MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 7683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011981	GAC	2	6	214175	214180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102606
2502	NC_011981	GCC	2	6	214225	214230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102606
2503	NC_011981	GTC	2	6	214267	214272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102606
2504	NC_011981	GAC	2	6	214290	214295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102606
2505	NC_011981	AAT	2	6	214511	214516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102607
2506	NC_011981	CCA	2	6	214570	214575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102607
2507	NC_011981	TCC	2	6	214774	214779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102607
2508	NC_011981	GGC	2	6	214787	214792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102607
2509	NC_011981	ACA	2	6	214813	214818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102607
2510	NC_011981	GCC	2	6	214836	214841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102607
2511	NC_011981	ACA	2	6	214861	214866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102607
2512	NC_011981	CAT	2	6	214886	214891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102607
2513	NC_011981	CCA	2	6	215105	215110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102607
2514	NC_011981	ACG	2	6	215137	215142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102607
2515	NC_011981	GCC	2	6	215154	215159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102607
2516	NC_011981	TTC	2	6	215176	215181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102607
2517	NC_011981	CCA	2	6	215243	215248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102607
2518	NC_011981	CCG	3	9	215293	215301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102607
2519	NC_011981	GAC	2	6	215304	215309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102607
2520	NC_011981	GTG	2	6	215365	215370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102607
2521	NC_011981	ACC	2	6	215503	215508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102607
2522	NC_011981	GGC	2	6	215706	215711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102607
2523	NC_011981	GCC	2	6	215735	215740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102607
2524	NC_011981	TCG	2	6	215749	215754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102607
2525	NC_011981	CAT	2	6	215780	215785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102607
2526	NC_011981	GGC	2	6	215805	215810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102607
2527	NC_011981	TTG	2	6	215966	215971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102607
2528	NC_011981	GAC	2	6	216013	216018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102608
2529	NC_011981	GCA	2	6	216156	216161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102608
2530	NC_011981	TTC	2	6	216194	216199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102608
2531	NC_011981	GAA	2	6	216286	216291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102608
2532	NC_011981	GTC	2	6	216304	216309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102608
2533	NC_011981	CAC	2	6	216442	216447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102608
2534	NC_011981	GGC	2	6	216490	216495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102608
2535	NC_011981	GAC	2	6	216557	216562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102608
2536	NC_011981	GCA	2	6	216593	216598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102608
2537	NC_011981	GAT	2	6	216643	216648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102608
2538	NC_011981	CCG	2	6	216740	216745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102608
2539	NC_011981	CGG	2	6	216789	216794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102608
2540	NC_011981	CCG	2	6	216840	216845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102608
2541	NC_011981	ATG	2	6	216869	216874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102608
2542	NC_011981	ACG	2	6	216991	216996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102609
2543	NC_011981	CGT	2	6	217034	217039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102609
2544	NC_011981	AGC	2	6	217126	217131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102609
2545	NC_011981	GAT	2	6	217176	217181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102609
2546	NC_011981	GTT	2	6	217194	217199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102609
2547	NC_011981	CGG	2	6	217316	217321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102609
2548	NC_011981	ATC	2	6	217327	217332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102609
2549	NC_011981	CAA	2	6	217337	217342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102609
2550	NC_011981	GAA	2	6	217344	217349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102609
2551	NC_011981	TTG	2	6	217393	217398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102609
2552	NC_011981	ATC	2	6	217545	217550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102609
2553	NC_011981	ACG	2	6	218005	218010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102610
2554	NC_011981	CCG	2	6	218120	218125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102610
2555	NC_011981	CTT	2	6	218207	218212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102610
2556	NC_011981	GAT	2	6	218225	218230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102610
2557	NC_011981	CAT	2	6	218375	218380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102610
2558	NC_011981	TCT	2	6	218426	218431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102610
2559	NC_011981	CTT	2	6	218459	218464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102610
2560	NC_011981	ATG	2	6	218476	218481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102610
2561	NC_011981	GCA	2	6	218486	218491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102610
2562	NC_011981	CAT	2	6	218514	218519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102610
2563	NC_011981	ATG	2	6	218548	218553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102610
2564	NC_011981	TGT	2	6	218618	218623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102610
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2566	NC_011981	TGA	2	6	218784	218789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102611
2567	NC_011981	TCG	2	6	218892	218897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102611
