MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 30843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020834	CAC	2	6	206975	206980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335451
2502	NC_020834	TGA	2	6	206993	206998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335451
2503	NC_020834	GCT	2	6	207018	207023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335451
2504	NC_020834	GAA	2	6	207131	207136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335452
2505	NC_020834	ATC	2	6	207146	207151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335452
2506	NC_020834	TGA	2	6	207169	207174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335452
2507	NC_020834	GCA	2	6	207185	207190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335452
2508	NC_020834	GCC	2	6	207249	207254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335452
2509	NC_020834	GTC	2	6	207261	207266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335452
2510	NC_020834	GCT	2	6	207317	207322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335452
2511	NC_020834	AAG	2	6	207347	207352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335452
2512	NC_020834	TAA	2	6	207362	207367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335452
2513	NC_020834	GAA	2	6	207524	207529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335453
2514	NC_020834	GTT	2	6	207551	207556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335453
2515	NC_020834	GGT	2	6	207689	207694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335453
2516	NC_020834	GTT	2	6	207707	207712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335453
2517	NC_020834	TGC	2	6	207742	207747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335453
2518	NC_020834	CGG	2	6	207763	207768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335453
2519	NC_020834	ATA	2	6	207790	207795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335453
2520	NC_020834	AAG	2	6	207943	207948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335454
2521	NC_020834	ATA	2	6	208027	208032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335454
2522	NC_020834	CAG	2	6	208162	208167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335454
2523	NC_020834	ATT	2	6	208200	208205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335454
2524	NC_020834	GCA	2	6	208242	208247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335454
2525	NC_020834	TGA	2	6	208304	208309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335454
2526	NC_020834	AGT	2	6	208310	208315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335454
2527	NC_020834	GAA	2	6	208331	208336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335454
2528	NC_020834	CGT	2	6	208382	208387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335455
2529	NC_020834	AGC	3	9	208501	208509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335455
2530	NC_020834	GCA	2	6	208568	208573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335455
2531	NC_020834	TGC	2	6	208681	208686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335455
2532	NC_020834	GGT	2	6	208804	208809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335456
2533	NC_020834	TAT	2	6	208812	208817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335456
2534	NC_020834	AGT	2	6	208836	208841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335456
2535	NC_020834	CAG	2	6	208895	208900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335456
2536	NC_020834	TCG	2	6	208926	208931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335456
2537	NC_020834	ACA	2	6	208968	208973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335456
2538	NC_020834	ATC	2	6	209038	209043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335456
2539	NC_020834	TGG	2	6	209046	209051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335456
2540	NC_020834	GTT	2	6	209131	209136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335456
2541	NC_020834	CAA	2	6	209141	209146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335456
2542	NC_020834	TGC	2	6	209184	209189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335456
2543	NC_020834	GAA	2	6	209209	209214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335456
2544	NC_020834	CAG	2	6	209354	209359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335457
2545	NC_020834	TGG	2	6	209503	209508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335458
2546	NC_020834	GGC	2	6	209540	209545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335458
2547	NC_020834	TCG	2	6	209551	209556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335458
2548	NC_020834	GGT	2	6	209567	209572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335458
2549	NC_020834	TCG	2	6	209587	209592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335458
2550	NC_020834	AGC	2	6	209701	209706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335458
2551	NC_020834	CAT	2	6	209710	209715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335458
2552	NC_020834	AGT	2	6	209770	209775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335458
2553	NC_020834	GCT	2	6	209810	209815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335458
2554	NC_020834	GCT	2	6	209822	209827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335458
2555	NC_020834	GTA	2	6	209876	209881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020834	TAT	2	6	209990	209995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
2557	NC_020834	ACA	2	6	210009	210014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335459
2558	NC_020834	CAT	2	6	210024	210029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335459
2559	NC_020834	TGG	2	6	210051	210056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335459
2560	NC_020834	TAT	2	6	210090	210095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
2561	NC_020834	ATT	2	6	210115	210120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
2562	NC_020834	ATT	2	6	210126	210131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
2563	NC_020834	GTC	2	6	210182	210187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335459
2564	NC_020834	TTA	2	6	210223	210228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
2565	NC_020834	TAT	2	6	210302	210307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
2566	NC_020834	GTA	2	6	210322	210327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335459
2567	NC_020834	ATT	2	6	210409	210414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
2568	NC_020834	TTG	2	6	210425	210430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335459
