MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 42308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017167	TGA	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133788
2	NC_017167	TGA	3	9	253	261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133788
3	NC_017167	AGA	2	6	299	304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133788
4	NC_017167	CCG	2	6	319	324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133788
5	NC_017167	GGC	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133788
6	NC_017167	CGC	2	6	620	625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133788
7	NC_017167	GAC	2	6	690	695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133788
8	NC_017167	CAA	2	6	710	715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133788
9	NC_017167	AGG	2	6	727	732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133788
10	NC_017167	TTC	2	6	735	740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133788
11	NC_017167	TCA	2	6	856	861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133788
12	NC_017167	ACC	2	6	872	877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133788
13	NC_017167	GAG	2	6	1065	1070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133788
14	NC_017167	GTA	2	6	1134	1139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133788
15	NC_017167	CGA	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133788
16	NC_017167	AAG	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133788
17	NC_017167	ACG	2	6	1293	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133788
18	NC_017167	ATG	2	6	1332	1337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133788
19	NC_017167	GAC	2	6	1341	1346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133788
20	NC_017167	GCG	2	6	1478	1483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133789
21	NC_017167	CGA	2	6	1528	1533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133789
22	NC_017167	CTG	2	6	1559	1564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133789
23	NC_017167	TCG	2	6	1751	1756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133790
24	NC_017167	GAG	2	6	1981	1986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133790
25	NC_017167	GGC	2	6	2048	2053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133790
26	NC_017167	GGT	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133790
27	NC_017167	GGA	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133790
28	NC_017167	CCT	2	6	2343	2348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133790
29	NC_017167	GGT	2	6	2403	2408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133790
30	NC_017167	TTC	2	6	2426	2431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133790
31	NC_017167	CGC	2	6	2445	2450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133790
32	NC_017167	CGC	2	6	2640	2645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133790
33	NC_017167	GCG	2	6	2699	2704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133790
34	NC_017167	TGC	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133790
35	NC_017167	GAG	2	6	2767	2772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133791
36	NC_017167	GCG	2	6	2824	2829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133791
37	NC_017167	GTG	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133791
38	NC_017167	TCG	2	6	3044	3049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133792
39	NC_017167	TGC	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133792
40	NC_017167	GGT	2	6	3297	3302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133792
41	NC_017167	GGA	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133792
42	NC_017167	CAC	2	6	3403	3408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133792
43	NC_017167	GAC	3	9	3475	3483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133792
44	NC_017167	CGC	2	6	3573	3578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133792
45	NC_017167	GAG	2	6	3610	3615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133792
46	NC_017167	CAC	2	6	3735	3740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133792
47	NC_017167	GAC	2	6	3760	3765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133792
48	NC_017167	TGC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133792
49	NC_017167	CGG	2	6	3800	3805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133792
50	NC_017167	CAG	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133792
51	NC_017167	GAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133792
52	NC_017167	GTT	2	6	3894	3899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133792
53	NC_017167	CGA	2	6	3924	3929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133792
54	NC_017167	TCA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133792
55	NC_017167	GAA	2	6	4063	4068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133792
56	NC_017167	CTT	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133793
57	NC_017167	ACG	2	6	4184	4189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133793
58	NC_017167	CGA	2	6	4256	4261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133793
59	NC_017167	CAC	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133793
60	NC_017167	TTG	2	6	4295	4300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133793
61	NC_017167	GTG	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133793
62	NC_017167	ACA	2	6	4364	4369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133793
63	NC_017167	GGC	2	6	4468	4473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133793
64	NC_017167	GTG	2	6	4531	4536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133793
65	NC_017167	CGC	2	6	4613	4618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133793
66	NC_017167	ACG	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133793
67	NC_017167	ACG	2	6	4823	4828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133793
68	NC_017167	TGA	2	6	4881	4886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133793
69	NC_017167	GAC	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133793
70	NC_017167	ACG	2	6	4946	4951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133793
71	NC_017167	AAC	2	6	4981	4986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133793
72	NC_017167	CGG	2	6	4994	4999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133793
