MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 7683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011981	CTT	2	6	86361	86366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102490
1002	NC_011981	GCC	2	6	86376	86381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102490
1003	NC_011981	CCA	2	6	86423	86428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102490
1004	NC_011981	CAA	2	6	86537	86542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102490
1005	NC_011981	CAT	2	6	86574	86579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102490
1006	NC_011981	TGA	2	6	86648	86653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102490
1007	NC_011981	TCG	2	6	88028	88033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102491
1008	NC_011981	CAG	2	6	88074	88079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102491
1009	NC_011981	GAT	2	6	88231	88236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102491
1010	NC_011981	TCC	2	6	88307	88312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102491
1011	NC_011981	ATC	2	6	88389	88394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102492
1012	NC_011981	CTT	2	6	88398	88403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102492
1013	NC_011981	TGC	2	6	88421	88426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102492
1014	NC_011981	ACG	2	6	88428	88433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102492
1015	NC_011981	TCC	2	6	88501	88506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102492
1016	NC_011981	CCA	2	6	88585	88590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102492
1017	NC_011981	GCA	2	6	88992	88997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102493
1018	NC_011981	TCT	2	6	89244	89249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102493
1019	NC_011981	TGA	2	6	89286	89291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102493
1020	NC_011981	GCG	2	6	89369	89374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102493
1021	NC_011981	GTG	2	6	89399	89404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102493
1022	NC_011981	TCG	2	6	89417	89422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102493
1023	NC_011981	GCC	2	6	89514	89519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102493
1024	NC_011981	GGC	2	6	89569	89574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102493
1025	NC_011981	TCA	2	6	89618	89623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102493
1026	NC_011981	TGA	2	6	89645	89650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102493
1027	NC_011981	CAG	2	6	89792	89797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102493
1028	NC_011981	GCG	2	6	89906	89911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102493
1029	NC_011981	CGG	2	6	89931	89936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102493
1030	NC_011981	GCA	3	9	90040	90048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102493
1031	NC_011981	GCA	2	6	90327	90332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102494
1032	NC_011981	GTT	2	6	90335	90340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102494
1033	NC_011981	CGC	2	6	90683	90688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102494
1034	NC_011981	CGG	2	6	90906	90911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102494
1035	NC_011981	GCA	2	6	90947	90952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102494
1036	NC_011981	TCA	2	6	91165	91170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102494
1037	NC_011981	CGG	2	6	91228	91233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102494
1038	NC_011981	GGC	2	6	91246	91251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102494
1039	NC_011981	GTG	2	6	91402	91407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102495
1040	NC_011981	TGA	2	6	91756	91761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102495
1041	NC_011981	GGA	2	6	91795	91800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102495
1042	NC_011981	CAT	2	6	91944	91949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102496
1043	NC_011981	GTC	2	6	92152	92157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102496
1044	NC_011981	GCG	2	6	92206	92211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102496
1045	NC_011981	GGC	2	6	92220	92225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102496
1046	NC_011981	TCT	2	6	92255	92260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102496
1047	NC_011981	ACG	2	6	92440	92445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102496
1048	NC_011981	TCG	2	6	92532	92537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102496
1049	NC_011981	CTT	2	6	92652	92657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102496
1050	NC_011981	TCG	2	6	92866	92871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102497
1051	NC_011981	ATG	2	6	92980	92985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102497
1052	NC_011981	TCA	2	6	93241	93246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102497
1053	NC_011981	GTG	2	6	93488	93493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102498
1054	NC_011981	GGC	2	6	93764	93769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102498
1055	NC_011981	TCT	2	6	93826	93831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102498
1056	NC_011981	GTG	2	6	93874	93879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102498
1057	NC_011981	CCA	2	6	93885	93890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102498
1058	NC_011981	GAG	2	6	93936	93941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102498
1059	NC_011981	CGT	2	6	93973	93978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102498
1060	NC_011981	TGG	2	6	94498	94503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102499
1061	NC_011981	TAA	2	6	94606	94611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102499
1062	NC_011981	TGT	2	6	94633	94638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102499
1063	NC_011981	AGC	2	6	94689	94694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102499
1064	NC_011981	GAA	2	6	94787	94792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102499
1065	NC_011981	GCG	2	6	94800	94805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102499
1066	NC_011981	GCG	2	6	94969	94974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102499
1067	NC_011981	CTT	2	6	95101	95106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102499
1068	NC_011981	GAT	2	6	95365	95370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102500
1069	NC_011981	CGC	2	6	95461	95466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102500
1070	NC_011981	ATG	2	6	95470	95475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102500
1071	NC_011981	ACC	2	6	95537	95542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102500
1072	NC_011981	GTC	2	6	95626	95631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102500
