MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 7683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011981	CAT	2	6	178	183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102413
2	NC_011981	CCG	2	6	196	201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102413
3	NC_011981	TCG	2	6	417	422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102413
4	NC_011981	AGC	2	6	431	436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102413
5	NC_011981	ACG	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102413
6	NC_011981	ATG	3	9	638	646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102413
7	NC_011981	ATG	2	6	830	835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102413
8	NC_011981	TCG	2	6	836	841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102413
9	NC_011981	TTG	2	6	976	981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102413
10	NC_011981	ACG	2	6	1135	1140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102413
11	NC_011981	ATG	2	6	1247	1252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102413
12	NC_011981	CTT	2	6	1383	1388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102414
13	NC_011981	CAA	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102414
14	NC_011981	GCG	2	6	1493	1498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102414
15	NC_011981	CAG	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102414
16	NC_011981	GTT	2	6	1731	1736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102414
17	NC_011981	AAT	2	6	1782	1787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102414
18	NC_011981	GCA	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102414
19	NC_011981	CGC	2	6	2237	2242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102414
20	NC_011981	AGA	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102414
21	NC_011981	GAT	2	6	2466	2471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102415
22	NC_011981	ACG	2	6	2488	2493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102415
23	NC_011981	GCG	2	6	2502	2507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102415
24	NC_011981	TTG	2	6	2705	2710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102415
25	NC_011981	GAG	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102415
26	NC_011981	GCC	2	6	2993	2998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102415
27	NC_011981	GAG	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102415
28	NC_011981	CAT	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102415
29	NC_011981	AAG	2	6	3293	3298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102415
30	NC_011981	GAG	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102415
31	NC_011981	GGT	3	9	3441	3449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102415
32	NC_011981	AGG	2	6	3570	3575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102415
33	NC_011981	CAG	2	6	3604	3609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102415
34	NC_011981	ATG	3	9	3631	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102415
35	NC_011981	CAT	2	6	4068	4073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102416
36	NC_011981	AGA	2	6	4147	4152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102416
37	NC_011981	GAT	2	6	4161	4166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102416
38	NC_011981	TCG	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102416
39	NC_011981	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102416
40	NC_011981	GGT	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102416
41	NC_011981	TCG	2	6	4379	4384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102416
42	NC_011981	CAC	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102416
43	NC_011981	TTG	2	6	4421	4426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102416
44	NC_011981	TGC	2	6	4498	4503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102416
45	NC_011981	CAC	2	6	4539	4544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102416
46	NC_011981	CCA	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102416
47	NC_011981	GGA	2	6	4652	4657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102416
48	NC_011981	TCC	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102416
49	NC_011981	CGA	2	6	4729	4734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102416
50	NC_011981	CGG	2	6	4822	4827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102416
51	NC_011981	ACG	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102416
52	NC_011981	CTT	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102416
53	NC_011981	CCG	2	6	5219	5224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102416
54	NC_011981	ACG	2	6	5225	5230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102416
55	NC_011981	TGA	2	6	5805	5810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102417
56	NC_011981	ACC	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102417
57	NC_011981	TGG	2	6	6341	6346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102417
58	NC_011981	AGC	2	6	6428	6433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102417
59	NC_011981	CCG	3	9	6549	6557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102417
60	NC_011981	CAG	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102417
61	NC_011981	GCG	2	6	6989	6994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102417
62	NC_011981	CGG	2	6	7025	7030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102417
63	NC_011981	ATA	2	6	7043	7048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102417
64	NC_011981	ATT	2	6	7136	7141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102417
65	NC_011981	GTT	3	9	7181	7189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102417
66	NC_011981	GTT	2	6	7451	7456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102417
67	NC_011981	TCG	2	6	8064	8069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102418
68	NC_011981	CGG	2	6	8074	8079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102418
69	NC_011981	AGG	2	6	8080	8085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102418
70	NC_011981	CGG	2	6	8247	8252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102418
71	NC_011981	ACC	2	6	8304	8309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102418
72	NC_011981	GGT	2	6	8315	8320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102418
73	NC_011981	GGA	2	6	8324	8329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102418
74	NC_011981	CCG	2	6	8465	8470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102418
75	NC_011981	ACC	2	6	8474	8479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102418
76	NC_011981	CAG	2	6	8492	8497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102418
77	NC_011981	ATC	2	6	8547	8552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102418
78	NC_011981	GAT	2	6	8555	8560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102418
79	NC_011981	GAG	2	6	8694	8699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102418
80	NC_011981	GCC	2	6	8901	8906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102418
81	NC_011981	CGG	2	6	9007	9012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102418
82	NC_011981	GCG	3	9	9019	9027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102418
83	NC_011981	CCG	2	6	9046	9051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102418
84	NC_011981	GCG	3	9	9058	9066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102418
85	NC_011981	CGA	2	6	9103	9108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102418
86	NC_011981	TGG	2	6	11237	11242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102419
87	NC_011981	CAT	2	6	11277	11282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102419
88	NC_011981	AGC	2	6	11294	11299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102419
89	NC_011981	GAC	2	6	11391	11396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102419
90	NC_011981	TTG	2	6	11458	11463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102419
91	NC_011981	GAG	2	6	11478	11483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102419
92	NC_011981	TGC	2	6	11955	11960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102420
93	NC_011981	CGG	2	6	12102	12107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102420
94	NC_011981	GCG	2	6	12166	12171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102420
95	NC_011981	GCG	2	6	12231	12236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102420
96	NC_011981	TCA	2	6	12238	12243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102420
97	NC_011981	CCA	2	6	12247	12252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102420
98	NC_011981	GCC	2	6	12278	12283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102420
99	NC_011981	CAG	2	6	12290	12295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102420
100	NC_011981	GCC	2	6	12299	12304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102420
101	NC_011981	GGC	2	6	12363	12368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102420
102	NC_011981	CGA	2	6	12433	12438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102420
103	NC_011981	ATG	2	6	12605	12610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102420
