MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 30843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020834	CAA	2	6	285410	285415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335537
3502	NC_020834	AGA	2	6	285427	285432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335537
3503	NC_020834	TGG	2	6	285495	285500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335537
3504	NC_020834	ATG	2	6	285540	285545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335537
3505	NC_020834	GGT	2	6	285697	285702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335537
3506	NC_020834	GGA	2	6	285838	285843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_020834	TGA	2	6	285871	285876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_020834	TTC	2	6	285923	285928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_020834	CTA	2	6	286105	286110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335538
3510	NC_020834	GAA	2	6	286112	286117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335538
3511	NC_020834	TTA	2	6	286281	286286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335538
3512	NC_020834	ATT	2	6	286401	286406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335538
3513	NC_020834	TTC	2	6	286440	286445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335538
3514	NC_020834	TTA	2	6	286490	286495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335538
3515	NC_020834	ATT	2	6	286524	286529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335538
3516	NC_020834	TTA	2	6	286608	286613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335538
3517	NC_020834	GCA	2	6	286713	286718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335538
3518	NC_020834	ATT	2	6	286794	286799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335538
3519	NC_020834	TAA	2	6	286802	286807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335538
3520	NC_020834	ATG	2	6	286939	286944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335538
3521	NC_020834	GTT	2	6	286965	286970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335538
3522	NC_020834	GTG	2	6	287040	287045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335538
3523	NC_020834	AAT	2	6	287095	287100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335538
3524	NC_020834	TGA	2	6	287551	287556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335539
3525	NC_020834	GAT	2	6	287617	287622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335539
3526	NC_020834	AAG	2	6	287697	287702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335539
3527	NC_020834	TGA	2	6	287797	287802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335539
3528	NC_020834	ATG	2	6	287879	287884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335539
3529	NC_020834	AAG	2	6	287934	287939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335539
3530	NC_020834	TTG	2	6	288063	288068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335539
3531	NC_020834	GGC	2	6	288098	288103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335539
3532	NC_020834	TAA	2	6	288157	288162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335539
3533	NC_020834	AGA	2	6	288181	288186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335539
3534	NC_020834	CGG	2	6	288373	288378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335539
3535	NC_020834	CAA	2	6	288383	288388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335539
3536	NC_020834	CAT	2	6	288523	288528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335539
3537	NC_020834	TGA	2	6	288582	288587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335539
3538	NC_020834	AAG	2	6	288633	288638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335539
3539	NC_020834	GCA	2	6	288653	288658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335539
3540	NC_020834	ACA	2	6	288695	288700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335540
3541	NC_020834	TAT	2	6	288745	288750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335540
3542	NC_020834	ATT	2	6	288768	288773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335540
3543	NC_020834	TCT	2	6	288828	288833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335540
3544	NC_020834	ATT	2	6	288843	288848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335540
3545	NC_020834	TGG	2	6	289060	289065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335540
3546	NC_020834	ATT	2	6	289110	289115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335540
3547	NC_020834	TAC	2	6	289137	289142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335540
3548	NC_020834	GAT	2	6	289179	289184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335540
3549	NC_020834	CTT	2	6	289205	289210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335540
3550	NC_020834	ATT	2	6	289266	289271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335540
3551	NC_020834	GGC	2	6	289323	289328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335540
3552	NC_020834	AGC	2	6	289337	289342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335540
3553	NC_020834	TCT	2	6	289402	289407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335540
3554	NC_020834	CGG	2	6	289415	289420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335540
3555	NC_020834	GGT	2	6	289524	289529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335540
3556	NC_020834	ATC	2	6	289539	289544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335540
3557	NC_020834	GTA	2	6	289548	289553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335540
3558	NC_020834	CAT	2	6	289640	289645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335540
3559	NC_020834	GAA	2	6	289682	289687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335540
3560	NC_020834	CAT	2	6	289869	289874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_020834	GCA	2	6	290099	290104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335541
3562	NC_020834	ATC	2	6	290131	290136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335541
3563	NC_020834	GCA	2	6	290141	290146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335541
3564	NC_020834	TAA	2	6	290329	290334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335541
3565	NC_020834	TGA	2	6	290365	290370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335541
3566	NC_020834	CGG	2	6	290428	290433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335541
3567	NC_020834	CAT	2	6	290470	290475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335541
3568	NC_020834	GAT	2	6	290495	290500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335541
3569	NC_020834	GAA	2	6	290794	290799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335541
3570	NC_020834	ATT	2	6	290869	290874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335541
3571	NC_020834	CAT	2	6	291178	291183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335542
3572	NC_020834	AAT	2	6	291236	291241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335542
3573	NC_020834	ACT	2	6	291273	291278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335542
3574	NC_020834	CGG	2	6	291319	291324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335542
3575	NC_020834	CTG	2	6	291331	291336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335542