2568	NC_011981	ATG	2	6	218968	218973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102611
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2570	NC_011981	ATG	2	6	219360	219365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102613
2571	NC_011981	GAT	2	6	219533	219538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102613
2572	NC_011981	TTG	2	6	219606	219611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102613
2573	NC_011981	TCG	2	6	219810	219815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102613
2574	NC_011981	GCC	3	9	220035	220043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102613
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2576	NC_011981	GGT	2	6	220229	220234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102613
2577	NC_011981	ATG	2	6	220254	220259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102613
2578	NC_011981	CAG	2	6	220310	220315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102614
2579	NC_011981	TGC	2	6	220396	220401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102614
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2581	NC_011981	TGG	2	6	220459	220464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102614
2582	NC_011981	CAT	2	6	220474	220479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102614
2583	NC_011981	ATC	2	6	220611	220616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102614
2584	NC_011981	GCC	2	6	220665	220670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102614
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2587	NC_011981	ATC	2	6	220868	220873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102614
2588	NC_011981	CAT	2	6	221002	221007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102614
2589	NC_011981	CCA	2	6	221008	221013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102614
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2591	NC_011981	GTG	2	6	221166	221171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102614
2592	NC_011981	GCC	2	6	221240	221245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102615
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2594	NC_011981	TCT	2	6	221327	221332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102615
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2599	NC_011981	CCT	2	6	221610	221615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102615
2600	NC_011981	CCG	2	6	221664	221669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102615
2601	NC_011981	CCA	2	6	221742	221747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102615
2602	NC_011981	GGC	2	6	221773	221778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102615
2603	NC_011981	CCG	2	6	222162	222167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102615
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2605	NC_011981	CCA	2	6	222236	222241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102615
2606	NC_011981	GAC	2	6	222274	222279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102615
2607	NC_011981	CCG	3	9	222437	222445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102615
2608	NC_011981	TGA	2	6	222529	222534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102616
2609	NC_011981	AAT	2	6	222556	222561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102616
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2612	NC_011981	ATG	2	6	222669	222674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102616
2613	NC_011981	GCG	2	6	222701	222706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102616
2614	NC_011981	GTG	2	6	222975	222980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102616
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2616	NC_011981	CAA	2	6	223210	223215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102616
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2618	NC_011981	GGC	2	6	223525	223530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102617
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2623	NC_011981	TGC	2	6	224081	224086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102617
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2734	NC_011981	GGT	2	6	231162	231167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102622
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2736	NC_011981	ACG	2	6	231221	231226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102622
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2852	NC_011981	ACG	2	6	240861	240866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102631
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2855	NC_011981	TGG	2	6	241280	241285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102631
2856	NC_011981	GCC	2	6	241458	241463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102631
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2972	NC_011981	GGC	2	6	250161	250166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102638
2973	NC_011981	ATG	2	6	250174	250179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102638
2974	NC_011981	CTG	2	6	250218	250223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102638
2975	NC_011981	GTC	2	6	250269	250274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102638
2976	NC_011981	CAG	2	6	250275	250280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102638
2977	NC_011981	TGC	2	6	250412	250417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102638
2978	NC_011981	AAT	2	6	250514	250519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102638
2979	NC_011981	CTG	2	6	250521	250526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102638
2980	NC_011981	TGC	2	6	250636	250641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102638
2981	NC_011981	CTG	2	6	250650	250655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102638
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2988	NC_011981	GAT	2	6	251258	251263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102638
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2992	NC_011981	CTT	2	6	251705	251710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102638
2993	NC_011981	CGC	2	6	251840	251845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102638
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2998	NC_011981	CAG	2	6	252442	252447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102639
2999	NC_011981	CCG	2	6	252448	252453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102639
3000	NC_011981	CTG	2	6	252480	252485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102639

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