MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 30843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020834	CTG	2	6	82279	82284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335322
1002	NC_020834	AGC	2	6	82319	82324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335322
1003	NC_020834	ATA	2	6	82392	82397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335322
1004	NC_020834	AAT	2	6	82403	82408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335322
1005	NC_020834	ACG	2	6	82433	82438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335322
1006	NC_020834	TTG	2	6	82454	82459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335322
1007	NC_020834	TTA	2	6	82617	82622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335323
1008	NC_020834	AGA	2	6	82719	82724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020834	ATC	2	6	82736	82741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335324
1010	NC_020834	ACC	2	6	82755	82760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335324
1011	NC_020834	TCA	2	6	82983	82988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335324
1012	NC_020834	ATA	2	6	83040	83045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335324
1013	NC_020834	ATA	2	6	83070	83075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335324
1014	NC_020834	AGT	2	6	83086	83091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335324
1015	NC_020834	ACC	2	6	83114	83119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335324
1016	NC_020834	CCT	2	6	83133	83138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335324
1017	NC_020834	TTG	2	6	83216	83221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335324
1018	NC_020834	TGA	2	6	83341	83346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335324
1019	NC_020834	TAC	2	6	83357	83362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335324
1020	NC_020834	AGC	2	6	83369	83374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335324
1021	NC_020834	GGC	2	6	83456	83461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335324
1022	NC_020834	GAC	2	6	83564	83569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335324
1023	NC_020834	ATT	2	6	83627	83632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335324
1024	NC_020834	GAA	2	6	83708	83713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335324
1025	NC_020834	GGT	2	6	83738	83743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335324
1026	NC_020834	AGT	2	6	83845	83850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335324
1027	NC_020834	TTC	2	6	83900	83905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335324
1028	NC_020834	CTT	2	6	84004	84009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335324
1029	NC_020834	CAG	2	6	84019	84024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335324
1030	NC_020834	CAT	2	6	84043	84048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335324
1031	NC_020834	TGT	2	6	84159	84164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335324
1032	NC_020834	TGA	2	6	84204	84209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020834	CTC	2	6	84469	84474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335325
1034	NC_020834	CAT	2	6	84510	84515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335325
1035	NC_020834	CTT	2	6	84549	84554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335325
1036	NC_020834	TGT	2	6	84605	84610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335325
1037	NC_020834	GCA	2	6	84614	84619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335325
1038	NC_020834	GGC	2	6	84622	84627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335325
1039	NC_020834	CTT	2	6	84639	84644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335325
1040	NC_020834	TTA	2	6	84716	84721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335325
1041	NC_020834	CAC	2	6	84900	84905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335325
1042	NC_020834	CGC	2	6	84964	84969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335325
1043	NC_020834	CAT	2	6	85048	85053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335325
1044	NC_020834	TGG	2	6	85205	85210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335325
1045	NC_020834	TGA	2	6	85260	85265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335325
1046	NC_020834	GCC	2	6	85300	85305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335325
1047	NC_020834	AAT	2	6	85320	85325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335325
1048	NC_020834	CTT	2	6	85600	85605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_020834	TTG	2	6	85685	85690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020834	TGT	2	6	85700	85705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020834	TCA	2	6	85744	85749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335326
1052	NC_020834	CAC	2	6	85935	85940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335326
1053	NC_020834	CTT	2	6	86046	86051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335327
1054	NC_020834	ACC	2	6	86081	86086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335327
1055	NC_020834	CAC	2	6	86176	86181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335327
1056	NC_020834	AGT	2	6	86397	86402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335327
1057	NC_020834	ACC	2	6	86452	86457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335327
1058	NC_020834	TGC	2	6	86476	86481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335327
1059	NC_020834	TCA	2	6	86496	86501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335327
1060	NC_020834	GCC	2	6	86512	86517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335327
1061	NC_020834	GCT	2	6	86543	86548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335327
1062	NC_020834	CTG	2	6	86556	86561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335327
1063	NC_020834	GTA	2	6	86590	86595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335327
1064	NC_020834	CAC	2	6	86629	86634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335327
1065	NC_020834	CCG	2	6	86664	86669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335327
1066	NC_020834	CCA	2	6	86736	86741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335327
1067	NC_020834	TCC	2	6	86803	86808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335327
1068	NC_020834	TCA	2	6	86891	86896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335327
1069	NC_020834	AAT	2	6	86954	86959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335327
