MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 42308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017167	CAC	2	6	208743	208748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134000
3002	NC_017167	TTC	2	6	208897	208902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134000
3003	NC_017167	CGG	2	6	208926	208931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134000
3004	NC_017167	GAG	2	6	208933	208938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134000
3005	NC_017167	GGC	2	6	208940	208945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134000
3006	NC_017167	ATC	2	6	209186	209191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134000
3007	NC_017167	CGC	2	6	209243	209248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134000
3008	NC_017167	CGA	3	9	209268	209276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134000
3009	NC_017167	CGG	2	6	209430	209435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134000
3010	NC_017167	AGA	2	6	209436	209441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134000
3011	NC_017167	GAC	2	6	209573	209578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134001
3012	NC_017167	CCG	2	6	209614	209619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134001
3013	NC_017167	CGC	2	6	209659	209664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134001
3014	NC_017167	TCC	2	6	209671	209676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134001
3015	NC_017167	ATC	2	6	209701	209706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134001
3016	NC_017167	GAA	2	6	209736	209741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134001
3017	NC_017167	GCA	2	6	209748	209753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134001
3018	NC_017167	CAT	2	6	209972	209977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134001
3019	NC_017167	ATG	2	6	210053	210058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134001
3020	NC_017167	ATG	2	6	210085	210090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134002
3021	NC_017167	TCG	2	6	210137	210142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134002
3022	NC_017167	TCA	2	6	210694	210699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134003
3023	NC_017167	GCG	2	6	210748	210753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134003
3024	NC_017167	CAT	2	6	210754	210759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134003
3025	NC_017167	GCA	2	6	210790	210795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134003
3026	NC_017167	GTT	2	6	210830	210835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134003
3027	NC_017167	CTT	2	6	211103	211108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134003
3028	NC_017167	TGA	3	9	211192	211200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134003
3029	NC_017167	CTG	2	6	211209	211214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134003
3030	NC_017167	CGT	2	6	211426	211431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134003
3031	NC_017167	AGC	2	6	211752	211757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134003
3032	NC_017167	TTC	2	6	211910	211915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134003
3033	NC_017167	ATG	2	6	211917	211922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134003
3034	NC_017167	ACG	2	6	212677	212682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134004
3035	NC_017167	ACG	2	6	212771	212776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134005
3036	NC_017167	ACC	2	6	212990	212995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134005
3037	NC_017167	CGT	2	6	213108	213113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134005
3038	NC_017167	GAA	2	6	213145	213150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134005
3039	NC_017167	GGC	2	6	213168	213173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134005
3040	NC_017167	CGC	2	6	213348	213353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134005
3041	NC_017167	CCA	2	6	213390	213395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134005
3042	NC_017167	GCA	2	6	213448	213453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134005
3043	NC_017167	GGC	2	6	213486	213491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134005
3044	NC_017167	GCG	2	6	213609	213614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134005
3045	NC_017167	ACG	2	6	213625	213630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134005
3046	NC_017167	CAT	2	6	213633	213638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134005
3047	NC_017167	CGA	2	6	213668	213673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134005
3048	NC_017167	ACG	2	6	213695	213700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134005
3049	NC_017167	GTT	2	6	213705	213710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134005
3050	NC_017167	CGA	2	6	213728	213733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134005
3051	NC_017167	GAC	2	6	213836	213841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134005
3052	NC_017167	CAA	2	6	214060	214065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134006
3053	NC_017167	TCG	2	6	214069	214074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134006
3054	NC_017167	GGC	2	6	214122	214127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134006
3055	NC_017167	TTC	2	6	214196	214201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134006
3056	NC_017167	GTT	2	6	214228	214233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134006
3057	NC_017167	CCG	2	6	214242	214247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134006
3058	NC_017167	GAA	2	6	214665	214670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134007
3059	NC_017167	ACG	2	6	214709	214714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134007
3060	NC_017167	GGT	2	6	214746	214751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134007
3061	NC_017167	GAG	2	6	214756	214761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134007
