MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 7683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011981	GTT	2	6	252486	252491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102639
3002	NC_011981	GCG	2	6	252536	252541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102639
3003	NC_011981	GCC	2	6	252580	252585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102639
3004	NC_011981	CGG	2	6	252601	252606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102639
3005	NC_011981	GCC	2	6	252647	252652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102639
3006	NC_011981	TTC	2	6	252738	252743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102639
3007	NC_011981	CGT	2	6	252843	252848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102639
3008	NC_011981	GCG	2	6	252922	252927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102639
3009	NC_011981	TCA	2	6	252950	252955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102639
3010	NC_011981	TCG	2	6	253033	253038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102639
3011	NC_011981	GTC	2	6	253057	253062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102639
3012	NC_011981	GGC	2	6	253110	253115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102639
3013	NC_011981	GCG	2	6	253131	253136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102639
3014	NC_011981	CCT	2	6	253145	253150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102639
3015	NC_011981	CGC	2	6	253170	253175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102639
3016	NC_011981	CAT	2	6	253176	253181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102639
3017	NC_011981	GCC	2	6	253409	253414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102640
3018	NC_011981	GCG	2	6	253437	253442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102640
3019	NC_011981	CAT	2	6	253516	253521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102640
3020	NC_011981	GCA	2	6	253555	253560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102640
3021	NC_011981	TTG	2	6	253590	253595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102640
3022	NC_011981	CCG	2	6	253614	253619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102640
3023	NC_011981	GAG	2	6	253775	253780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102640
3024	NC_011981	CCG	2	6	253815	253820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102640
3025	NC_011981	CTG	2	6	253984	253989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102640
3026	NC_011981	AAG	2	6	254000	254005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102640
3027	NC_011981	CGC	2	6	254157	254162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102641
3028	NC_011981	GCC	2	6	254200	254205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102641
3029	NC_011981	AAG	2	6	254213	254218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102641
3030	NC_011981	TGG	2	6	254430	254435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102641
3031	NC_011981	ATG	2	6	254447	254452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102641
3032	NC_011981	ATA	2	6	254456	254461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102641
3033	NC_011981	TCA	2	6	254588	254593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102641
3034	NC_011981	ACG	2	6	254663	254668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102641
3035	NC_011981	AGC	2	6	254669	254674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102641
3036	NC_011981	GCG	2	6	254708	254713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102641
3037	NC_011981	TGA	2	6	254823	254828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102641
3038	NC_011981	ATC	2	6	254837	254842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102641
3039	NC_011981	GCA	2	6	254946	254951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102641
3040	NC_011981	GGC	2	6	254974	254979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102641
3041	NC_011981	CTT	2	6	255133	255138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102641
3042	NC_011981	TCG	2	6	255227	255232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102641
3043	NC_011981	GAT	2	6	255262	255267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102641
3044	NC_011981	TCG	2	6	255479	255484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102641
3045	NC_011981	CTC	2	6	255487	255492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102641
3046	NC_011981	AGA	2	6	255495	255500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102641
3047	NC_011981	GCC	2	6	255545	255550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102641
3048	NC_011981	ATC	2	6	255755	255760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102642
3049	NC_011981	CTG	2	6	255787	255792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3050	NC_011981	CGC	2	6	255860	255865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102642
3051	NC_011981	CGC	2	6	255931	255936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102642
3052	NC_011981	AAC	2	6	256038	256043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102642
3053	NC_011981	TCC	2	6	256086	256091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102642
3054	NC_011981	CGT	2	6	256144	256149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3055	NC_011981	CGG	2	6	256158	256163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102642
3056	NC_011981	TTC	2	6	256373	256378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102642
3057	NC_011981	GAA	2	6	256411	256416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102642
3058	NC_011981	TGC	2	6	256477	256482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3059	NC_011981	TCG	2	6	256492	256497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3060	NC_011981	TGT	2	6	256598	256603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102642
3061	NC_011981	GGC	2	6	256608	256613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102642
3062	NC_011981	TCA	2	6	256662	256667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102642
3063	NC_011981	GAT	2	6	256702	256707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102642
3064	NC_011981	CAG	2	6	256718	256723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3065	NC_011981	GCG	2	6	256864	256869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102642
3066	NC_011981	TGC	2	6	256914	256919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3067	NC_011981	CAT	2	6	256939	256944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102642
3068	NC_011981	TGG	2	6	256950	256955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102642
3069	NC_011981	CTG	2	6	256970	256975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3070	NC_011981	TCT	2	6	256981	256986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102642
3071	NC_011981	CGC	2	6	257092	257097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102642
3072	NC_011981	GCG	2	6	257207	257212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102642
3073	NC_011981	CGC	2	6	257213	257218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102642
3074	NC_011981	CCA	2	6	257250	257255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102642
3075	NC_011981	AAG	2	6	257262	257267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102642
