MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 30843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020834	GGC	2	6	40701	40706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335278
502	NC_020834	CAG	2	6	40728	40733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335278
503	NC_020834	GCC	2	6	40755	40760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335278
504	NC_020834	CAT	2	6	40856	40861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335278
505	NC_020834	CTG	2	6	40973	40978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335278
506	NC_020834	GTG	2	6	41028	41033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335278
507	NC_020834	TTC	2	6	41117	41122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335278
508	NC_020834	CAA	2	6	41302	41307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335279
509	NC_020834	TGG	2	6	41438	41443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335279
510	NC_020834	TGG	2	6	41540	41545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335279
511	NC_020834	TTC	2	6	41615	41620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335279
512	NC_020834	AGT	2	6	41781	41786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335279
513	NC_020834	AGT	2	6	41798	41803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335279
514	NC_020834	GTT	2	6	41844	41849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335279
515	NC_020834	CGG	2	6	41963	41968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335279
516	NC_020834	TCA	2	6	41972	41977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335279
517	NC_020834	AAT	2	6	42127	42132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335279
518	NC_020834	GTG	2	6	42300	42305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335280
519	NC_020834	GTT	2	6	42319	42324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335280
520	NC_020834	CGG	2	6	42336	42341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335280
521	NC_020834	CGC	2	6	42373	42378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335280
522	NC_020834	GAA	2	6	42644	42649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335280
523	NC_020834	TGA	2	6	42736	42741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335280
524	NC_020834	CTT	2	6	42754	42759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335280
525	NC_020834	GAA	2	6	42764	42769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335280
526	NC_020834	AGC	2	6	42833	42838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335280
527	NC_020834	TCA	2	6	42952	42957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335280
528	NC_020834	GCC	2	6	43100	43105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335280
529	NC_020834	ATT	2	6	43157	43162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335280
530	NC_020834	ACC	2	6	43265	43270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335280
531	NC_020834	ACC	2	6	43290	43295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335280
532	NC_020834	TTG	2	6	43391	43396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335280
533	NC_020834	CGG	2	6	43414	43419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335280
534	NC_020834	CGG	2	6	43432	43437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335280
535	NC_020834	GTG	2	6	43489	43494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335280
536	NC_020834	CCG	2	6	43500	43505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335280
537	NC_020834	TCT	2	6	43557	43562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335280
538	NC_020834	GCA	2	6	43685	43690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335280
539	NC_020834	CCG	2	6	43728	43733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335280
540	NC_020834	ATC	2	6	43740	43745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335280
541	NC_020834	GCG	2	6	43955	43960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335280
542	NC_020834	TTC	2	6	44009	44014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335280
543	NC_020834	GTG	2	6	44066	44071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335280
544	NC_020834	CTT	2	6	44074	44079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335280
545	NC_020834	CGG	2	6	44151	44156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335280
546	NC_020834	TTC	2	6	44245	44250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335280
547	NC_020834	GTC	2	6	44297	44302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335280
548	NC_020834	CGC	2	6	44441	44446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335280
549	NC_020834	AGA	2	6	44489	44494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335280
550	NC_020834	ATC	2	6	44526	44531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335280
551	NC_020834	CCG	2	6	44571	44576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335280
552	NC_020834	ACC	2	6	44873	44878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335280
553	NC_020834	TGC	2	6	44939	44944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335280
554	NC_020834	CTT	2	6	45010	45015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335280
555	NC_020834	CTT	2	6	45292	45297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335280
556	NC_020834	AGT	2	6	45328	45333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335280
557	NC_020834	CAT	2	6	45565	45570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335281
558	NC_020834	TGA	2	6	45730	45735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335281
559	NC_020834	TGA	2	6	45780	45785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335281
560	NC_020834	AAT	2	6	45876	45881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335281
561	NC_020834	CAG	2	6	45976	45981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335281
562	NC_020834	TGT	2	6	46039	46044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335281
