MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 42308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017167	GGC	2	6	245490	245495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
3502	NC_017167	CGG	2	6	245508	245513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
3503	NC_017167	TCT	2	6	245540	245545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134042
3504	NC_017167	CTT	2	6	245561	245566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134042
3505	NC_017167	CGG	2	6	245612	245617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
3506	NC_017167	AGG	2	6	245662	245667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134042
3507	NC_017167	CGC	2	6	245668	245673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134042
3508	NC_017167	CAC	2	6	245706	245711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134042
3509	NC_017167	GCG	2	6	245724	245729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
3510	NC_017167	CGC	2	6	245738	245743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134042
3511	NC_017167	TCG	2	6	245746	245751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134042
3512	NC_017167	GGC	3	9	245831	245839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
3513	NC_017167	CTC	2	6	246027	246032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134042
3514	NC_017167	GGA	2	6	246089	246094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134042
3515	NC_017167	GGT	2	6	246140	246145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134042
3516	NC_017167	GGA	2	6	246218	246223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134042
3517	NC_017167	GCG	2	6	246267	246272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
3518	NC_017167	GCC	2	6	246307	246312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134042
3519	NC_017167	CGC	2	6	246411	246416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134042
3520	NC_017167	GCG	3	9	246558	246566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
3521	NC_017167	CGG	2	6	246606	246611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
3522	NC_017167	TGG	2	6	246654	246659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134042
3523	NC_017167	CGA	2	6	246709	246714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134042
3524	NC_017167	CGG	2	6	246734	246739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
3525	NC_017167	GCG	2	6	246880	246885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
3526	NC_017167	GCG	2	6	246918	246923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
3527	NC_017167	GCG	2	6	247123	247128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134043
3528	NC_017167	GTC	2	6	247215	247220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134043
3529	NC_017167	TCA	2	6	247274	247279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134043
3530	NC_017167	GGA	2	6	247284	247289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134043
3531	NC_017167	GAT	2	6	247332	247337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134043
3532	NC_017167	GGC	2	6	247347	247352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134043
3533	NC_017167	ACT	2	6	247415	247420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134043
3534	NC_017167	TCG	2	6	247448	247453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134043
3535	NC_017167	ACA	2	6	247868	247873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134044
3536	NC_017167	CTT	2	6	247884	247889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134044
3537	NC_017167	CTC	2	6	247951	247956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134044
3538	NC_017167	GGT	2	6	247962	247967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134044
3539	NC_017167	GCG	2	6	248021	248026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134044
3540	NC_017167	GAG	2	6	248119	248124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134044
3541	NC_017167	GAG	2	6	248137	248142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134044
3542	NC_017167	TGC	2	6	248207	248212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
3543	NC_017167	CTC	2	6	248242	248247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134044
3544	NC_017167	TTC	2	6	248281	248286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134044
3545	NC_017167	TCG	2	6	248306	248311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
3546	NC_017167	TCG	2	6	248318	248323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
3547	NC_017167	GAA	2	6	248364	248369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134044
3548	NC_017167	CAT	2	6	248382	248387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134044
3549	NC_017167	CGA	2	6	248394	248399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134044
3550	NC_017167	CGG	3	9	248436	248444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134044
3551	NC_017167	ACG	2	6	248447	248452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134044
3552	NC_017167	GCT	2	6	248475	248480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
3553	NC_017167	TCA	2	6	248519	248524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134044
3554	NC_017167	CGC	2	6	248526	248531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134044
3555	NC_017167	GTC	2	6	248596	248601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
3556	NC_017167	GAG	2	6	248626	248631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134044
3557	NC_017167	ATC	2	6	248686	248691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134044
3558	NC_017167	GGC	2	6	248745	248750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134044
3559	NC_017167	GCT	2	6	248751	248756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
3560	NC_017167	AAG	2	6	248767	248772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134044
3561	NC_017167	CGA	2	6	248799	248804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134044
3562	NC_017167	TGA	2	6	248849	248854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134044
3563	NC_017167	TCG	2	6	248873	248878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
3564	NC_017167	GGT	2	6	248901	248906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134044
3565	NC_017167	CGG	2	6	248970	248975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134044
3566	NC_017167	AGC	2	6	249020	249025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134044
3567	NC_017167	CGG	2	6	249054	249059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134044
3568	NC_017167	GGA	2	6	249069	249074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134044
3569	NC_017167	GAT	2	6	249144	249149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134044
3570	NC_017167	CCT	2	6	249372	249377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134044
3571	NC_017167	ATA	2	6	249640	249645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384134045
3572	NC_017167	AGT	2	6	249668	249673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134045
3573	NC_017167	CGC	2	6	249707	249712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134045
3574	NC_017167	GTT	2	6	249773	249778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134045
3575	NC_017167	GCG	2	6	249809	249814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134045
3576	NC_017167	ACG	2	6	249820	249825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134045
3577	NC_017167	GAC	2	6	250068	250073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134045
3578	NC_017167	TTG	2	6	250384	250389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134045
3579	NC_017167	CTG	2	6	251183	251188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134046
3580	NC_017167	GGA	2	6	251275	251280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134046
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3582	NC_017167	GGT	2	6	251419	251424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134046
3583	NC_017167	GGA	2	6	251425	251430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134046
3584	NC_017167	CGA	2	6	251437	251442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134046
3585	NC_017167	GCG	3	9	251459	251467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134046
3586	NC_017167	CCA	2	6	251509	251514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134046
3587	NC_017167	ACG	2	6	251610	251615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134046
3588	NC_017167	GAG	2	6	251672	251677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134046
3589	NC_017167	CAT	2	6	251683	251688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134046
3590	NC_017167	CAG	2	6	251690	251695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134046
3591	NC_017167	TGA	2	6	251721	251726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134046
3592	NC_017167	TGG	2	6	251811	251816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134046
3593	NC_017167	TGG	2	6	251850	251855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134046
3594	NC_017167	CGT	2	6	252046	252051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134046
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3598	NC_017167	CCA	2	6	252331	252336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134047
3599	NC_017167	GGT	2	6	252346	252351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134047
3600	NC_017167	CGG	2	6	252354	252359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134047
3601	NC_017167	CGC	2	6	252382	252387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134047
3602	NC_017167	GAT	2	6	252388	252393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134047
3603	NC_017167	TGC	2	6	252399	252404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134047
3604	NC_017167	TGG	3	9	252462	252470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134047
3605	NC_017167	GCG	2	6	252558	252563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134047
3606	NC_017167	GTG	2	6	252587	252592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134047
3607	NC_017167	TAC	2	6	252614	252619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134047
3608	NC_017167	CGT	2	6	252621	252626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134047
3609	NC_017167	TAT	2	6	252668	252673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384134047
3610	NC_017167	TCG	2	6	252720	252725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134047
3611	NC_017167	GGA	3	9	252787	252795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134047
3612	NC_017167	CGC	2	6	252796	252801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134047
3613	NC_017167	CGG	3	9	252861	252869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134047
3614	NC_017167	GAG	2	6	253070	253075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134047
3615	NC_017167	GAT	2	6	253084	253089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134047
3616	NC_017167	AGC	2	6	253101	253106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134047
3617	NC_017167	GGT	2	6	253128	253133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134048
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3619	NC_017167	GGA	3	9	253224	253232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134048
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