337546	337551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335582
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4099	NC_020834	TTA	2	6	337596	337601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335582
4100	NC_020834	TAC	2	6	337728	337733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335582
4101	NC_020834	GGT	2	6	337838	337843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335582
4102	NC_020834	GAA	2	6	337923	337928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335582
4103	NC_020834	ACC	2	6	337985	337990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335582
4104	NC_020834	GAA	2	6	338007	338012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335582
4105	NC_020834	CCG	2	6	338072	338077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335582
4106	NC_020834	ATG	2	6	338131	338136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335582
4107	NC_020834	GTG	2	6	338188	338193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335582
4108	NC_020834	TAA	2	6	338225	338230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335582
4109	NC_020834	TTC	2	6	338259	338264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335582
4110	NC_020834	CAA	2	6	338282	338287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335582
4111	NC_020834	GTG	2	6	338352	338357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335582
4112	NC_020834	ATT	2	6	338379	338384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_020834	TCG	2	6	338472	338477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335583
4114	NC_020834	CAA	3	9	338548	338556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335583
4115	NC_020834	GTC	2	6	339092	339097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335583
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4118	NC_020834	AAT	2	6	339356	339361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335583
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4120	NC_020834	ATT	2	6	339465	339470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335584
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4241	NC_020834	TGA	2	6	350625	350630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335596
4242	NC_020834	TGT	2	6	350646	350651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335596
4243	NC_020834	CAG	2	6	350729	350734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335596
4244	NC_020834	TCA	2	6	350760	350765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335596
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4255	NC_020834	TAC	2	6	351920	351925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335597
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4260	NC_020834	AAT	2	6	352237	352242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335598
4261	NC_020834	TTC	2	6	352528	352533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335598
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4272	NC_020834	TGC	2	6	353522	353527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335600
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4303	NC_020834	ACC	2	6	355615	355620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335602
4304	NC_020834	GGT	2	6	355621	355626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335602
4305	NC_020834	GGT	2	6	355899	355904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335602
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4308	NC_020834	TCA	2	6	356159	356164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335602
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4319	NC_020834	TCA	2	6	356930	356935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335604
4320	NC_020834	TCA	2	6	356941	356946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335604
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4322	NC_020834	TCA	2	6	357382	357387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335605
4323	NC_020834	GAC	2	6	357415	357420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335605
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4325	NC_020834	TGA	2	6	357564	357569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335605
4326	NC_020834	TAT	2	6	357771	357776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335605
4327	NC_020834	ATT	2	6	357915	357920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335605
4328	NC_020834	GTT	2	6	357933	357938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335605
4329	NC_020834	CAA	2	6	358030	358035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335605
4330	NC_020834	AGC	2	6	358037	358042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335605
4331	NC_020834	GAA	2	6	358048	358053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335605
4332	NC_020834	GAA	2	6	358059	358064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335605
4333	NC_020834	GAA	2	6	358303	358308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4334	NC_020834	GAT	2	6	358341	358346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4335	NC_020834	GCT	2	6	358502	358507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335606
4336	NC_020834	GTG	2	6	358568	358573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335606
4337	NC_020834	TTC	2	6	358835	358840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335606
4338	NC_020834	AAT	2	6	358925	358930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335606
4339	NC_020834	TGA	2	6	358957	358962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335606
4340	NC_020834	CCA	2	6	358987	358992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335606
4341	NC_020834	GCC	2	6	359240	359245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335606
4342	NC_020834	TCA	2	6	359248	359253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335606
4343	NC_020834	CCG	2	6	359311	359316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335606
4344	NC_020834	ATG	2	6	359355	359360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335606
4345	NC_020834	CAC	2	6	359369	359374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335606
4346	NC_020834	ATT	2	6	359546	359551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335606
4347	NC_020834	TGA	2	6	359614	359619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335606
4348	NC_020834	GTC	2	6	359633	359638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335606
4349	NC_020834	AAG	2	6	359640	359645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335606
4350	NC_020834	TGA	2	6	359670	359675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335606
4351	NC_020834	TCA	2	6	359698	359703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335606
4352	NC_020834	ACT	2	6	359707	359712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335606
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4354	NC_020834	ATT	2	6	360129	360134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335607
4355	NC_020834	ATT	2	6	360285	360290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335607
4356	NC_020834	ATA	2	6	360579	360584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335607
4357	NC_020834	GAA	2	6	360646	360651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335607
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