MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 30843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020834	TCT	2	6	371037	371042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335615
4502	NC_020834	ATA	2	6	371185	371190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335615
4503	NC_020834	TGC	2	6	371232	371237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335615
4504	NC_020834	GTA	2	6	371273	371278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335615
4505	NC_020834	GAA	2	6	371316	371321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335615
4506	NC_020834	ACA	2	6	371341	371346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335615
4507	NC_020834	TAG	2	6	371397	371402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335615
4508	NC_020834	CCA	2	6	371414	371419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335615
4509	NC_020834	GCT	2	6	371548	371553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335615
4510	NC_020834	CTA	2	6	371555	371560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335615
4511	NC_020834	TGC	2	6	371804	371809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335616
4512	NC_020834	GTT	2	6	371986	371991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335616
4513	NC_020834	TTC	2	6	372011	372016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335616
4514	NC_020834	TAA	2	6	372104	372109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335616
4515	NC_020834	AAT	2	6	372176	372181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335616
4516	NC_020834	CTG	2	6	372436	372441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335616
4517	NC_020834	ACG	2	6	372443	372448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335616
4518	NC_020834	TCC	2	6	372508	372513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_020834	TAA	2	6	372715	372720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335617
4520	NC_020834	GGT	2	6	372727	372732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335617
4521	NC_020834	TCA	2	6	372770	372775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335617
4522	NC_020834	GAT	2	6	372830	372835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335617
4523	NC_020834	ATC	2	6	372836	372841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335617
4524	NC_020834	ATT	2	6	373186	373191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335617
4525	NC_020834	GAG	2	6	373214	373219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335617
4526	NC_020834	CGG	2	6	373297	373302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335617
4527	NC_020834	TGA	2	6	373321	373326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335617
4528	NC_020834	GCT	2	6	373331	373336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335617
4529	NC_020834	ATA	2	6	373348	373353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335617
4530	NC_020834	TAT	2	6	373417	373422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_020834	CAA	2	6	373436	373441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335618
4532	NC_020834	CTG	2	6	373465	373470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335618
4533	NC_020834	TGT	2	6	373498	373503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335618
4534	NC_020834	TTG	2	6	373610	373615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335618
4535	NC_020834	TTC	2	6	373769	373774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335618
4536	NC_020834	GTT	2	6	373787	373792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335618
4537	NC_020834	GGC	2	6	373795	373800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335618
4538	NC_020834	CGG	2	6	373945	373950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335618
4539	NC_020834	AGT	2	6	374032	374037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335618
4540	NC_020834	CAT	2	6	374113	374118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335618
4541	NC_020834	AAT	2	6	374202	374207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335618
4542	NC_020834	CCG	2	6	374290	374295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335618
4543	NC_020834	CCA	2	6	374379	374384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335618
4544	NC_020834	AAT	2	6	374415	374420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335618
4545	NC_020834	ATC	2	6	374435	374440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335618
4546	NC_020834	AAT	2	6	374571	374576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335618
4547	NC_020834	TCA	2	6	374577	374582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335618
4548	NC_020834	TTC	2	6	374672	374677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335618
4549	NC_020834	TGT	2	6	374689	374694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335618
4550	NC_020834	ACC	2	6	374836	374841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335619
4551	NC_020834	TCA	2	6	374925	374930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335619
4552	NC_020834	CTG	2	6	375082	375087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335619
4553	NC_020834	ACC	2	6	375190	375195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335619
4554	NC_020834	ATG	2	6	375257	375262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335619
4555	NC_020834	ACA	2	6	375355	375360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335620
4556	NC_020834	GCG	2	6	375419	375424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335620
4557	NC_020834	CGG	2	6	375487	375492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335620
4558	NC_020834	TGG	2	6	375495	375500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335620
4559	NC_020834	ACA	2	6	375507	375512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335620
4560	NC_020834	TGA	2	6	375759	375764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335620
4561	NC_020834	ATT	2	6	375873	375878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335620
4562	NC_020834	TGA	3	9	375907	375915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335620
4563	NC_020834	AAC	2	6	375930	375935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335620
4564	NC_020834	AGC	2	6	376023	376028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335620
4565	NC_020834	CAA	2	6	376121	376126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335620
4566	NC_020834	GCG	2	6	376181	376186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335620
4567	NC_020834	ATC	2	6	376284	376289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335620
4568	NC_020834	GTG	2	6	376389	376394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335620
4569	NC_020834	GTG	2	6	376544	376549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335620
4570	NC_020834	TGT	2	6	376551	376556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335620
4571	NC_020834	CTA	2	6	376647	376652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335620
4572	NC_020834	CCG	2	6	377080	377085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335620
4573	NC_020834	CAA	2	6	377261	377266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335620
4574	NC_020834	TTC	2	6	377285	377290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335620
4575	NC_020834	CAT	2	6	377314	377319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335620
4576	NC_020834	ACA	2	6	377449	377454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335620
4577	NC_020834	TTA	2	6	377474	377479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335620
4578	NC_020834	GTA	2	6	377760	377765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_020834	ATT	2	6	377891	377896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335621
4580	NC_020834	CCT	2	6	377920	377925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335621
4581	NC_020834	GAA	2	6	377946	377951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335621
4582	NC_020834	GCA	2	6	377956	377961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335621
4583	NC_020834	ATT	2	6	377963	377968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335621
4584	NC_020834	TAA	2	6	377991	377996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335621
4585	NC_020834	ATA	2	6	378077	378082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335621
4586	NC_020834	ATT	2	6	378109	378114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335621
4587	NC_020834	GAT	2	6	378118	378123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335621
4588	NC_020834	GCA	2	6	378196	378201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335621
4589	NC_020834	TGA	2	6	378213	378218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335621
4590	NC_020834	AAG	2	6	378278	378283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335621
4591	NC_020834	ATG	2	6	378337	378342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335621
4592	NC_020834	TAT	2	6	378376	378381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335621
4593	NC_020834	TGA	2	6	378438	378443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335621
4594	NC_020834	TGA	2	6	378462	378467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335621
4595	NC_020834	GTT	2	6	378525	378530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335621
4596	NC_020834	TCC	2	6	378550	378555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335621
4597	NC_020834	TAT	2	6	378589	378594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335621
4598	NC_020834	ATG	2	6	378743	378748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335622
4599	NC_020834	ATT	2	6	378956	378961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335622
4600	NC_020834	TTA	3	9	378966	378974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335622
4601	NC_020834	CAA	2	6	379070	379075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335622
4602	NC_020834	ATA	2	6	379122	379127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335622
4603	NC_020834	TTA	2	6	379148	379153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335622
4604	NC_020834	TCT	2	6	379183	379188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335622
4605	NC_020834	ATT	2	6	379219	379224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335622
4606	NC_020834	TGT	2	6	379350	379355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335622
4607	NC_020834	TAT	2	6	379516	379521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335622
4608	NC_020834	TAT	2	6	379525	379530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335622
4609	NC_020834	ATT	2	6	379573	379578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335622
4610	NC_020834	TAC	2	6	379755	379760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335622
4611	NC_020834	TAT	2	6	379783	379788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335622
4612	NC_020834	GCT	2	6	379889	379894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335623
4613	NC_020834	CAT	2	6	379957	379962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335623
4614	NC_020834	ATC	2	6	380252	380257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335623
4615	NC_020834	ATA	2	6	380258	380263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335623
4616	NC_020834	TCA	2	6	380375	380380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335623
4617	NC_020834	TAA	2	6	380487	380492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335623
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4619	NC_020834	ATT	2	6	380723	380728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335623
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