MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 30843

< Previous12...678910111213141516...6162Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020834	TTA	2	6	412351	412356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335653
5002	NC_020834	GGT	2	6	412365	412370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335653
5003	NC_020834	TAT	2	6	412388	412393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335653
5004	NC_020834	TTG	2	6	412420	412425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335653
5005	NC_020834	GAA	2	6	412512	412517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335653
5006	NC_020834	AGA	2	6	412565	412570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335653
5007	NC_020834	GGT	2	6	412677	412682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335653
5008	NC_020834	GAA	2	6	412743	412748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335653
5009	NC_020834	TTG	2	6	412774	412779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335653
5010	NC_020834	CCG	2	6	412910	412915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335653
5011	NC_020834	GAT	2	6	412988	412993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335653
5012	NC_020834	GAA	2	6	413004	413009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335653
5013	NC_020834	TTA	2	6	413016	413021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335653
5014	NC_020834	TGA	2	6	413075	413080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335653
5015	NC_020834	TAT	2	6	413096	413101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335653
5016	NC_020834	CAG	2	6	413116	413121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335653
5017	NC_020834	AAG	2	6	413146	413151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335653
5018	NC_020834	CTT	2	6	413156	413161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335653
5019	NC_020834	ATT	2	6	413220	413225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335653
5020	NC_020834	GTT	2	6	413354	413359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335653
5021	NC_020834	TGA	2	6	413462	413467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335653
5022	NC_020834	CTG	2	6	413485	413490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335653
5023	NC_020834	TAG	2	6	413506	413511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335653
5024	NC_020834	ATT	2	6	413543	413548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_020834	ATT	2	6	413639	413644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335654
5026	NC_020834	TGT	2	6	413729	413734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335654
5027	NC_020834	GAA	2	6	413859	413864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335654
5028	NC_020834	ATT	2	6	413873	413878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335654
5029	NC_020834	GTT	2	6	414081	414086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335654
5030	NC_020834	ATA	2	6	414119	414124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335654
5031	NC_020834	CCT	2	6	414125	414130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_020834	ATT	2	6	414197	414202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_020834	CAA	2	6	414220	414225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_020834	ATA	2	6	414276	414281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_020834	ATT	2	6	414316	414321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_020834	TCA	2	6	414390	414395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335655
5037	NC_020834	TGC	2	6	414466	414471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335655
5038	NC_020834	AAG	2	6	414595	414600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335655
5039	NC_020834	TAT	2	6	414877	414882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335655
5040	NC_020834	GTG	2	6	414955	414960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335655
5041	NC_020834	GGC	2	6	414972	414977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335655
5042	NC_020834	ATT	2	6	414995	415000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335655
5043	NC_020834	ACC	2	6	415044	415049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335655
5044	NC_020834	GAT	2	6	415071	415076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335655
5045	NC_020834	ATG	2	6	415161	415166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335655
5046	NC_020834	GAT	2	6	415398	415403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335655
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5048	NC_020834	ACC	2	6	415444	415449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335655
5049	NC_020834	AAC	2	6	415486	415491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335655
5050	NC_020834	GTA	2	6	415560	415565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335655
5051	NC_020834	TTG	2	6	415570	415575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335655
5052	NC_020834	GTG	2	6	415683	415688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335655
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5054	NC_020834	GGT	2	6	415912	415917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335656
5055	NC_020834	GGT	2	6	415961	415966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335656
5056	NC_020834	GAT	2	6	416098	416103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335656
5057	NC_020834	TTG	2	6	416136	416141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335656
5058	NC_020834	CTG	2	6	416248	416253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335656
5059	NC_020834	TGA	2	6	416377	416382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335656
5060	NC_020834	TGG	2	6	416406	416411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335656
5061	NC_020834	GAA	2	6	416438	416443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335656
5062	NC_020834	TTA	2	6	416453	416458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335656
5063	NC_020834	ATT	2	6	416522	416527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335656
5064	NC_020834	ACC	2	6	416612	416617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335656
5065	NC_020834	ATT	2	6	416644	416649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335656
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5067	NC_020834	AAT	2	6	416802	416807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335656
5068	NC_020834	ATG	2	6	416811	416816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_020834	CAA	2	6	416922	416927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335657
5070	NC_020834	ATC	2	6	417020	417025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335657
5071	NC_020834	GCA	2	6	417141	417146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335657
5072	NC_020834	TCA	2	6	417149	417154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335657
5073	NC_020834	CGC	2	6	417286	417291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335657
5074	NC_020834	ATT	2	6	417351	417356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335657
5075	NC_020834	TGG	2	6	417609	417614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335657
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5077	NC_020834	CGG	2	6	418224	418229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335657
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5079	NC_020834	ACA	2	6	418444	418449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335658
5080	NC_020834	GAT	2	6	418699	418704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335658
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5083	NC_020834	TGG	2	6	418904	418909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335658
5084	NC_020834	TGA	2	6	419034	419039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335658
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5087	NC_020834	TGA	2	6	419235	419240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335658
5088	NC_020834	ACC	2	6	419291	419296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335658
5089	NC_020834	GAA	2	6	419524	419529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335659
5090	NC_020834	CAA	2	6	419710	419715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335659
5091	NC_020834	ATT	2	6	419895	419900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335659
5092	NC_020834	AAG	2	6	420047	420052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335660
5093	NC_020834	TGC	2	6	420093	420098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335660
5094	NC_020834	CGT	2	6	420100	420105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335660
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5098	NC_020834	CGG	2	6	420257	420262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335660
5099	NC_020834	TGT	2	6	420402	420407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_020834	ATT	2	6	420446	420451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335661
5101	NC_020834	ATT	2	6	420581	420586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335661
5102	NC_020834	AAG	2	6	420606	420611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335661
5103	NC_020834	TTG	2	6	420626	420631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335661
5104	NC_020834	GAA	3	9	420662	420670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335661
5105	NC_020834	GGC	2	6	420673	420678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335661
5106	NC_020834	ATA	2	6	420843	420848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335661
5107	NC_020834	CGC	2	6	420881	420886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335661
5108	NC_020834	GAT	2	6	421070	421075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335661
5109	NC_020834	AGA	2	6	421090	421095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335661
5110	NC_020834	AGT	2	6	421210	421215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335661
5111	NC_020834	GAT	2	6	421345	421350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335661
5112	NC_020834	TTG	2	6	421506	421511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335661
5113	NC_020834	CAG	2	6	421536	421541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335661
5114	NC_020834	TTG	2	6	421611	421616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335661
5115	NC_020834	ATT	2	6	421754	421759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335661
5116	NC_020834	GTA	2	6	421802	421807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335661
5117	NC_020834	CAG	2	6	421850	421855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335661
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5481	NC_020834	AAT	2	6	450393	450398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335692
5482	NC_020834	TTA	2	6	450399	450404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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