104	NC_011981	AGC	2	6	12627	12632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102420
105	NC_011981	CGG	2	6	12757	12762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102420
106	NC_011981	GCC	2	6	12897	12902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102420
107	NC_011981	GAG	2	6	12917	12922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102420
108	NC_011981	GGC	2	6	12946	12951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102420
109	NC_011981	ATG	2	6	13289	13294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102421
110	NC_011981	TTG	2	6	13313	13318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102421
111	NC_011981	GCC	2	6	13331	13336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102421
112	NC_011981	TCG	2	6	13380	13385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102421
113	NC_011981	TGC	2	6	13501	13506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102421
114	NC_011981	GAT	2	6	13571	13576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102421
115	NC_011981	GCT	2	6	13643	13648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102421
116	NC_011981	GGC	2	6	13682	13687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102421
117	NC_011981	GTC	2	6	13766	13771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102421
118	NC_011981	TCG	2	6	13833	13838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102421
119	NC_011981	TGG	2	6	13861	13866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102421
120	NC_011981	CGT	2	6	13867	13872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102421
121	NC_011981	GTC	2	6	13897	13902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102421
122	NC_011981	CGG	2	6	13984	13989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102421
123	NC_011981	GCC	2	6	13993	13998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102421
124	NC_011981	TCC	2	6	14030	14035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102421
125	NC_011981	TGC	2	6	14046	14051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102421
126	NC_011981	CAG	2	6	14165	14170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102421
127	NC_011981	ATG	2	6	14171	14176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102421
128	NC_011981	GAA	2	6	14257	14262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102421
129	NC_011981	CCA	2	6	14303	14308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102421
130	NC_011981	CAG	2	6	14447	14452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102421
131	NC_011981	TAC	2	6	14603	14608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102421
132	NC_011981	ACG	2	6	14616	14621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102421
133	NC_011981	CGA	2	6	14671	14676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102421
134	NC_011981	GTC	2	6	14681	14686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102421
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141	NC_011981	CGG	2	6	15013	15018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102422
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145	NC_011981	CGC	2	6	15332	15337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102422
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149	NC_011981	TTC	2	6	15513	15518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102422
150	NC_011981	GGC	2	6	15536	15541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102422
151	NC_011981	GGC	2	6	15645	15650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102422
152	NC_011981	CGG	2	6	15775	15780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102422
153	NC_011981	CCG	2	6	15834	15839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102422
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159	NC_011981	TGG	2	6	16318	16323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102422
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161	NC_011981	CCA	2	6	16385	16390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102422
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164	NC_011981	GCA	2	6	16704	16709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102422
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243	NC_011981	ACC	2	6	22444	22449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102427
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245	NC_011981	GAT	2	6	22611	22616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102427
246	NC_011981	CAA	2	6	22688	22693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102428
247	NC_011981	CGA	2	6	22808	22813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102428
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249	NC_011981	CTG	2	6	22872	22877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102428
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251	NC_011981	CGC	2	6	22936	22941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102428
252	NC_011981	CAT	2	6	22994	22999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102428
253	NC_011981	CTT	2	6	23113	23118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102428
254	NC_011981	CGC	3	9	23132	23140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102428
255	NC_011981	GGC	2	6	23187	23192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102428
256	NC_011981	CGA	2	6	23243	23248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102428
257	NC_011981	GCC	2	6	23289	23294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102428
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259	NC_011981	CCG	2	6	24776	24781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102429
260	NC_011981	TGC	2	6	24943	24948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102429
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262	NC_011981	GAT	2	6	25155	25160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102429
263	NC_011981	CCG	2	6	25213	25218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102429
264	NC_011981	GCA	2	6	25253	25258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102429
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272	NC_011981	TCC	2	6	25704	25709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102430
273	NC_011981	TCA	2	6	25831	25836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102430
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284	NC_011981	GCC	2	6	26752	26757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102431
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324	NC_011981	CTT	2	6	28995	29000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102433
325	NC_011981	CTT	2	6	29063	29068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102433
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361	NC_011981	GAA	2	6	32010	32015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102436
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363	NC_011981	ACC	2	6	32087	32092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102436
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365	NC_011981	CTC	2	6	32182	32187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102436
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372	NC_011981	CGG	2	6	32772	32777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102436
373	NC_011981	TGC	2	6	33056	33061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102436
374	NC_011981	TTG	3	9	33194	33202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102436
375	NC_011981	GCA	2	6	33240	33245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102436
376	NC_011981	CAC	2	6	33850	33855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102437
377	NC_011981	GGC	2	6	33933	33938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102437
378	NC_011981	CAT	2	6	33947	33952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102437
379	NC_011981	GCA	2	6	33972	33977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102437
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382	NC_011981	CGA	2	6	34031	34036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102437
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388	NC_011981	GTG	2	6	34352	34357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102437
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403	NC_011981	GAC	2	6	35328	35333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102437
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494	NC_011981	AAC	2	6	43110	43115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102447
495	NC_011981	CTT	2	6	43190	43195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102447
496	NC_011981	CGT	2	6	43208	43213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102447
497	NC_011981	TCA	2	6	43299	43304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102447
498	NC_011981	TGG	2	6	43531	43536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102448
499	NC_011981	CTG	2	6	43568	43573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102448
500	NC_011981	TCG	2	6	43936	43941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102449

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