MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 42308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017167	GGC	2	6	286653	286658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
4002	NC_017167	GCG	2	6	286700	286705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
4003	NC_017167	GCG	2	6	286714	286719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
4004	NC_017167	AGC	2	6	286720	286725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134078
4005	NC_017167	CGA	2	6	286745	286750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134078
4006	NC_017167	GGC	2	6	286864	286869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
4007	NC_017167	AGG	2	6	286990	286995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134078
4008	NC_017167	GCG	2	6	286999	287004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
4009	NC_017167	CGG	2	6	287076	287081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
4010	NC_017167	GCC	2	6	287107	287112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134078
4011	NC_017167	GCG	2	6	287132	287137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
4012	NC_017167	GGC	2	6	287153	287158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
4013	NC_017167	TCG	2	6	287200	287205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134078
4014	NC_017167	GCC	2	6	287232	287237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134078
4015	NC_017167	TTG	2	6	287238	287243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134078
4016	NC_017167	TCG	2	6	287300	287305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134078
4017	NC_017167	TCG	2	6	287308	287313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134078
4018	NC_017167	CAC	2	6	287442	287447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134078
4019	NC_017167	GCG	2	6	287497	287502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
4020	NC_017167	CGG	2	6	287513	287518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134078
4021	NC_017167	AGC	2	6	287530	287535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134078
4022	NC_017167	CGC	2	6	287563	287568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134078
4023	NC_017167	GAG	2	6	287643	287648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134078
4024	NC_017167	CGC	2	6	287777	287782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134079
4025	NC_017167	TCT	2	6	287801	287806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134079
4026	NC_017167	GCG	2	6	287811	287816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134079
4027	NC_017167	TCG	2	6	287888	287893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134079
4028	NC_017167	AAG	2	6	287921	287926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134079
4029	NC_017167	ACG	2	6	287972	287977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134079
4030	NC_017167	CCG	2	6	287982	287987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134079
4031	NC_017167	CGT	2	6	287994	287999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134079
4032	NC_017167	GAG	2	6	288016	288021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134079
4033	NC_017167	CGC	2	6	288168	288173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134079
4034	NC_017167	TCC	2	6	288317	288322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134079
4035	NC_017167	CGC	2	6	288346	288351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134079
4036	NC_017167	GGC	2	6	288353	288358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134079
4037	NC_017167	CGC	2	6	288575	288580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134079
4038	NC_017167	TCT	2	6	288784	288789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134080
4039	NC_017167	CTC	2	6	288930	288935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134080
4040	NC_017167	CGG	2	6	288968	288973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134080
4041	NC_017167	GTG	2	6	289170	289175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134080
4042	NC_017167	GGC	2	6	289209	289214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134080
4043	NC_017167	TCA	2	6	289240	289245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134080
4044	NC_017167	GCC	2	6	289257	289262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134080
4045	NC_017167	TCC	2	6	289306	289311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134080
4046	NC_017167	GCG	2	6	289312	289317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134080
4047	NC_017167	GCG	2	6	289326	289331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134080
4048	NC_017167	GGC	2	6	289404	289409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
4049	NC_017167	TCG	2	6	289416	289421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134081
4050	NC_017167	TTG	2	6	289528	289533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134081
4051	NC_017167	GCT	2	6	289557	289562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134081
4052	NC_017167	GGT	3	9	289584	289592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134081
4053	NC_017167	TGG	2	6	289601	289606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134081
4054	NC_017167	CTC	3	9	289753	289761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134081
4055	NC_017167	ACT	2	6	289892	289897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134081
4056	NC_017167	CGC	2	6	289983	289988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134081
4057	NC_017167	CGA	2	6	290007	290012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134081
4058	NC_017167	TGC	2	6	290015	290020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134081
4059	NC_017167	CTT	2	6	290223	290228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134081
4060	NC_017167	CAC	2	6	290241	290246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134081
4061	NC_017167	TGC	2	6	290258	290263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134081
4062	NC_017167	GCG	2	6	290295	290300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
4063	NC_017167	GGC	2	6	290303	290308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
4064	NC_017167	GCG	2	6	290338	290343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
4065	NC_017167	GTG	2	6	290410	290415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134081
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4068	NC_017167	GGA	2	6	290529	290534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134081
4069	NC_017167	GGA	2	6	290571	290576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134081
4070	NC_017167	GCG	2	6	290593	290598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
4071	NC_017167	TCG	2	6	290672	290677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134081
4072	NC_017167	CGG	2	6	290765	290770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
4073	NC_017167	CGA	2	6	290817	290822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134081
4074	NC_017167	GCG	2	6	290856	290861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134081
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4077	NC_017167	CGT	2	6	291263	291268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134082
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4079	NC_017167	ATG	2	6	291447	291452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134083
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4084	NC_017167	CAG	2	6	291572	291577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134083
4085	NC_017167	CCA	2	6	291578	291583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134083
4086	NC_017167	ATC	2	6	291597	291602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134083
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4089	NC_017167	GCT	2	6	292175	292180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134084
4090	NC_017167	CGA	2	6	292316	292321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134084
4091	NC_017167	TGG	3	9	292396	292404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134084
4092	NC_017167	GTG	2	6	292518	292523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134084
4093	NC_017167	ACT	2	6	292537	292542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134084
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4098	NC_017167	TCT	3	9	293335	293343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134086
4099	NC_017167	TGA	2	6	293556	293561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134086
4100	NC_017167	GTT	2	6	293695	293700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134086
4101	NC_017167	TGC	2	6	294015	294020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134086
4102	NC_017167	GCG	2	6	294062	294067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134086
4103	NC_017167	TTG	2	6	294119	294124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134086
4104	NC_017167	TCG	2	6	294198	294203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134086
4105	NC_017167	GAT	2	6	294312	294317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134087
4106	NC_017167	TCG	2	6	294326	294331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134087
4107	NC_017167	GTG	2	6	294352	294357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134087
4108	NC_017167	GGA	2	6	294370	294375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134087
4109	NC_017167	GGA	2	6	294449	294454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134087
4110	NC_017167	CAC	2	6	294458	294463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134087
4111	NC_017167	GCC	2	6	294509	294514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134087
4112	NC_017167	CAT	2	6	294575	294580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134087
4113	NC_017167	CGG	2	6	294617	294622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134087
4114	NC_017167	ACC	2	6	294655	294660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134087
4115	NC_017167	TGC	2	6	294676	294681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134087
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4117	NC_017167	CGG	2	6	294863	294868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134087
4118	NC_017167	CGT	2	6	294917	294922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134087
4119	NC_017167	CTA	2	6	295097	295102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134087
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4121	NC_017167	CAT	2	6	295344	295349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134087
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4124	NC_017167	CGA	2	6	295460	295465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134087
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4133	NC_017167	GCG	2	6	295808	295813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134088
4134	NC_017167	GTC	2	6	295886	295891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134088
4135	NC_017167	GCA	2	6	295906	295911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134088
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4356	NC_017167	AGC	2	6	311884	311889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134103
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4474	NC_017167	CGG	2	6	319361	319366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134109
4475	NC_017167	CCA	2	6	319549	319554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134110
4476	NC_017167	AAG	2	6	319580	319585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134110
4477	NC_017167	GCA	2	6	319596	319601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134110
4478	NC_017167	GAC	2	6	319781	319786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134110
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4488	NC_017167	CCA	2	6	320405	320410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134110
4489	NC_017167	GAG	2	6	320435	320440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134110
4490	NC_017167	CCG	2	6	320446	320451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134110
4491	NC_017167	CGC	2	6	320481	320486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134110
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