MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 7683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011981	TCA	2	6	327332	327337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102679
4002	NC_011981	GCC	2	6	327573	327578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102680
4003	NC_011981	TGC	2	6	327626	327631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102680
4004	NC_011981	CGC	2	6	327778	327783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102680
4005	NC_011981	GAC	2	6	327841	327846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102680
4006	NC_011981	CGG	2	6	327930	327935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102680
4007	NC_011981	TGA	2	6	327960	327965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102680
4008	NC_011981	CGG	2	6	327986	327991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102680
4009	NC_011981	CGG	2	6	327995	328000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102680
4010	NC_011981	GCT	2	6	328023	328028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102680
4011	NC_011981	CCG	2	6	328089	328094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102680
4012	NC_011981	TAT	2	6	328095	328100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102680
4013	NC_011981	TGG	2	6	328126	328131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102680
4014	NC_011981	AAC	2	6	328156	328161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102680
4015	NC_011981	CTA	2	6	328317	328322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102680
4016	NC_011981	ATT	2	6	328463	328468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102680
4017	NC_011981	TCA	2	6	328483	328488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102680
4018	NC_011981	CAA	2	6	328579	328584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102680
4019	NC_011981	GCT	2	6	328596	328601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102680
4020	NC_011981	CGG	2	6	328679	328684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102680
4021	NC_011981	CGC	2	6	328877	328882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102680
4022	NC_011981	GCA	2	6	328947	328952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102680
4023	NC_011981	GGA	2	6	329001	329006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102680
4024	NC_011981	AGC	2	6	329049	329054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102680
4025	NC_011981	CGC	2	6	329068	329073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102680
4026	NC_011981	CGA	2	6	329112	329117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102680
4027	NC_011981	TGA	2	6	329150	329155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102680
4028	NC_011981	ATC	2	6	329239	329244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102680
4029	NC_011981	CTG	2	6	329308	329313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102680
4030	NC_011981	GAG	2	6	329351	329356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102680
4031	NC_011981	TGG	2	6	329383	329388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102681
4032	NC_011981	TGC	2	6	329390	329395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102681
4033	NC_011981	GCC	2	6	329523	329528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102681
4034	NC_011981	GAA	2	6	329664	329669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102681
4035	NC_011981	GAC	2	6	329706	329711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102681
4036	NC_011981	GGC	2	6	329768	329773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102681
4037	NC_011981	TGG	2	6	329952	329957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102681
4038	NC_011981	GAT	2	6	330090	330095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102681
4039	NC_011981	GAT	2	6	330221	330226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102682
4040	NC_011981	GCG	2	6	330235	330240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102682
4041	NC_011981	TCG	2	6	330253	330258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102682
4042	NC_011981	GGC	2	6	330305	330310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102682
4043	NC_011981	ATT	2	6	330408	330413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102682
4044	NC_011981	GCA	2	6	330421	330426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102682
4045	NC_011981	TCC	2	6	330517	330522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102682
4046	NC_011981	GCG	2	6	330572	330577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102682
4047	NC_011981	GAT	3	9	330650	330658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102682
4048	NC_011981	CCA	2	6	330902	330907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102682
4049	NC_011981	ATG	2	6	330965	330970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102682
4050	NC_011981	GAC	2	6	331034	331039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102683
4051	NC_011981	CAT	2	6	331043	331048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102683
4052	NC_011981	TCC	2	6	331102	331107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102683
4053	NC_011981	GTC	2	6	331141	331146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102683
4054	NC_011981	GCC	2	6	331179	331184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102683
4055	NC_011981	TGT	2	6	331265	331270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102683
4056	NC_011981	ACG	2	6	331396	331401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102684
4057	NC_011981	GTC	2	6	331517	331522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102684
4058	NC_011981	CCA	2	6	331535	331540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102684
4059	NC_011981	CGC	2	6	331650	331655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102684
4060	NC_011981	GCA	2	6	331790	331795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102684
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4062	NC_011981	GCT	2	6	332324	332329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102685
4063	NC_011981	GTC	2	6	332388	332393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102685
4064	NC_011981	GCC	2	6	332402	332407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102685
4065	NC_011981	CGG	2	6	332597	332602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102685
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4067	NC_011981	TCG	2	6	332803	332808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102685
4068	NC_011981	CGC	2	6	332842	332847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102685
4069	NC_011981	ACG	2	6	332857	332862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102685
4070	NC_011981	CAA	2	6	332938	332943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102685
4071	NC_011981	GGC	2	6	333054	333059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102685
4072	NC_011981	CAG	2	6	333129	333134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102685
4073	NC_011981	GAT	2	6	333182	333187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102685
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4085	NC_011981	CGA	2	6	334496	334501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102686
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4089	NC_011981	CGG	2	6	334658	334663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102686
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4100	NC_011981	GCT	2	6	335657	335662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102687
4101	NC_011981	GAT	2	6	335747	335752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102687
4102	NC_011981	CGG	2	6	335785	335790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102687
4103	NC_011981	ATG	2	6	335898	335903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102687
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4105	NC_011981	TCA	2	6	336079	336084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102687
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4107	NC_011981	CGG	2	6	336104	336109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102687
4108	NC_011981	TCA	3	9	336202	336210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102687
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4118	NC_011981	GGC	2	6	336633	336638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102688
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4122	NC_011981	CGT	2	6	336729	336734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102688
4123	NC_011981	TGC	2	6	336773	336778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102688
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4472	NC_011981	ATT	2	6	365216	365221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102714
4473	NC_011981	CCA	2	6	365325	365330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102714
4474	NC_011981	TCA	2	6	365340	365345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102714
4475	NC_011981	GCC	2	6	365406	365411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102714
4476	NC_011981	GCT	2	6	365413	365418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102714
4477	NC_011981	GCG	2	6	365444	365449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102714
4478	NC_011981	TGG	2	6	366226	366231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102715
4479	NC_011981	GTC	2	6	366300	366305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102715
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4487	NC_011981	AGC	2	6	366710	366715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102715
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4499	NC_011981	GCT	2	6	367674	367679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102716
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