MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 7683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011981	CCA	2	6	413373	413378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102758
5002	NC_011981	CAT	2	6	413384	413389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102758
5003	NC_011981	GTG	3	9	413412	413420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102758
5004	NC_011981	TCG	2	6	413425	413430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102758
5005	NC_011981	GCA	2	6	413524	413529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102758
5006	NC_011981	CAG	2	6	413934	413939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102758
5007	NC_011981	CTG	2	6	414085	414090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102758
5008	NC_011981	GGC	2	6	414168	414173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102758
5009	NC_011981	CCA	2	6	414233	414238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102758
5010	NC_011981	GTT	2	6	414301	414306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102758
5011	NC_011981	CAT	2	6	414308	414313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102758
5012	NC_011981	GAA	2	6	414364	414369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102758
5013	NC_011981	AGC	2	6	414400	414405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102758
5014	NC_011981	CCA	2	6	414485	414490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102758
5015	NC_011981	GGT	2	6	414551	414556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102758
5016	NC_011981	GCC	2	6	414592	414597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102758
5017	NC_011981	CCG	2	6	414718	414723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102758
5018	NC_011981	AGG	2	6	414740	414745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102758
5019	NC_011981	GCG	2	6	414802	414807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102758
5020	NC_011981	TCA	2	6	414812	414817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102758
5021	NC_011981	CAT	2	6	414875	414880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102758
5022	NC_011981	GGC	2	6	414987	414992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102758
5023	NC_011981	CCA	2	6	415121	415126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102758
5024	NC_011981	GCC	2	6	415131	415136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102758
5025	NC_011981	TCT	2	6	415195	415200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102758
5026	NC_011981	GGA	2	6	415224	415229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102758
5027	NC_011981	ATC	2	6	415248	415253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102758
5028	NC_011981	CGG	2	6	415637	415642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102758
5029	NC_011981	CAG	2	6	415656	415661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102758
5030	NC_011981	ATA	2	6	415689	415694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102758
5031	NC_011981	CAC	2	6	415880	415885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102758
5032	NC_011981	TTC	2	6	415914	415919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102758
5033	NC_011981	CAG	2	6	415941	415946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102758
5034	NC_011981	CGT	2	6	415998	416003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102758
5035	NC_011981	ATG	2	6	416143	416148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102758
5036	NC_011981	ACG	2	6	416586	416591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102759
5037	NC_011981	TTC	2	6	416680	416685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102759
5038	NC_011981	GGC	2	6	416742	416747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102759
5039	NC_011981	GCC	2	6	416824	416829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102759
5040	NC_011981	AAG	2	6	416839	416844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102759
5041	NC_011981	GTG	2	6	416968	416973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102759
5042	NC_011981	TGA	2	6	417014	417019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102759
5043	NC_011981	CAC	2	6	417051	417056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102759
5044	NC_011981	GTG	2	6	417332	417337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102759
5045	NC_011981	GTG	2	6	417394	417399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102759
5046	NC_011981	ACA	2	6	417406	417411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102759
5047	NC_011981	CGG	2	6	417444	417449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102759
5048	NC_011981	TTG	2	6	417461	417466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102759
5049	NC_011981	CAA	2	6	417483	417488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102759
5050	NC_011981	GGC	2	6	417559	417564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102759
5051	NC_011981	CGG	2	6	417821	417826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102760
5052	NC_011981	TCT	2	6	417902	417907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102760
5053	NC_011981	GCT	2	6	417972	417977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102760
5054	NC_011981	ATC	2	6	418084	418089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102760
5055	NC_011981	CAT	2	6	418159	418164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102760
5056	NC_011981	GGC	2	6	418307	418312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102760
5057	NC_011981	CAT	3	9	418329	418337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102760
5058	NC_011981	ATG	2	6	418441	418446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102760
5059	NC_011981	TGC	2	6	418457	418462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102760
5060	NC_011981	TGA	2	6	418588	418593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102760
5061	NC_011981	CGC	2	6	418608	418613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102761
5062	NC_011981	ATG	2	6	418615	418620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102761
5063	NC_011981	CTG	2	6	418638	418643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102761
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5066	NC_011981	CAT	2	6	418838	418843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102761
5067	NC_011981	ATC	2	6	418947	418952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102761
5068	NC_011981	TGG	2	6	418984	418989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102761
5069	NC_011981	GTG	2	6	419004	419009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102761
5070	NC_011981	TGA	2	6	419038	419043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102761
5071	NC_011981	GCC	2	6	419055	419060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102761
5072	NC_011981	GGC	2	6	419093	419098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102761
5073	NC_011981	TGG	2	6	419227	419232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102761
5074	NC_011981	TGA	2	6	419263	419268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102761
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5077	NC_011981	TGG	2	6	419290	419295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102761
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5082	NC_011981	TGA	2	6	419525	419530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102762
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5089	NC_011981	CGG	2	6	419852	419857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102762
5090	NC_011981	CGT	2	6	419888	419893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102762
5091	NC_011981	CTG	2	6	419910	419915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102762
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5100	NC_011981	TGG	2	6	420548	420553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102763
5101	NC_011981	CCG	2	6	420587	420592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102763
5102	NC_011981	CCA	2	6	420680	420685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102763
5103	NC_011981	CCA	2	6	420692	420697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102763
5104	NC_011981	GAT	2	6	420812	420817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102763
5105	NC_011981	CGC	2	6	420820	420825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102763
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5107	NC_011981	GCT	2	6	420924	420929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102763
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5111	NC_011981	CCA	2	6	421142	421147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102763
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5114	NC_011981	GCA	2	6	421310	421315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102763
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5116	NC_011981	GGA	2	6	421515	421520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102763
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5118	NC_011981	GAC	2	6	421658	421663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102763
5119	NC_011981	AAT	2	6	421701	421706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102763
5120	NC_011981	CCA	2	6	421950	421955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102764
5121	NC_011981	TGT	2	6	422010	422015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102764
5122	NC_011981	TGA	2	6	422126	422131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102764
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5131	NC_011981	CTG	2	6	423600	423605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102765
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5474	NC_011981	CAG	2	6	453434	453439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102789
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