MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 42308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017167	ACA	2	6	368630	368635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134145
5002	NC_017167	CGC	2	6	368699	368704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134145
5003	NC_017167	GAG	2	6	368705	368710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134145
5004	NC_017167	GCG	2	6	368830	368835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134145
5005	NC_017167	TTG	2	6	368845	368850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134145
5006	NC_017167	CGT	2	6	369033	369038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134146
5007	NC_017167	CGG	2	6	369121	369126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134146
5008	NC_017167	CGC	2	6	369744	369749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134147
5009	NC_017167	CTT	2	6	369880	369885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134147
5010	NC_017167	GTC	2	6	370278	370283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134148
5011	NC_017167	GAG	2	6	370300	370305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134148
5012	NC_017167	GAC	2	6	370344	370349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134148
5013	NC_017167	GAA	2	6	370551	370556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134148
5014	NC_017167	GTG	2	6	370707	370712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134148
5015	NC_017167	TAC	2	6	370820	370825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134148
5016	NC_017167	CAG	2	6	371182	371187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134149
5017	NC_017167	TGC	2	6	371266	371271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134149
5018	NC_017167	CCG	2	6	371307	371312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134149
5019	NC_017167	CAT	2	6	371327	371332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134149
5020	NC_017167	TCA	2	6	371380	371385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134149
5021	NC_017167	TCT	2	6	371422	371427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134149
5022	NC_017167	CCA	2	6	371536	371541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134149
5023	NC_017167	GTG	2	6	371631	371636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134149
5024	NC_017167	ACG	2	6	371703	371708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134149
5025	NC_017167	TCG	2	6	371761	371766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134149
5026	NC_017167	ACC	2	6	371970	371975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134149
5027	NC_017167	ATG	2	6	372039	372044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134149
5028	NC_017167	CAT	2	6	372047	372052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134149
5029	NC_017167	GTG	2	6	372072	372077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134149
5030	NC_017167	ACT	2	6	372268	372273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134149
5031	NC_017167	GCT	2	6	372389	372394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134149
5032	NC_017167	CGC	2	6	372445	372450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134149
5033	NC_017167	ATG	2	6	372526	372531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134150
5034	NC_017167	CCG	2	6	372541	372546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134150
5035	NC_017167	GAA	2	6	372553	372558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134150
5036	NC_017167	GCC	2	6	372604	372609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134150
5037	NC_017167	GGT	2	6	372612	372617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134150
5038	NC_017167	CGC	2	6	372921	372926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134150
5039	NC_017167	TGG	2	6	372950	372955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134150
5040	NC_017167	GCG	2	6	373123	373128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134150
5041	NC_017167	GCC	2	6	373159	373164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134150
5042	NC_017167	CAG	2	6	373240	373245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134150
5043	NC_017167	CGC	2	6	373251	373256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134150
5044	NC_017167	CCG	2	6	373295	373300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134150
5045	NC_017167	GCA	2	6	373431	373436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134150
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5047	NC_017167	GGA	2	6	373518	373523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134150
5048	NC_017167	CGG	2	6	373655	373660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134150
5049	NC_017167	GCG	2	6	373687	373692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134150
5050	NC_017167	CGG	2	6	373748	373753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134150
5051	NC_017167	CGC	2	6	373779	373784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134150
5052	NC_017167	AAG	2	6	373820	373825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134150
5053	NC_017167	GCC	2	6	373833	373838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134150
5054	NC_017167	GCC	2	6	373921	373926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134150
5055	NC_017167	AAG	2	6	373982	373987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134150
5056	NC_017167	GGC	2	6	374025	374030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134150
5057	NC_017167	AGC	2	6	374046	374051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134150
5058	NC_017167	CAA	2	6	374065	374070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134150
5059	NC_017167	GGT	2	6	374202	374207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134150
5060	NC_017167	GCA	2	6	374250	374255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134150
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5062	NC_017167	ATC	2	6	374446	374451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134150
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5065	NC_017167	GTG	2	6	374596	374601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134150
5066	NC_017167	AAG	2	6	374672	374677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134150
5067	NC_017167	GAG	2	6	374723	374728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134151
5068	NC_017167	CAA	2	6	375059	375064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134151
5069	NC_017167	AGA	2	6	375118	375123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134151
5070	NC_017167	GGA	2	6	375182	375187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134151
5071	NC_017167	CCG	2	6	375432	375437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134152
5072	NC_017167	GCC	2	6	375544	375549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134152
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5078	NC_017167	GAG	2	6	375937	375942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134152
5079	NC_017167	GCA	2	6	376050	376055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134153
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5081	NC_017167	CGC	2	6	376197	376202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134153
5082	NC_017167	GCA	2	6	376206	376211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134153
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5084	NC_017167	GTC	2	6	376385	376390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134154
5085	NC_017167	ACA	2	6	376433	376438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134154
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5089	NC_017167	AAG	2	6	376611	376616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134154
5090	NC_017167	AGC	2	6	377169	377174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134155
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5099	NC_017167	AGC	2	6	377910	377915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134155
5100	NC_017167	CAA	2	6	377930	377935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134155
5101	NC_017167	CAA	3	9	378005	378013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134155
5102	NC_017167	CAA	2	6	378017	378022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134155
5103	NC_017167	CAG	2	6	378125	378130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134155
5104	NC_017167	CAA	2	6	378199	378204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134155
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5106	NC_017167	CAG	2	6	378314	378319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134155
5107	NC_017167	GCA	2	6	378355	378360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134155
5108	NC_017167	CAG	2	6	378377	378382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134155
5109	NC_017167	CAA	2	6	378422	378427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134155
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5111	NC_017167	ACG	2	6	378456	378461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134155
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5119	NC_017167	GGC	2	6	379361	379366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134155
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5477	NC_017167	TGC	2	6	402544	402549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134173
5478	NC_017167	CGG	2	6	402682	402687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134173
5479	NC_017167	TCT	2	6	402732	402737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134173
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