MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 30843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_020834	GTA	2	6	164832	164837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335407
2002	NC_020834	TCA	2	6	164964	164969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_020834	AGC	2	6	165092	165097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335408
2004	NC_020834	AGC	2	6	165170	165175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335408
2005	NC_020834	GTT	3	9	165233	165241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335408
2006	NC_020834	GGT	2	6	165242	165247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335408
2007	NC_020834	GGT	2	6	165317	165322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335408
2008	NC_020834	CCA	2	6	165334	165339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335408
2009	NC_020834	GCA	2	6	165423	165428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335408
2010	NC_020834	AGC	2	6	165431	165436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335408
2011	NC_020834	GAA	2	6	165537	165542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335408
2012	NC_020834	GGC	2	6	165626	165631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335408
2013	NC_020834	GTT	2	6	165720	165725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335408
2014	NC_020834	TGG	2	6	165751	165756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335408
2015	NC_020834	GAT	2	6	165882	165887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335408
2016	NC_020834	ATT	2	6	165955	165960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335409
2017	NC_020834	GAA	2	6	166111	166116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335409
2018	NC_020834	CAA	2	6	166123	166128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335409
2019	NC_020834	GGC	2	6	166248	166253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335409
2020	NC_020834	ACC	2	6	166367	166372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335409
2021	NC_020834	GTA	2	6	166528	166533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335409
2022	NC_020834	TGC	2	6	166536	166541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335409
2023	NC_020834	GGC	2	6	166626	166631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335409
2024	NC_020834	GGC	2	6	166642	166647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335409
2025	NC_020834	GGC	2	6	166734	166739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335409
2026	NC_020834	CGG	2	6	166911	166916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335409
2027	NC_020834	TTA	2	6	166994	166999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335409
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2029	NC_020834	TTC	2	6	167155	167160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335409
2030	NC_020834	TAC	2	6	167580	167585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335410
2031	NC_020834	GGT	2	6	167666	167671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335410
2032	NC_020834	AGA	2	6	167711	167716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335410
2033	NC_020834	GAA	2	6	167721	167726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335410
2034	NC_020834	GCA	2	6	167830	167835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335411
2035	NC_020834	GAT	2	6	167844	167849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335411
2036	NC_020834	GCA	2	6	167941	167946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335411
2037	NC_020834	GTT	2	6	167988	167993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335411
2038	NC_020834	GCC	2	6	168202	168207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335411
2039	NC_020834	ACT	2	6	168350	168355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335411
2040	NC_020834	CAA	2	6	168492	168497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335411
2041	NC_020834	ACC	2	6	168556	168561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335411
2042	NC_020834	GAT	2	6	168599	168604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_020834	ACA	2	6	168625	168630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_020834	TAG	2	6	168849	168854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335412
2045	NC_020834	GTT	2	6	168919	168924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335412
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2047	NC_020834	TAG	2	6	169194	169199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335412
2048	NC_020834	AGT	2	6	169267	169272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335412
2049	NC_020834	CTT	2	6	169335	169340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335412
2050	NC_020834	CAA	2	6	169404	169409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335412
2051	NC_020834	AGA	2	6	169540	169545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335412
2052	NC_020834	ATT	2	6	169580	169585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335412
2053	NC_020834	ATT	2	6	169711	169716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335412
2054	NC_020834	GCA	2	6	169721	169726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335412
2055	NC_020834	TAC	3	9	169753	169761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335412
2056	NC_020834	AGC	2	6	169786	169791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335412
2057	NC_020834	CTT	2	6	169817	169822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335412
2058	NC_020834	TTC	2	6	169895	169900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335412
2059	NC_020834	GTT	2	6	169973	169978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335412
2060	NC_020834	ATT	2	6	169982	169987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335412
2061	NC_020834	AAT	2	6	170322	170327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335413
2062	NC_020834	ATT	2	6	170370	170375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335413
2063	NC_020834	TAA	2	6	170426	170431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335413
2064	NC_020834	GAT	2	6	170643	170648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335413
2065	NC_020834	GCC	2	6	170892	170897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335413
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2067	NC_020834	ATT	2	6	171086	171091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335413
2068	NC_020834	CCA	2	6	171139	171144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335413
2069	NC_020834	GGC	2	6	171155	171160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335413
2070	NC_020834	AAT	2	6	171324	171329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335413
2071	NC_020834	ATA	2	6	171337	171342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335413
2072	NC_020834	GGT	2	6	171379	171384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335413
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2079	NC_020834	CTA	2	6	171955	171960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335414
2080	NC_020834	ATT	3	9	172180	172188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2081	NC_020834	CAA	2	6	172295	172300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335415
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2090	NC_020834	ATT	2	6	173422	173427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335415
2091	NC_020834	CAA	2	6	173429	173434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335415
2092	NC_020834	AAC	2	6	173558	173563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335415
2093	NC_020834	GGT	2	6	173717	173722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335415
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2099	NC_020834	GGA	2	6	174071	174076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335415
2100	NC_020834	GTT	2	6	174111	174116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_020834	TTA	2	6	174229	174234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335416
2102	NC_020834	GTA	2	6	174292	174297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335416
2103	NC_020834	GGA	2	6	174298	174303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335416
2104	NC_020834	AGT	2	6	174387	174392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335416
2105	NC_020834	ATT	2	6	174526	174531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335416
2106	NC_020834	ATG	2	6	174551	174556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335416
2107	NC_020834	ATG	2	6	174563	174568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335416
2108	NC_020834	ATC	2	6	174668	174673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335416
2109	NC_020834	TCT	2	6	174677	174682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335416
2110	NC_020834	TAT	2	6	174684	174689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335416
2111	NC_020834	CAT	2	6	174902	174907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335417
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2115	NC_020834	GTG	2	6	175312	175317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335417
2116	NC_020834	ATG	2	6	175351	175356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335417
2117	NC_020834	TCA	2	6	175394	175399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335417
2118	NC_020834	CAT	2	6	175469	175474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_020834	TAA	2	6	175544	175549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_020834	ACT	2	6	175647	175652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335418
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2122	NC_020834	ACT	2	6	175830	175835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335418
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2355	NC_020834	ATC	2	6	194699	194704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335440
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2357	NC_020834	ATT	2	6	194943	194948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335441
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2482	NC_020834	GTA	2	6	205714	205719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2483	NC_020834	CGT	2	6	205884	205889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335449
2484	NC_020834	GCT	2	6	205893	205898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335449
2485	NC_020834	AAG	2	6	205927	205932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335449
2486	NC_020834	GTT	2	6	205977	205982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335449
2487	NC_020834	AAG	2	6	205992	205997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335449
2488	NC_020834	TCG	2	6	206003	206008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335449
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2491	NC_020834	CAT	2	6	206298	206303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335450
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2497	NC_020834	AGT	2	6	206540	206545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2499	NC_020834	AGC	2	6	206678	206683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335451
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