MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 30843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020834	CGG	2	6	123994	123999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335368
1502	NC_020834	GCA	2	6	124106	124111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335368
1503	NC_020834	AAC	2	6	124171	124176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335368
1504	NC_020834	GGA	2	6	124326	124331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020834	AAG	2	6	124508	124513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335369
1506	NC_020834	GTG	2	6	124540	124545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335369
1507	NC_020834	GGT	2	6	124731	124736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335369
1508	NC_020834	ATG	2	6	124780	124785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335369
1509	NC_020834	ATG	2	6	124816	124821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335369
1510	NC_020834	CAC	2	6	124835	124840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335369
1511	NC_020834	TTG	2	6	124847	124852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335369
1512	NC_020834	TTC	2	6	124894	124899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335369
1513	NC_020834	TGG	2	6	125072	125077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335369
1514	NC_020834	CAT	2	6	125145	125150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335369
1515	NC_020834	GAT	2	6	125251	125256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335369
1516	NC_020834	CAA	2	6	125266	125271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335369
1517	NC_020834	GTG	2	6	125450	125455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335369
1518	NC_020834	CAA	2	6	125530	125535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335369
1519	NC_020834	GAC	2	6	125548	125553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335369
1520	NC_020834	ATC	2	6	125555	125560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335369
1521	NC_020834	TCT	2	6	125567	125572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335369
1522	NC_020834	TGA	2	6	125663	125668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335369
1523	NC_020834	GAT	2	6	125796	125801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335369
1524	NC_020834	GGT	2	6	125830	125835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335369
1525	NC_020834	TAT	2	6	125903	125908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335369
1526	NC_020834	GTA	2	6	125911	125916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335369
1527	NC_020834	TGA	2	6	126023	126028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335369
1528	NC_020834	CCG	2	6	126047	126052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335369
1529	NC_020834	TTC	2	6	126069	126074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335369
1530	NC_020834	CTC	2	6	126208	126213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_020834	TTG	2	6	126260	126265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335370
1532	NC_020834	GTT	2	6	126559	126564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335371
1533	NC_020834	TTA	2	6	126588	126593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335371
1534	NC_020834	ATG	2	6	126639	126644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335371
1535	NC_020834	TTA	2	6	126654	126659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335371
1536	NC_020834	AAT	2	6	126717	126722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335371
1537	NC_020834	CCA	2	6	126762	126767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335372
1538	NC_020834	AAC	2	6	126931	126936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335372
1539	NC_020834	CTT	2	6	126945	126950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335372
1540	NC_020834	AGG	2	6	127084	127089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020834	CCT	2	6	127136	127141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_020834	TAT	2	6	127388	127393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020834	CAT	2	6	127476	127481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_020834	GCT	2	6	127483	127488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_020834	TAT	2	6	127596	127601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335373
1546	NC_020834	GAA	2	6	127627	127632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335373
1547	NC_020834	ACT	2	6	127819	127824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335374
1548	NC_020834	CGG	2	6	127919	127924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335374
1549	NC_020834	TGG	2	6	127925	127930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335374
1550	NC_020834	ACC	2	6	127987	127992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335374
1551	NC_020834	TGG	2	6	128027	128032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335374
1552	NC_020834	TGG	2	6	128126	128131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335374
1553	NC_020834	TAA	2	6	128370	128375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335375
1554	NC_020834	CCG	2	6	128411	128416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335375
1555	NC_020834	CCA	2	6	128429	128434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335375
1556	NC_020834	GGC	2	6	128443	128448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335375
1557	NC_020834	CGG	2	6	128475	128480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335375
1558	NC_020834	TAA	2	6	128533	128538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335375
1559	NC_020834	CCA	2	6	128612	128617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335375
1560	NC_020834	CAC	2	6	128709	128714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335375
1561	NC_020834	CCA	2	6	128886	128891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335375
1562	NC_020834	CCA	2	6	129040	129045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335375
1563	NC_020834	CCA	2	6	129115	129120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335375
1564	NC_020834	GGC	2	6	129133	129138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335375
1565	NC_020834	AAT	2	6	129193	129198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335375
1566	NC_020834	CAA	2	6	129318	129323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335375
1567	NC_020834	ATA	2	6	129335	129340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335375
1568	NC_020834	GGA	2	6	129505	129510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335376
