MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 42308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017167	TGT	2	6	321523	321528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134111
4502	NC_017167	CAC	2	6	321870	321875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134111
4503	NC_017167	CAA	2	6	321998	322003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134111
4504	NC_017167	GAA	2	6	322016	322021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134111
4505	NC_017167	AAG	2	6	322404	322409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134112
4506	NC_017167	GAA	2	6	322415	322420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134112
4507	NC_017167	GGC	3	9	322436	322444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134112
4508	NC_017167	TTG	2	6	322462	322467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134112
4509	NC_017167	GCG	2	6	322518	322523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134112
4510	NC_017167	CGC	2	6	322585	322590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134112
4511	NC_017167	GAT	2	6	322602	322607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134112
4512	NC_017167	GAA	2	6	322631	322636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134112
4513	NC_017167	CAG	2	6	322698	322703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
4514	NC_017167	CTC	2	6	322734	322739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134112
4515	NC_017167	GGC	2	6	322787	322792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134112
4516	NC_017167	AAC	2	6	322866	322871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134112
4517	NC_017167	GCA	2	6	322907	322912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
4518	NC_017167	AAG	2	6	322917	322922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134112
4519	NC_017167	GGC	2	6	322923	322928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134112
4520	NC_017167	GGT	2	6	322931	322936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134112
4521	NC_017167	GCA	2	6	323069	323074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
4522	NC_017167	GCA	2	6	323090	323095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
4523	NC_017167	AGC	3	9	323179	323187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
4524	NC_017167	ACG	2	6	323251	323256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
4525	NC_017167	GCC	2	6	323304	323309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134112
4526	NC_017167	AAG	2	6	323340	323345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134112
4527	NC_017167	AAC	2	6	323376	323381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134112
4528	NC_017167	TCA	2	6	323452	323457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134112
4529	NC_017167	CAC	2	6	323468	323473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134112
4530	NC_017167	AGC	2	6	323500	323505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134112
4531	NC_017167	TCG	2	6	323707	323712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134113
4532	NC_017167	ACC	2	6	323736	323741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134113
4533	NC_017167	GAT	2	6	323747	323752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134113
4534	NC_017167	AGC	2	6	323764	323769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134113
4535	NC_017167	GCG	2	6	323921	323926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134113
4536	NC_017167	GCG	2	6	323975	323980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134113
4537	NC_017167	CGG	2	6	324050	324055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134113
4538	NC_017167	CGA	2	6	324116	324121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134113
4539	NC_017167	CCG	2	6	324127	324132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134113
4540	NC_017167	CGT	2	6	324140	324145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134113
4541	NC_017167	GCA	2	6	324146	324151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134113
4542	NC_017167	GTG	2	6	324255	324260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134113
4543	NC_017167	GGC	2	6	324323	324328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134113
4544	NC_017167	AGG	2	6	324352	324357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134113
4545	NC_017167	CGC	2	6	324411	324416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134114
4546	NC_017167	CAT	2	6	324441	324446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134114
4547	NC_017167	CAA	2	6	324460	324465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134114
4548	NC_017167	AAC	2	6	324517	324522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134114
4549	NC_017167	TGC	2	6	324557	324562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134114
4550	NC_017167	TCC	2	6	324605	324610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134114
4551	NC_017167	AGG	2	6	324848	324853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134114
4552	NC_017167	CAT	2	6	324864	324869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134114
4553	NC_017167	AAC	2	6	324871	324876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134114
4554	NC_017167	TGG	2	6	324929	324934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134114
4555	NC_017167	CTC	2	6	324946	324951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134114
4556	NC_017167	TGA	2	6	325055	325060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134114
4557	NC_017167	TGC	2	6	325133	325138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134114
4558	NC_017167	GGC	2	6	325189	325194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
4559	NC_017167	GGC	2	6	325272	325277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
4560	NC_017167	CGG	2	6	325281	325286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
4561	NC_017167	TCG	2	6	325289	325294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134114
4562	NC_017167	GCG	2	6	325312	325317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
4563	NC_017167	CGG	2	6	325329	325334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
4564	NC_017167	CGG	2	6	325374	325379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
4565	NC_017167	CGG	2	6	325392	325397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134114
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4568	NC_017167	CTG	2	6	325513	325518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134114
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4570	NC_017167	ATG	2	6	325723	325728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134115
4571	NC_017167	GGT	2	6	325824	325829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134115
4572	NC_017167	CAT	2	6	325884	325889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134115
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4589	NC_017167	GCG	2	6	327403	327408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134116
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4601	NC_017167	GGC	2	6	328197	328202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134116
4602	NC_017167	TTC	2	6	328816	328821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134117
4603	NC_017167	CCG	2	6	328869	328874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134117
4604	NC_017167	GAG	2	6	328935	328940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134117
4605	NC_017167	GCT	2	6	328958	328963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134117
4606	NC_017167	GAC	2	6	329064	329069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134117
4607	NC_017167	CAT	2	6	329105	329110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134117
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4614	NC_017167	CAT	2	6	329906	329911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134117
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4619	NC_017167	GGA	2	6	330242	330247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134117
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4973	NC_017167	CAT	2	6	365917	365922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134141
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