MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 42308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017167	CCA	2	6	102773	102778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133879
1502	NC_017167	CGA	2	6	102808	102813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133879
1503	NC_017167	TGA	2	6	102904	102909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133879
1504	NC_017167	CAT	2	6	102965	102970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133879
1505	NC_017167	GAA	2	6	102986	102991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133879
1506	NC_017167	GAC	2	6	103052	103057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133879
1507	NC_017167	CGA	2	6	103066	103071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133879
1508	NC_017167	AGG	2	6	103107	103112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133879
1509	NC_017167	CGG	2	6	103132	103137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133879
1510	NC_017167	GGA	2	6	103175	103180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133879
1511	NC_017167	TCG	2	6	103192	103197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133879
1512	NC_017167	ATC	2	6	103215	103220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133879
1513	NC_017167	CAG	2	6	103283	103288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133879
1514	NC_017167	TCC	2	6	103307	103312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133880
1515	NC_017167	ACC	2	6	103313	103318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133880
1516	NC_017167	CGG	2	6	103322	103327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133880
1517	NC_017167	GCC	2	6	103385	103390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133880
1518	NC_017167	GTA	2	6	103435	103440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133880
1519	NC_017167	GTG	2	6	103448	103453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133880
1520	NC_017167	GAC	2	6	103528	103533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133880
1521	NC_017167	CGC	2	6	103596	103601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133880
1522	NC_017167	GAT	2	6	103660	103665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133880
1523	NC_017167	TCC	2	6	103786	103791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133880
1524	NC_017167	AGC	2	6	103805	103810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133880
1525	NC_017167	GAG	3	9	103912	103920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133880
1526	NC_017167	CGG	2	6	103923	103928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133880
1527	NC_017167	CAT	2	6	103942	103947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133880
1528	NC_017167	CGC	2	6	103975	103980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133880
1529	NC_017167	GCG	2	6	103997	104002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133880
1530	NC_017167	CAT	2	6	104137	104142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133880
1531	NC_017167	CTC	2	6	104191	104196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133880
1532	NC_017167	CGG	2	6	104220	104225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133880
1533	NC_017167	CCT	2	6	104242	104247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133880
1534	NC_017167	ACG	2	6	104423	104428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133881
1535	NC_017167	GCC	2	6	104569	104574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133881
1536	NC_017167	ACG	2	6	104576	104581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133881
1537	NC_017167	CGA	2	6	104613	104618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133881
1538	NC_017167	GTG	2	6	104619	104624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133881
1539	NC_017167	AGC	2	6	104999	105004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133881
1540	NC_017167	ACT	2	6	105113	105118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133881
1541	NC_017167	GGC	2	6	105123	105128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133881
1542	NC_017167	AAG	2	6	105199	105204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133881
1543	NC_017167	GGT	2	6	105250	105255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133881
1544	NC_017167	GAG	2	6	105325	105330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133881
1545	NC_017167	TCT	2	6	105428	105433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133881
1546	NC_017167	ACA	2	6	105434	105439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133881
1547	NC_017167	TGA	2	6	105447	105452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133881
1548	NC_017167	CCA	2	6	105507	105512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133881
1549	NC_017167	CGG	2	6	105642	105647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133881
1550	NC_017167	CGA	2	6	105722	105727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133882
1551	NC_017167	CGA	2	6	105782	105787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133882
1552	NC_017167	GGT	2	6	105852	105857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133882
1553	NC_017167	GGC	2	6	105858	105863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133882
1554	NC_017167	GCT	2	6	105868	105873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133882
1555	NC_017167	GAG	2	6	105994	105999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133882
1556	NC_017167	TCG	2	6	106085	106090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133882
1557	NC_017167	GCG	2	6	106135	106140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133882
1558	NC_017167	GAA	2	6	106179	106184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133882
1559	NC_017167	GGC	2	6	106214	106219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133882
1560	NC_017167	AGC	2	6	106227	106232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133882
1561	NC_017167	TTC	2	6	106243	106248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133882
1562	NC_017167	CGG	2	6	106341	106346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133882
1563	NC_017167	CGC	2	6	106431	106436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133882