3576	NC_020834	CAC	2	6	291337	291342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335542
3577	NC_020834	CCG	2	6	291366	291371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335542
3578	NC_020834	TCA	2	6	291381	291386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335542
3579	NC_020834	ATA	2	6	291458	291463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335542
3580	NC_020834	GGT	2	6	291470	291475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335542
3581	NC_020834	TGT	2	6	291546	291551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335542
3582	NC_020834	GAC	2	6	291565	291570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335542
3583	NC_020834	GCA	2	6	291769	291774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335543
3584	NC_020834	ATG	2	6	291833	291838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335543
3585	NC_020834	ATC	2	6	291905	291910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335543
3586	NC_020834	CAC	2	6	291911	291916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335543
3587	NC_020834	ACC	2	6	291972	291977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335543
3588	NC_020834	ATC	2	6	292071	292076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335543
3589	NC_020834	GCG	2	6	292130	292135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335543
3590	NC_020834	TGC	2	6	292167	292172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335543
3591	NC_020834	TCA	2	6	292428	292433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335543
3592	NC_020834	GTT	2	6	292690	292695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335543
3593	NC_020834	AAC	2	6	292837	292842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335543
3594	NC_020834	CTG	2	6	292849	292854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335543
3595	NC_020834	CAA	2	6	292912	292917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335543
3596	NC_020834	GAT	2	6	293038	293043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335543
3597	NC_020834	CCA	2	6	293047	293052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335543
3598	NC_020834	CGC	2	6	293096	293101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335543
3599	NC_020834	CTA	2	6	293257	293262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335543
3600	NC_020834	TGT	2	6	293293	293298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335543
3601	NC_020834	ATA	2	6	293315	293320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335543
3602	NC_020834	TTG	2	6	293361	293366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335543
3603	NC_020834	CGC	3	9	293495	293503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335543
3604	NC_020834	TAT	2	6	293611	293616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335543
3605	NC_020834	GTC	2	6	293735	293740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335543
3606	NC_020834	ATC	2	6	293822	293827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335543
3607	NC_020834	CAA	2	6	293885	293890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335543
3608	NC_020834	TGG	2	6	294055	294060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335543
3609	NC_020834	GCC	2	6	294111	294116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335543
3610	NC_020834	CAC	2	6	294329	294334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335543
3611	NC_020834	CTT	2	6	294418	294423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335543
3612	NC_020834	CGG	2	6	294655	294660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335543
3613	NC_020834	TGA	2	6	294848	294853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335543
3614	NC_020834	CGC	2	6	294908	294913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335543
3615	NC_020834	GTA	2	6	295018	295023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335543
3616	NC_020834	TCA	2	6	295173	295178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335543
3617	NC_020834	TCA	2	6	295218	295223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335543
3618	NC_020834	GTG	2	6	295257	295262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335543
3619	NC_020834	CAT	2	6	295283	295288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335543
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3739	NC_020834	GCG	2	6	305401	305406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335553
3740	NC_020834	GTG	2	6	305521	305526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335553
3741	NC_020834	TAT	2	6	305585	305590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335553
3742	NC_020834	AAT	3	9	306005	306013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3743	NC_020834	TAC	2	6	306064	306069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3744	NC_020834	TGA	2	6	306146	306151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335554
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3747	NC_020834	TAT	2	6	306532	306537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335554
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3978	NC_020834	TCA	2	6	327505	327510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335573
3979	NC_020834	GTT	3	9	327584	327592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335573
3980	NC_020834	AAT	2	6	327642	327647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335573
3981	NC_020834	TTA	2	6	327649	327654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335573
3982	NC_020834	AGA	2	6	327810	327815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335573
3983	NC_020834	TTC	2	6	327902	327907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335573
3984	NC_020834	AAT	2	6	327930	327935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335573
3985	NC_020834	TCA	2	6	328243	328248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335573
3986	NC_020834	AAT	2	6	328338	328343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335574
3987	NC_020834	CAA	2	6	328432	328437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335574
3988	NC_020834	TAA	2	6	328447	328452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335574
3989	NC_020834	CAG	2	6	328462	328467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335574
3990	NC_020834	CTG	2	6	328474	328479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335574
3991	NC_020834	AAT	2	6	328574	328579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335574
3992	NC_020834	CTC	2	6	328588	328593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335574
3993	NC_020834	TAA	2	6	328597	328602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335574
3994	NC_020834	AAT	2	6	328718	328723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335574
3995	NC_020834	CAT	2	6	328810	328815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335574
3996	NC_020834	ACC	2	6	328886	328891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335574
3997	NC_020834	CAA	2	6	328903	328908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335574
3998	NC_020834	TAA	2	6	328922	328927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335574
3999	NC_020834	CAT	2	6	328945	328950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335574
4000	NC_020834	AAT	2	6	328991	328996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335574

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