MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 42308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017167	TCG	2	6	39050	39055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133822
502	NC_017167	CCG	2	6	39114	39119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133822
503	NC_017167	TCG	2	6	39123	39128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133822
504	NC_017167	TGA	2	6	39164	39169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133822
505	NC_017167	CCG	2	6	39186	39191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133822
506	NC_017167	TCG	2	6	39195	39200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133822
507	NC_017167	GGT	2	6	39472	39477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133823
508	NC_017167	CCG	2	6	39482	39487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133823
509	NC_017167	TCG	2	6	39491	39496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133823
510	NC_017167	CCG	2	6	39554	39559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133823
511	NC_017167	TCG	2	6	39563	39568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133823
512	NC_017167	CCG	2	6	39629	39634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133823
513	NC_017167	TCG	2	6	39638	39643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133823
514	NC_017167	CCG	2	6	39702	39707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133823
515	NC_017167	TCG	2	6	39711	39716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133823
516	NC_017167	AGC	2	6	39882	39887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133824
517	NC_017167	GCC	2	6	39893	39898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133824
518	NC_017167	TGC	2	6	39996	40001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133824
519	NC_017167	TGC	2	6	40074	40079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133824
520	NC_017167	GTG	2	6	40092	40097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133824
521	NC_017167	CGT	2	6	40261	40266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133824
522	NC_017167	CCG	2	6	40339	40344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133824
523	NC_017167	GCG	2	6	40396	40401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133824
524	NC_017167	TCG	2	6	40691	40696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133824
525	NC_017167	CCT	2	6	40737	40742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133824
526	NC_017167	TTC	2	6	40841	40846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133824
527	NC_017167	ACG	2	6	41101	41106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133825
528	NC_017167	GTC	2	6	41135	41140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133825
529	NC_017167	ACG	2	6	41160	41165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133825
530	NC_017167	TCG	2	6	41171	41176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133825
531	NC_017167	GCC	2	6	41184	41189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133825
532	NC_017167	GCC	2	6	41193	41198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133825
533	NC_017167	CCA	2	6	41242	41247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133825
534	NC_017167	AGT	2	6	41274	41279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133825
535	NC_017167	CTT	2	6	41521	41526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133825
536	NC_017167	CAT	2	6	41624	41629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133825
537	NC_017167	GCG	2	6	41757	41762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133826
538	NC_017167	ATG	2	6	41795	41800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133826
539	NC_017167	GAC	2	6	41833	41838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133826
540	NC_017167	CGA	2	6	41952	41957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133826
541	NC_017167	TCA	2	6	41958	41963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133826
542	NC_017167	GAC	2	6	41971	41976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133826
543	NC_017167	CGC	2	6	42013	42018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133826
544	NC_017167	GGT	2	6	42043	42048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133826
545	NC_017167	CCA	2	6	42163	42168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133826
546	NC_017167	TCA	2	6	42440	42445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133826
547	NC_017167	ATG	2	6	42452	42457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133826
548	NC_017167	GAC	2	6	42466	42471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133826
549	NC_017167	GCA	2	6	42561	42566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133826
550	NC_017167	TGA	2	6	42609	42614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133826
551	NC_017167	CCA	2	6	42795	42800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133826
552	NC_017167	CCG	2	6	43071	43076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133827
553	NC_017167	ATC	2	6	43136	43141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133827
554	NC_017167	GAC	2	6	43154	43159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133827
555	NC_017167	GCA	2	6	43173	43178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133827
556	NC_017167	GCG	2	6	43233	43238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133827
557	NC_017167	ATC	2	6	43253	43258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133827
558	NC_017167	GCG	2	6	43259	43264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133827
559	NC_017167	CCG	2	6	43337	43342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133827
560	NC_017167	CGC	2	6	43356	43361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133827
561	NC_017167	GCC	2	6	43386	43391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133827
562	NC_017167	CCG	2	6	43413	43418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133827
563	NC_017167	CGT	2	6	43645	43650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133827
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565	NC_017167	GGC	2	6	43759	43764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133827
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569	NC_017167	GCG	2	6	44026	44031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133828
570	NC_017167	CCG	2	6	44032	44037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133828
571	NC_017167	GAT	2	6	44059	44064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133828
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573	NC_017167	TGA	2	6	44088	44093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133828
574	NC_017167	GAC	2	6	44191	44196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133828
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580	NC_017167	CGT	2	6	44428	44433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133828
581	NC_017167	CGA	2	6	44454	44459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133828
582	NC_017167	GCG	2	6	44556	44561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133828
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585	NC_017167	TGA	2	6	44652	44657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133828
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588	NC_017167	AGA	2	6	44742	44747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133828
589	NC_017167	CCG	3	9	44796	44804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133828
590	NC_017167	GAT	3	9	44881	44889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133828
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593	NC_017167	GCT	2	6	45113	45118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133829
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595	NC_017167	CGA	2	6	45149	45154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133829
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599	NC_017167	CGG	2	6	45608	45613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133829
600	NC_017167	CGC	2	6	45740	45745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133829
601	NC_017167	CCG	2	6	45788	45793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133829
602	NC_017167	GGC	2	6	45844	45849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133829
603	NC_017167	GCA	2	6	45860	45865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133829
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605	NC_017167	TGA	2	6	46001	46006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133829
606	NC_017167	GAT	2	6	46041	46046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133829
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609	NC_017167	TCG	2	6	46093	46098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133829
610	NC_017167	GCT	2	6	46148	46153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133829
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613	NC_017167	GAC	2	6	46284	46289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133829
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618	NC_017167	GTT	2	6	46782	46787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133830
619	NC_017167	GTT	2	6	46800	46805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133830
620	NC_017167	CGC	2	6	46808	46813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133830
621	NC_017167	TGA	2	6	46886	46891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133830
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995	NC_017167	GCC	2	6	70972	70977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133853
996	NC_017167	ATG	2	6	70982	70987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133853
997	NC_017167	CTT	2	6	71011	71016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133853
998	NC_017167	CAG	2	6	71122	71127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133853
999	NC_017167	GAA	2	6	71284	71289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133853
1000	NC_017167	TTG	2	6	71354	71359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133853

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