3076	NC_011981	TCT	2	6	257323	257328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102642
3077	NC_011981	TCT	2	6	257355	257360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102642
3078	NC_011981	GCC	2	6	257523	257528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102642
3079	NC_011981	GCG	2	6	257541	257546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102642
3080	NC_011981	CGG	2	6	257584	257589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102642
3081	NC_011981	CGA	2	6	257712	257717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3082	NC_011981	CCG	2	6	257788	257793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102642
3083	NC_011981	TGC	2	6	257882	257887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3084	NC_011981	GGT	2	6	257903	257908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102642
3085	NC_011981	TGA	2	6	258148	258153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102642
3086	NC_011981	ATC	2	6	258197	258202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102642
3087	NC_011981	GCG	2	6	258225	258230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102642
3088	NC_011981	CCG	2	6	258304	258309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102642
3089	NC_011981	CGG	2	6	258478	258483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102642
3090	NC_011981	TCT	2	6	258522	258527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102642
3091	NC_011981	AAG	2	6	258822	258827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102642
3092	NC_011981	CAT	2	6	258850	258855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102642
3093	NC_011981	CTG	2	6	258887	258892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3094	NC_011981	AGA	2	6	258948	258953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102642
3095	NC_011981	GGA	2	6	258988	258993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102642
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3097	NC_011981	CAC	2	6	259103	259108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102642
3098	NC_011981	TGC	2	6	259143	259148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3099	NC_011981	TCG	2	6	259149	259154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3100	NC_011981	CTG	2	6	259292	259297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3101	NC_011981	GCA	2	6	259311	259316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3102	NC_011981	TCC	2	6	259365	259370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102642
3103	NC_011981	GAC	2	6	259409	259414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3104	NC_011981	CAG	2	6	259439	259444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3105	NC_011981	TGC	2	6	259546	259551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3106	NC_011981	CAC	2	6	259573	259578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102642
3107	NC_011981	GGC	2	6	259627	259632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102642
3108	NC_011981	GCT	2	6	259660	259665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3109	NC_011981	CAT	2	6	259741	259746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102642
3110	NC_011981	GCA	2	6	259765	259770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3111	NC_011981	TGG	2	6	259803	259808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102642
3112	NC_011981	CGA	2	6	259813	259818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3113	NC_011981	AAC	2	6	259820	259825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102642
3114	NC_011981	GCA	2	6	259902	259907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3115	NC_011981	GGC	2	6	260117	260122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102642
3116	NC_011981	GCT	2	6	260158	260163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3117	NC_011981	TCG	2	6	260182	260187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3118	NC_011981	GCC	2	6	260223	260228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102642
3119	NC_011981	GCG	2	6	260256	260261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102642
3120	NC_011981	GCA	2	6	260296	260301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102642
3121	NC_011981	CAG	2	6	260351	260356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102642
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3355	NC_011981	CTG	2	6	277055	277060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102649
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3470	NC_011981	CTG	2	6	285839	285844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3471	NC_011981	TCG	2	6	286053	286058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3472	NC_011981	ATC	2	6	286176	286181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102652
3473	NC_011981	GCC	2	6	286318	286323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102652
3474	NC_011981	TCT	2	6	286348	286353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102652
3475	NC_011981	CAC	2	6	286477	286482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102652
3476	NC_011981	ACC	2	6	286538	286543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102652
3477	NC_011981	CTG	2	6	286562	286567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3478	NC_011981	GCG	3	9	286695	286703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102652
3479	NC_011981	TGG	2	6	286846	286851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102652
3480	NC_011981	GGC	2	6	286916	286921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102652
3481	NC_011981	CGG	2	6	286933	286938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102652
3482	NC_011981	GCC	2	6	286982	286987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102652
3483	NC_011981	ATG	2	6	287010	287015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102652
3484	NC_011981	GTT	2	6	287057	287062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102652
3485	NC_011981	GCT	2	6	287158	287163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3486	NC_011981	GTT	2	6	287174	287179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102652
3487	NC_011981	GGA	2	6	287344	287349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102652
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3490	NC_011981	TTC	2	6	287516	287521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102652
3491	NC_011981	GGT	2	6	287528	287533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102652
3492	NC_011981	CAT	2	6	287908	287913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102652
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3495	NC_011981	TGC	2	6	288040	288045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3496	NC_011981	GCC	2	6	288084	288089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102652
3497	NC_011981	CCA	2	6	288109	288114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102652
3498	NC_011981	GGC	2	6	288325	288330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102652
3499	NC_011981	AGG	2	6	288333	288338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102652
3500	NC_011981	GCC	2	6	288389	288394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102652

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