2569	NC_020834	TAC	2	6	210500	210505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335459
2570	NC_020834	AAT	2	6	210513	210518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335459
2571	NC_020834	TGT	2	6	210540	210545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335459
2572	NC_020834	TTG	2	6	210548	210553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335459
2573	NC_020834	AGA	2	6	210565	210570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335459
2574	NC_020834	CAA	2	6	210595	210600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335459
2575	NC_020834	ATG	2	6	210607	210612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335459
2576	NC_020834	TAT	2	6	210687	210692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
2577	NC_020834	TGT	2	6	210792	210797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335459
2578	NC_020834	ATT	2	6	210798	210803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
2579	NC_020834	CAT	2	6	211008	211013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335459
2580	NC_020834	CGT	2	6	211016	211021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335459
2581	NC_020834	GGT	2	6	211045	211050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335459
2582	NC_020834	CAT	2	6	211052	211057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335459
2583	NC_020834	GTT	2	6	211072	211077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335459
2584	NC_020834	CAA	2	6	211120	211125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335459
2585	NC_020834	GAA	2	6	211140	211145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335459
2586	NC_020834	TAA	2	6	211179	211184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_020834	ATA	2	6	211430	211435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_020834	TGC	2	6	211547	211552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335461
2589	NC_020834	GAA	2	6	211617	211622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335461
2590	NC_020834	CGT	2	6	211653	211658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335461
2591	NC_020834	TCG	2	6	211718	211723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335461
2592	NC_020834	GGT	2	6	211960	211965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335462
2593	NC_020834	GCT	2	6	212002	212007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335462
2594	NC_020834	TGC	2	6	212013	212018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335462
2595	NC_020834	CAA	2	6	212102	212107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335462
2596	NC_020834	GCA	2	6	212122	212127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335462
2597	NC_020834	GTC	2	6	212180	212185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335462
2598	NC_020834	CGT	2	6	212197	212202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335462
2599	NC_020834	CGT	2	6	212273	212278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335463
2600	NC_020834	ATT	2	6	212463	212468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335463
2601	NC_020834	TAT	2	6	212517	212522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335463
2602	NC_020834	GCA	2	6	212564	212569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335463
2603	NC_020834	GTA	2	6	212612	212617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335463
2604	NC_020834	GTA	2	6	212627	212632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335463
2605	NC_020834	TGA	2	6	212659	212664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335463
2606	NC_020834	TGT	2	6	212665	212670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335463
2607	NC_020834	CAT	2	6	212712	212717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335463
2608	NC_020834	CGT	2	6	212792	212797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335463
2609	NC_020834	CAG	2	6	212817	212822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335463
2610	NC_020834	ATA	2	6	212860	212865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335463
2611	NC_020834	CGC	2	6	213023	213028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335464
2612	NC_020834	CAG	2	6	213097	213102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335464
2613	NC_020834	AAG	2	6	213105	213110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335464
2614	NC_020834	TAT	2	6	213135	213140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335464
2615	NC_020834	GAT	2	6	213179	213184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335464
2616	NC_020834	ATT	2	6	213185	213190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335464
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2977	NC_020834	AGC	2	6	240904	240909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335490
2978	NC_020834	ATC	2	6	240938	240943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335490
2979	NC_020834	GTG	3	9	240984	240992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335490
2980	NC_020834	CTG	2	6	241010	241015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335490
2981	NC_020834	CTT	2	6	241072	241077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335490
2982	NC_020834	TGG	2	6	241113	241118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335490
2983	NC_020834	CAC	2	6	241152	241157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335490
2984	NC_020834	ACA	2	6	241232	241237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335490
2985	NC_020834	ATT	2	6	241307	241312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335490
2986	NC_020834	CTA	2	6	241327	241332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335490
2987	NC_020834	TTC	2	6	241337	241342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335490
2988	NC_020834	GCA	2	6	241433	241438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335490
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2990	NC_020834	ATG	2	6	241822	241827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335491
2991	NC_020834	TGA	2	6	241884	241889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335491
2992	NC_020834	ATG	2	6	242096	242101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335491
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2998	NC_020834	TTG	2	6	242510	242515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335492
2999	NC_020834	TAA	2	6	242573	242578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335492
3000	NC_020834	GTT	2	6	242582	242587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335492

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