1569	NC_020834	CTT	2	6	129531	129536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335376
1570	NC_020834	TGA	2	6	129549	129554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335376
1571	NC_020834	TTC	2	6	129748	129753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335376
1572	NC_020834	ATG	2	6	129839	129844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335376
1573	NC_020834	GTA	2	6	130041	130046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335376
1574	NC_020834	CTT	2	6	130122	130127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335376
1575	NC_020834	CAT	2	6	130180	130185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335376
1576	NC_020834	TAA	2	6	130188	130193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335376
1577	NC_020834	CAG	2	6	130348	130353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335376
1578	NC_020834	CAA	2	6	130402	130407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335376
1579	NC_020834	TGT	2	6	130448	130453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335376
1580	NC_020834	AAT	2	6	130636	130641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335376
1581	NC_020834	TTC	2	6	130654	130659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335376
1582	NC_020834	ATA	2	6	130743	130748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335376
1583	NC_020834	TCA	2	6	130752	130757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335376
1584	NC_020834	CAC	2	6	130782	130787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335376
1585	NC_020834	ATT	2	6	130828	130833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335376
1586	NC_020834	TTC	2	6	130868	130873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335376
1587	NC_020834	TAA	2	6	130879	130884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335376
1588	NC_020834	TCA	2	6	131009	131014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335377
1589	NC_020834	ACA	2	6	131030	131035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335377
1590	NC_020834	TAA	2	6	131044	131049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335377
1591	NC_020834	CTT	2	6	131061	131066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335377
1592	NC_020834	AAT	2	6	131194	131199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335377
1593	NC_020834	ATT	2	6	131326	131331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335377
1594	NC_020834	TTA	2	6	131333	131338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335377
1595	NC_020834	TTA	2	6	131480	131485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335377
1596	NC_020834	ACC	2	6	131497	131502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335377
1597	NC_020834	AAT	2	6	131511	131516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335377
1598	NC_020834	AAT	2	6	131536	131541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335377
1599	NC_020834	ATT	2	6	131605	131610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335377
1600	NC_020834	CTT	2	6	131643	131648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335377
1601	NC_020834	AAT	2	6	131695	131700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335377
1602	NC_020834	ATC	2	6	131857	131862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335377
1603	NC_020834	TAA	2	6	131938	131943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335377
1604	NC_020834	TTA	2	6	132050	132055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020834	AAT	2	6	132101	132106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020834	GAT	2	6	132156	132161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020834	ATT	2	6	132173	132178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020834	ATT	2	6	132197	132202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020834	CCA	2	6	132255	132260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335378
1610	NC_020834	CTG	2	6	132358	132363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335378
1611	NC_020834	TAC	2	6	132491	132496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335378
1612	NC_020834	CAA	2	6	132529	132534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335378
1613	NC_020834	ATT	2	6	132610	132615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335378
1614	NC_020834	GCA	2	6	132701	132706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335378
1615	NC_020834	GGC	2	6	132743	132748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335378
1616	NC_020834	TAT	2	6	132759	132764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335378
1617	NC_020834	GTG	2	6	132848	132853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335378
1618	NC_020834	TTA	2	6	132887	132892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335378
1619	NC_020834	GAA	2	6	133148	133153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335378
1620	NC_020834	GGT	2	6	133187	133192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335378
1621	NC_020834	CCG	2	6	133228	133233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335378
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1983	NC_020834	TGA	2	6	163835	163840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335406
1984	NC_020834	ATG	2	6	163851	163856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335406
1985	NC_020834	ATG	2	6	163887	163892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335406
1986	NC_020834	GTG	2	6	163894	163899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335406
1987	NC_020834	ATG	2	6	163908	163913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335406
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1989	NC_020834	TTA	2	6	163978	163983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1990	NC_020834	ATA	2	6	164058	164063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1991	NC_020834	AAG	2	6	164100	164105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1992	NC_020834	AAT	2	6	164162	164167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335407
1993	NC_020834	AAT	2	6	164179	164184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335407
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1995	NC_020834	CTG	2	6	164391	164396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335407
1996	NC_020834	TCC	2	6	164437	164442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335407
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1999	NC_020834	CCA	2	6	164702	164707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335407
2000	NC_020834	ATT	3	9	164815	164823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335407

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