1070	NC_020834	ATT	2	6	86996	87001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335328
1071	NC_020834	GAA	2	6	87088	87093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335328
1072	NC_020834	GCC	2	6	87189	87194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335328
1073	NC_020834	CAC	2	6	87195	87200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335328
1074	NC_020834	CTT	2	6	87362	87367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335328
1075	NC_020834	TAA	2	6	87437	87442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335328
1076	NC_020834	ATA	2	6	87448	87453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335328
1077	NC_020834	CTT	2	6	87506	87511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335328
1078	NC_020834	AAT	2	6	87523	87528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335328
1079	NC_020834	CAT	3	9	87615	87623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335328
1080	NC_020834	CCG	2	6	87694	87699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335328
1081	NC_020834	ACT	2	6	87781	87786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335328
1082	NC_020834	AAG	2	6	87898	87903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335328
1083	NC_020834	GAT	2	6	87927	87932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335328
1084	NC_020834	TCT	2	6	88056	88061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335329
1085	NC_020834	ATG	2	6	88116	88121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335329
1086	NC_020834	GCA	2	6	88185	88190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335329
1087	NC_020834	TCA	2	6	88251	88256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335329
1088	NC_020834	ATC	2	6	88260	88265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335329
1089	NC_020834	TTG	2	6	88307	88312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335329
1090	NC_020834	ACC	2	6	88316	88321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335329
1091	NC_020834	TCT	2	6	88398	88403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335329
1092	NC_020834	CAC	2	6	88760	88765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335329
1093	NC_020834	TGG	2	6	88775	88780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335329
1094	NC_020834	TTC	2	6	88910	88915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335329
1095	NC_020834	AAT	2	6	88977	88982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335329
1096	NC_020834	TGT	2	6	89076	89081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335329
1097	NC_020834	ACA	2	6	89092	89097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335329
1098	NC_020834	TTC	2	6	89156	89161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335329
1099	NC_020834	GAA	2	6	89210	89215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335329
1100	NC_020834	TCA	2	6	89374	89379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335329
1101	NC_020834	GTG	2	6	89772	89777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335330
1102	NC_020834	CAA	2	6	90062	90067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335330
1103	NC_020834	CTG	2	6	90155	90160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335330
1104	NC_020834	TTG	2	6	90236	90241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020834	ATA	2	6	90321	90326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335331
1106	NC_020834	CAT	2	6	90506	90511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335331
1107	NC_020834	TAA	2	6	90566	90571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335331
1108	NC_020834	TGA	2	6	90609	90614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335331
1109	NC_020834	TAA	2	6	90686	90691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335331
1110	NC_020834	ACC	2	6	91012	91017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335332
1111	NC_020834	CTT	2	6	91056	91061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335332
1112	NC_020834	CTT	2	6	91077	91082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335332
1113	NC_020834	TGT	2	6	91174	91179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335332
1114	NC_020834	CAG	2	6	91218	91223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335332
1115	NC_020834	CTT	2	6	91236	91241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335332
1116	NC_020834	GTA	2	6	91255	91260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335332
1117	NC_020834	AGA	2	6	91284	91289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335332
1118	NC_020834	GGA	2	6	91607	91612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335332
1119	NC_020834	TAA	2	6	91633	91638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335332
1120	NC_020834	TCA	2	6	91680	91685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335332
1121	NC_020834	AAG	2	6	91729	91734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335332
1122	NC_020834	TTG	2	6	91774	91779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335332
1123	NC_020834	AAT	2	6	91811	91816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335332
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1487	NC_020834	ATC	2	6	122526	122531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1488	NC_020834	ACC	2	6	122785	122790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335367
1489	NC_020834	AGC	2	6	122957	122962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335367
1490	NC_020834	TTG	2	6	122990	122995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335367
1491	NC_020834	ACC	2	6	123018	123023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335367
1492	NC_020834	CTG	2	6	123038	123043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335367
1493	NC_020834	GTG	2	6	123517	123522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335367
1494	NC_020834	GGC	2	6	123597	123602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335367
1495	NC_020834	GTG	2	6	123652	123657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335367
1496	NC_020834	AAT	2	6	123668	123673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335367
1497	NC_020834	ATG	2	6	123684	123689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335368
1498	NC_020834	ACC	2	6	123717	123722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335368
1499	NC_020834	GTG	2	6	123822	123827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335368
1500	NC_020834	GAA	2	6	123966	123971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335368

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