73	NC_017167	CTT	2	6	5073	5078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133793
74	NC_017167	ACA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133793
75	NC_017167	CGA	2	6	5106	5111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133793
76	NC_017167	CCG	2	6	5129	5134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133793
77	NC_017167	TCG	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133793
78	NC_017167	GCG	2	6	5302	5307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133793
79	NC_017167	GGC	2	6	5319	5324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133793
80	NC_017167	GCA	2	6	5348	5353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133793
81	NC_017167	AGA	2	6	5354	5359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133793
82	NC_017167	TCG	2	6	5432	5437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133793
83	NC_017167	ATC	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133793
84	NC_017167	GAG	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133793
85	NC_017167	CAT	2	6	5574	5579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133793
86	NC_017167	CGA	2	6	5604	5609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133793
87	NC_017167	TCA	2	6	5645	5650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133793
88	NC_017167	ACG	2	6	5666	5671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133793
89	NC_017167	GTG	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133793
90	NC_017167	GAC	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133793
91	NC_017167	GCT	2	6	5937	5942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133793
92	NC_017167	GGA	2	6	5955	5960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133793
93	NC_017167	CGG	2	6	6016	6021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133793
94	NC_017167	AGC	2	6	6137	6142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
95	NC_017167	TCG	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133794
96	NC_017167	AAG	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133794
97	NC_017167	TCG	2	6	6326	6331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133794
98	NC_017167	TCG	2	6	6336	6341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133794
99	NC_017167	CGC	2	6	6376	6381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133794
100	NC_017167	CAA	2	6	6544	6549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133794
101	NC_017167	ACG	2	6	6576	6581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
102	NC_017167	GAA	2	6	6587	6592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133794
103	NC_017167	CGT	2	6	6598	6603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133794
104	NC_017167	CTT	2	6	6626	6631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133794
105	NC_017167	CGA	2	6	6666	6671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
106	NC_017167	CGC	2	6	6678	6683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133794
107	NC_017167	CGT	2	6	6709	6714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133794
108	NC_017167	CGA	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
109	NC_017167	TGA	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133794
110	NC_017167	TCA	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133794
111	NC_017167	GCG	2	6	6789	6794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133794
112	NC_017167	GAG	2	6	6875	6880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133794
113	NC_017167	CGG	2	6	6886	6891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133794
114	NC_017167	GTG	2	6	6905	6910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133794
115	NC_017167	CAG	2	6	6926	6931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
116	NC_017167	AGA	3	9	6975	6983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133794
117	NC_017167	CGA	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
118	NC_017167	CGT	2	6	7033	7038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133794
119	NC_017167	AAC	2	6	7079	7084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133794
120	NC_017167	TCA	2	6	7122	7127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133794
121	NC_017167	CGT	2	6	7207	7212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133794
122	NC_017167	CCG	2	6	7213	7218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133794
123	NC_017167	CGA	2	6	7336	7341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
124	NC_017167	GGA	2	6	7378	7383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133794
125	NC_017167	GCA	2	6	7468	7473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
126	NC_017167	CGA	2	6	7567	7572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
127	NC_017167	CGG	2	6	7711	7716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133794
128	NC_017167	TCA	2	6	7731	7736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133794
129	NC_017167	CTT	2	6	7798	7803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133794
130	NC_017167	ACG	2	6	7839	7844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
131	NC_017167	GAT	2	6	7924	7929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133794
132	NC_017167	GAA	2	6	8002	8007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133794
133	NC_017167	CGC	2	6	8010	8015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133794
134	NC_017167	CGA	4	12	8068	8079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
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139	NC_017167	ACG	2	6	8262	8267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
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141	NC_017167	GAC	3	9	8411	8419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133794
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143	NC_017167	TCA	2	6	8508	8513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133794
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150	NC_017167	GCG	2	6	9344	9349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133796
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251	NC_017167	GCC	2	6	21436	21441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133805
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253	NC_017167	GAG	3	9	21529	21537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133805
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