1564	NC_017167	CCG	2	6	106501	106506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133882
1565	NC_017167	TAC	2	6	106759	106764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133882
1566	NC_017167	TCG	2	6	106853	106858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133882
1567	NC_017167	CAT	2	6	106959	106964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133882
1568	NC_017167	GGC	2	6	107145	107150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133882
1569	NC_017167	GAC	2	6	107209	107214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133882
1570	NC_017167	GCG	2	6	107258	107263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133882
1571	NC_017167	GTG	2	6	107310	107315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133882
1572	NC_017167	CGA	2	6	107412	107417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133883
1573	NC_017167	CCA	2	6	107442	107447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133883
1574	NC_017167	GTG	2	6	107450	107455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133883
1575	NC_017167	GAT	2	6	107524	107529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133883
1576	NC_017167	GCG	2	6	107543	107548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133883
1577	NC_017167	CCG	2	6	107595	107600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133883
1578	NC_017167	GGC	2	6	107677	107682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133883
1579	NC_017167	TCG	2	6	107705	107710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133883
1580	NC_017167	GCC	2	6	107791	107796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133883
1581	NC_017167	GAC	2	6	107812	107817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133883
1582	NC_017167	GAG	2	6	108208	108213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133884
1583	NC_017167	GCC	2	6	108214	108219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133884
1584	NC_017167	ACG	2	6	108253	108258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133884
1585	NC_017167	TGC	2	6	108344	108349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133884
1586	NC_017167	CGA	2	6	108402	108407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133884
1587	NC_017167	AGG	2	6	108488	108493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133884
1588	NC_017167	CGG	2	6	108509	108514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133884
1589	NC_017167	GCG	2	6	108581	108586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133884
1590	NC_017167	GAT	2	6	108878	108883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133885
1591	NC_017167	TCG	2	6	109048	109053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133885
1592	NC_017167	CGG	2	6	109276	109281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133885
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1594	NC_017167	CGG	2	6	109406	109411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133885
1595	NC_017167	GAC	2	6	109736	109741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133885
1596	NC_017167	CGG	2	6	109843	109848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133885
1597	NC_017167	GCA	2	6	109872	109877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133885
1598	NC_017167	CAG	2	6	109896	109901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133885
1599	NC_017167	CAA	2	6	109944	109949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133885
1600	NC_017167	CTC	2	6	109950	109955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133885
1601	NC_017167	CGG	2	6	110017	110022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133885
1602	NC_017167	TCG	2	6	110070	110075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133885
1603	NC_017167	GCG	2	6	110155	110160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133885
1604	NC_017167	AGG	2	6	110168	110173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133885
1605	NC_017167	GGC	3	9	110183	110191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133885
1606	NC_017167	GCG	2	6	110247	110252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133885
1607	NC_017167	CAG	2	6	110268	110273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133885
1608	NC_017167	ACG	2	6	110290	110295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133885
1609	NC_017167	GTT	2	6	110297	110302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133885
1610	NC_017167	CCA	2	6	110320	110325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133885
1611	NC_017167	GCG	2	6	110356	110361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133885
1612	NC_017167	GCG	2	6	110377	110382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133885
1613	NC_017167	CCG	2	6	110446	110451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133885
1614	NC_017167	CGG	2	6	110501	110506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133885
1615	NC_017167	TGA	3	9	110629	110637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133885
1616	NC_017167	TTC	2	6	110694	110699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133885
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1618	NC_017167	CGT	2	6	110714	110719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133885
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1973	NC_017167	CTG	2	6	134134	134139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133914
1974	NC_017167	CGT	2	6	134206	134211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133914
1975	NC_017167	TGC	2	6	134274	134279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133914
1976	NC_017167	CTG	2	6	134432	134437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133914
1977	NC_017167	GCG	2	6	134487	134492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133914
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1980	NC_017167	TCA	2	6	134742	134747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133915
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1999	NC_017167	CCG	2	6	136268	136273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133916
2000	NC_017167	GAG	2	6	136319	136324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133916

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