3062	NC_017167	GCT	2	6	215396	215401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134008
3063	NC_017167	CCA	3	9	215464	215472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134008
3064	NC_017167	CGT	2	6	215494	215499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134008
3065	NC_017167	AGC	2	6	215592	215597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134008
3066	NC_017167	CGC	2	6	215606	215611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134008
3067	NC_017167	CAC	2	6	215624	215629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134008
3068	NC_017167	AGC	2	6	215710	215715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134008
3069	NC_017167	CCT	2	6	215764	215769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134008
3070	NC_017167	CGC	2	6	215874	215879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134008
3071	NC_017167	AGC	3	9	215965	215973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134008
3072	NC_017167	TGG	2	6	216008	216013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134008
3073	NC_017167	CGC	2	6	216063	216068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134008
3074	NC_017167	GCC	2	6	216073	216078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134008
3075	NC_017167	GAC	2	6	216123	216128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134008
3076	NC_017167	CAG	2	6	216183	216188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134008
3077	NC_017167	GTC	2	6	216781	216786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134009
3078	NC_017167	AGC	2	6	216816	216821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134009
3079	NC_017167	TCA	2	6	216839	216844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134009
3080	NC_017167	CTT	2	6	216913	216918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134009
3081	NC_017167	TTG	2	6	217145	217150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134009
3082	NC_017167	TGA	2	6	217269	217274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134009
3083	NC_017167	CGA	2	6	217335	217340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134009
3084	NC_017167	CGC	2	6	217593	217598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134010
3085	NC_017167	TCG	2	6	217623	217628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134011
3086	NC_017167	CTT	2	6	217729	217734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134011
3087	NC_017167	TCA	2	6	217877	217882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134012
3088	NC_017167	TCG	2	6	217911	217916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134012
3089	NC_017167	TCG	2	6	217964	217969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134012
3090	NC_017167	CGG	2	6	217983	217988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134012
3091	NC_017167	GAG	2	6	218065	218070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134012
3092	NC_017167	GCG	2	6	218090	218095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134012
3093	NC_017167	TCG	2	6	218152	218157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134012
3094	NC_017167	CGC	2	6	218160	218165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134012
3095	NC_017167	GGC	2	6	218249	218254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134012
3096	NC_017167	TGG	2	6	218324	218329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134012
3097	NC_017167	TGC	2	6	218354	218359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134012
3098	NC_017167	CGG	2	6	218421	218426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134012
3099	NC_017167	TCG	2	6	218441	218446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134012
3100	NC_017167	GCG	2	6	218453	218458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134012
3101	NC_017167	GTG	2	6	218583	218588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134013
3102	NC_017167	CTA	2	6	218750	218755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134013
3103	NC_017167	GCC	2	6	219156	219161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134014
3104	NC_017167	GAA	2	6	219290	219295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134014
3105	NC_017167	GCA	2	6	219376	219381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134014
3106	NC_017167	GCC	2	6	219435	219440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134014
3107	NC_017167	TCC	2	6	219521	219526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134014
3108	NC_017167	GCC	2	6	219574	219579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134014
3109	NC_017167	CGT	2	6	219610	219615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134014
3110	NC_017167	CCA	2	6	219637	219642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134014
3111	NC_017167	CGC	2	6	219675	219680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134014
3112	NC_017167	TCG	2	6	219783	219788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134014
3113	NC_017167	TCC	2	6	219837	219842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134014
3114	NC_017167	GAG	2	6	220064	220069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134015
3115	NC_017167	GTC	2	6	220103	220108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134015
3116	NC_017167	CAT	2	6	220123	220128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134015
3117	NC_017167	CGC	2	6	220136	220141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134015
3118	NC_017167	CTT	2	6	220201	220206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134015
3119	NC_017167	GAG	2	6	220277	220282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134015
3120	NC_017167	GCA	2	6	220303	220308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134015
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3233	NC_017167	TAC	2	6	227774	227779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134023
3234	NC_017167	AGG	2	6	227787	227792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134023