563	NC_020834	TGT	2	6	46086	46091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335281
564	NC_020834	TCT	2	6	46230	46235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335281
565	NC_020834	CTA	2	6	46246	46251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335281
566	NC_020834	CGG	2	6	46299	46304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335281
567	NC_020834	TTG	2	6	46334	46339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335281
568	NC_020834	GAG	2	6	46359	46364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335281
569	NC_020834	AAT	2	6	46403	46408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335281
570	NC_020834	TCT	2	6	46443	46448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335281
571	NC_020834	AAG	2	6	46507	46512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335281
572	NC_020834	ATC	2	6	46662	46667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335281
573	NC_020834	ATT	2	6	46809	46814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020834	AAT	2	6	46862	46867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020834	TGT	2	6	46898	46903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020834	GAA	2	6	46976	46981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020834	CAA	2	6	47011	47016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_020834	ATT	2	6	47070	47075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020834	GTG	2	6	47342	47347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335282
580	NC_020834	TAT	2	6	47370	47375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335282
581	NC_020834	TGT	2	6	47415	47420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335282
582	NC_020834	GTT	2	6	47421	47426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335282
583	NC_020834	ATT	2	6	47448	47453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335282
584	NC_020834	ATA	2	6	47459	47464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335282
585	NC_020834	CAC	2	6	47491	47496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335282
586	NC_020834	CAG	2	6	47535	47540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335283
587	NC_020834	TTC	2	6	47612	47617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335283
588	NC_020834	CAA	2	6	47673	47678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335283
589	NC_020834	TTG	2	6	47706	47711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335283
590	NC_020834	TAT	2	6	47812	47817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335283
591	NC_020834	TTA	2	6	48231	48236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335283
592	NC_020834	ATG	2	6	48257	48262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335283
593	NC_020834	CAA	2	6	48381	48386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_020834	CAA	2	6	48447	48452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335284
595	NC_020834	TTA	2	6	48470	48475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335284
596	NC_020834	GCT	2	6	48482	48487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335284
597	NC_020834	AGG	2	6	48732	48737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020834	TTG	2	6	48792	48797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335285
599	NC_020834	AGA	2	6	48841	48846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335285
600	NC_020834	AGA	2	6	48949	48954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335285
601	NC_020834	CAA	2	6	48978	48983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335285
602	NC_020834	CGT	2	6	48986	48991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335285
603	NC_020834	TAT	2	6	49042	49047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335285
604	NC_020834	AAG	2	6	49092	49097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335285
605	NC_020834	AAC	2	6	49175	49180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335285
606	NC_020834	ATT	2	6	49184	49189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335285
607	NC_020834	AGG	2	6	49216	49221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020834	GCA	2	6	49310	49315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335286
609	NC_020834	GCC	2	6	49332	49337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335286
610	NC_020834	TCA	2	6	49374	49379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335286
611	NC_020834	GTT	2	6	49557	49562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335286
612	NC_020834	AAG	2	6	49588	49593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335286
613	NC_020834	TCA	2	6	49647	49652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335286
614	NC_020834	ATG	3	9	49690	49698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335286
615	NC_020834	GTA	2	6	49711	49716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335286
616	NC_020834	TTA	2	6	50079	50084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335287
617	NC_020834	ATC	2	6	50319	50324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335287
618	NC_020834	GTG	2	6	50394	50399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335287
619	NC_020834	AGA	2	6	50408	50413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335287
620	NC_020834	CTG	2	6	50464	50469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335287
621	NC_020834	GTG	2	6	50527	50532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335287
622	NC_020834	GAT	2	6	50553	50558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335287
623	NC_020834	TTA	2	6	50598	50603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335287
624	NC_020834	TTA	2	6	50661	50666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335287
625	NC_020834	ATC	2	6	50757	50762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335287
626	NC_020834	GGT	2	6	50904	50909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335287
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