MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 42308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017167	CCT	2	6	441175	441180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134209
6002	NC_017167	ATC	2	6	441228	441233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134209
6003	NC_017167	GAG	2	6	441482	441487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134210
6004	NC_017167	CGC	2	6	441519	441524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134210
6005	NC_017167	GTT	2	6	441527	441532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134210
6006	NC_017167	GGC	2	6	441536	441541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134210
6007	NC_017167	GTG	2	6	441570	441575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134210
6008	NC_017167	CGG	2	6	441580	441585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134210
6009	NC_017167	GGA	2	6	441638	441643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134210
6010	NC_017167	GAC	2	6	441663	441668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134210
6011	NC_017167	GCT	2	6	441701	441706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134210
6012	NC_017167	GCG	2	6	441728	441733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134210
6013	NC_017167	CGA	2	6	441734	441739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134210
6014	NC_017167	CGG	2	6	441762	441767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134210
6015	NC_017167	GAG	2	6	441872	441877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134210
6016	NC_017167	CAT	2	6	441920	441925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134210
6017	NC_017167	CTC	2	6	441986	441991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134210
6018	NC_017167	GAG	2	6	442061	442066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134210
6019	NC_017167	TCG	2	6	442114	442119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134210
6020	NC_017167	GTT	2	6	442253	442258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134210
6021	NC_017167	CGC	2	6	442284	442289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134210
6022	NC_017167	CGT	2	6	442406	442411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134210
6023	NC_017167	CGC	2	6	442440	442445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134210
6024	NC_017167	CCG	2	6	442455	442460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134210
6025	NC_017167	CCG	2	6	442478	442483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134210
6026	NC_017167	GGA	2	6	442613	442618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134210
6027	NC_017167	CGA	2	6	442682	442687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134210
6028	NC_017167	GGT	2	6	442733	442738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134210
6029	NC_017167	GGC	2	6	442871	442876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134210
6030	NC_017167	TGC	2	6	443106	443111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134211
6031	NC_017167	CGC	2	6	443162	443167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134211
6032	NC_017167	GAC	2	6	443233	443238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134212
6033	NC_017167	CGG	2	6	443304	443309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134212
6034	NC_017167	CGG	2	6	443394	443399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134212
6035	NC_017167	ATG	2	6	443419	443424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134212
6036	NC_017167	CGG	2	6	443553	443558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134212
6037	NC_017167	CAT	3	9	443577	443585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134212
6038	NC_017167	TCA	2	6	443586	443591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134212
6039	NC_017167	CGC	2	6	443634	443639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134212
6040	NC_017167	CAT	2	6	443721	443726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134212
6041	NC_017167	GAT	2	6	443988	443993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134212
6042	NC_017167	TCG	2	6	443999	444004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134212
6043	NC_017167	CAT	2	6	444006	444011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134212
6044	NC_017167	TCA	2	6	444089	444094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134212
6045	NC_017167	TCA	2	6	444107	444112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134212
6046	NC_017167	TCG	2	6	444151	444156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134212
6047	NC_017167	GCT	2	6	444159	444164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134212
6048	NC_017167	GGT	3	9	444240	444248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134212
6049	NC_017167	ACG	2	6	444284	444289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134212
6050	NC_017167	CAT	2	6	444357	444362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134212
6051	NC_017167	GCG	2	6	444407	444412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134212
6052	NC_017167	GGT	2	6	444450	444455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134212
6053	NC_017167	CGT	2	6	444468	444473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134212
6054	NC_017167	CAT	2	6	444546	444551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134212
6055	NC_017167	CTA	2	6	444570	444575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134212
6056	NC_017167	CGG	2	6	444658	444663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134213
6057	NC_017167	CGA	2	6	444713	444718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134213
6058	NC_017167	GGA	2	6	444734	444739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134213
6059	NC_017167	CGA	2	6	444791	444796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134213
6060	NC_017167	GAG	2	6	444837	444842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134213
6061	NC_017167	TGC	2	6	444886	444891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134213
6062	NC_017167	CGA	2	6	444920	444925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134213
6063	NC_017167	CGC	2	6	445004	445009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134213
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6065	NC_017167	CAT	2	6	445115	445120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134213
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6067	NC_017167	GGA	2	6	445199	445204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134213
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6070	NC_017167	CGT	3	9	445286	445294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134213
6071	NC_017167	GGC	2	6	445484	445489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134213
6072	NC_017167	GAG	2	6	445572	445577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134213
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6078	NC_017167	GCG	2	6	445931	445936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134214
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6083	NC_017167	GAG	2	6	446147	446152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134214
6084	NC_017167	TCG	2	6	446289	446294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134214
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6089	NC_017167	TGG	2	6	446550	446555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134214
6090	NC_017167	TCC	2	6	446567	446572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134214
6091	NC_017167	CCT	2	6	446617	446622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134214
6092	NC_017167	CAT	2	6	446650	446655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134214
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6101	NC_017167	GCA	2	6	447363	447368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134214
6102	NC_017167	CCA	2	6	447487	447492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134214
6103	NC_017167	CAA	2	6	447502	447507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134214
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6105	NC_017167	CGT	2	6	447949	447954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134215
6106	NC_017167	AGC	3	9	447957	447965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134215
6107	NC_017167	AGC	2	6	448106	448111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134215
6108	NC_017167	CGA	2	6	448114	448119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134215
6109	NC_017167	CGA	2	6	448432	448437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134215
6110	NC_017167	CAT	2	6	448553	448558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134215
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6112	NC_017167	CGA	2	6	448675	448680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134215
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6115	NC_017167	GTC	2	6	448848	448853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134215
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6118	NC_017167	GCT	2	6	449044	449049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134215
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