3235	NC_017167	GAT	2	6	228075	228080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134024
3236	NC_017167	CAC	2	6	228082	228087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134024
3237	NC_017167	GTG	4	12	228127	228138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134024
3238	NC_017167	GGC	2	6	228162	228167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134024
3239	NC_017167	AGC	2	6	228203	228208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3240	NC_017167	GCG	2	6	228232	228237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134024
3241	NC_017167	GAG	2	6	228337	228342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134024
3242	NC_017167	CGT	2	6	228357	228362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3243	NC_017167	GCG	2	6	228367	228372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134024
3244	NC_017167	TCG	2	6	228437	228442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3245	NC_017167	CGC	2	6	228601	228606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134024
3246	NC_017167	GGA	2	6	228633	228638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134024
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3248	NC_017167	GAT	2	6	228723	228728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134024
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3250	NC_017167	GCG	2	6	228996	229001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134024
3251	NC_017167	TCG	2	6	229019	229024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3252	NC_017167	CGA	2	6	229173	229178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3253	NC_017167	CGT	2	6	229239	229244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3254	NC_017167	ACG	2	6	229252	229257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3255	NC_017167	CGA	2	6	229275	229280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134024
3256	NC_017167	ACC	2	6	229309	229314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134024
3257	NC_017167	TCA	2	6	229554	229559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134025
3258	NC_017167	CTC	2	6	229601	229606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134025
3259	NC_017167	CGT	2	6	229651	229656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134025
3260	NC_017167	TCG	2	6	229725	229730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134025
3261	NC_017167	TGC	2	6	229737	229742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134025
3262	NC_017167	CGG	2	6	229746	229751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134025
3263	NC_017167	CTT	2	6	229801	229806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134025
3264	NC_017167	GTG	3	9	229883	229891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134025
3265	NC_017167	CAT	2	6	229957	229962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134025
3266	NC_017167	GCG	2	6	229969	229974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134025
3267	NC_017167	TGA	2	6	229998	230003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134025
3268	NC_017167	CAT	2	6	230005	230010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134025
3269	NC_017167	GAC	2	6	230045	230050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134025
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3271	NC_017167	GCG	2	6	230084	230089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134025
3272	NC_017167	TGC	2	6	230126	230131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134025
3273	NC_017167	GGT	2	6	230191	230196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134025
3274	NC_017167	CAT	2	6	230281	230286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134025
3275	NC_017167	GAG	2	6	230328	230333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134025
3276	NC_017167	TCG	2	6	230476	230481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134026
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3279	NC_017167	CGT	2	6	230639	230644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134026
3280	NC_017167	AGG	2	6	230669	230674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134026
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3337	NC_017167	ATC	2	6	235196	235201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134029
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3341	NC_017167	CAT	2	6	235363	235368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134029
3342	NC_017167	CGC	2	6	235369	235374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134029
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3345	NC_017167	GCG	2	6	235888	235893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134029
3346	NC_017167	CGT	2	6	235903	235908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134029
3347	NC_017167	CGA	2	6	235945	235950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134029
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3349	NC_017167	GTC	2	6	236066	236071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134029
3350	NC_017167	CGC	2	6	236185	236190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134029
3351	NC_017167	GTG	3	9	236366	236374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134029
3352	NC_017167	GAA	2	6	236396	236401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134029
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3354	NC_017167	CCA	2	6	236474	236479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134029
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3473	NC_017167	GCC	2	6	244115	244120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134040
3474	NC_017167	GGT	2	6	244145	244150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134040
3475	NC_017167	TCG	2	6	244183	244188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134040
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3477	NC_017167	TCC	2	6	244353	244358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134040
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