1073	NC_011981	AGC	2	6	95642	95647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102500
1074	NC_011981	GAT	2	6	95698	95703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102500
1075	NC_011981	CGC	2	6	95706	95711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102500
1076	NC_011981	CGT	2	6	95908	95913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102501
1077	NC_011981	GCA	2	6	95949	95954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102501
1078	NC_011981	GCT	2	6	96045	96050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102501
1079	NC_011981	CGT	2	6	96068	96073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102501
1080	NC_011981	GCC	2	6	96077	96082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102501
1081	NC_011981	CAA	2	6	96090	96095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102501
1082	NC_011981	CAT	2	6	96144	96149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102501
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1084	NC_011981	AGC	2	6	96583	96588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102502
1085	NC_011981	CTC	2	6	96789	96794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102502
1086	NC_011981	ATA	2	6	96820	96825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102502
1087	NC_011981	GGT	2	6	96927	96932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102502
1088	NC_011981	ACC	2	6	97021	97026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102502
1089	NC_011981	GCT	2	6	97143	97148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102502
1090	NC_011981	GCG	2	6	97149	97154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102502
1091	NC_011981	TGA	2	6	97198	97203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102502
1092	NC_011981	CCG	2	6	97208	97213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102502
1093	NC_011981	TGC	3	9	97263	97271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102502
1094	NC_011981	TCT	2	6	97305	97310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102502
1095	NC_011981	CCG	2	6	97507	97512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102503
1096	NC_011981	GCA	2	6	97552	97557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102503
1097	NC_011981	TGG	2	6	97569	97574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102503
1098	NC_011981	TCA	2	6	97617	97622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102503
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1100	NC_011981	GCG	2	6	97692	97697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102503
1101	NC_011981	CTG	2	6	97740	97745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102503
1102	NC_011981	ACA	2	6	97764	97769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102503
1103	NC_011981	GCA	2	6	97937	97942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102503
1104	NC_011981	CAG	2	6	98026	98031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102503
1105	NC_011981	GCG	2	6	98129	98134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102503
1106	NC_011981	TGC	2	6	98163	98168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102503
1107	NC_011981	CAC	2	6	98218	98223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102503
1108	NC_011981	ATG	2	6	98243	98248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102503
1109	NC_011981	CAT	2	6	98263	98268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102503
1110	NC_011981	TCA	2	6	98412	98417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102503
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1116	NC_011981	GCT	2	6	98813	98818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102504
1117	NC_011981	CCA	3	9	98840	98848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102504
1118	NC_011981	CAC	2	6	98901	98906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102504
1119	NC_011981	GCC	2	6	98910	98915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102504
1120	NC_011981	CGC	2	6	98952	98957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102504
1121	NC_011981	GGC	2	6	99014	99019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102504
1122	NC_011981	TGA	2	6	99299	99304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102504
1123	NC_011981	GTT	2	6	99385	99390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102504
1124	NC_011981	TGC	2	6	99402	99407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102504
1125	NC_011981	TCC	2	6	99415	99420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102504
1126	NC_011981	AGC	2	6	99435	99440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102504
1127	NC_011981	GCA	2	6	99457	99462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102504
1128	NC_011981	GCC	2	6	99517	99522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102504
1129	NC_011981	CGG	3	9	99590	99598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102504
1130	NC_011981	ATG	2	6	99610	99615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102504
1131	NC_011981	GGC	2	6	99844	99849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102505
1132	NC_011981	CCA	2	6	100047	100052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102505
1133	NC_011981	GCC	3	9	100202	100210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102505
1134	NC_011981	GTT	2	6	100218	100223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102505
1135	NC_011981	GCT	2	6	100278	100283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102505
1136	NC_011981	CAG	2	6	100333	100338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102505
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1139	NC_011981	CCA	2	6	100732	100737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102506
1140	NC_011981	CAA	2	6	100769	100774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102506
1141	NC_011981	GGT	2	6	100778	100783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102506
1142	NC_011981	GCA	2	6	100784	100789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102506
1143	NC_011981	GAT	2	6	100823	100828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102506
1144	NC_011981	GCC	2	6	100905	100910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102506
1145	NC_011981	GCC	2	6	100958	100963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102506
1146	NC_011981	GTG	2	6	100968	100973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102506
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1148	NC_011981	CAG	2	6	101058	101063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102506
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1153	NC_011981	GCC	3	9	101544	101552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102506
1154	NC_011981	CAT	2	6	101669	101674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102506
1155	NC_011981	TGA	2	6	101684	101689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102506
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1159	NC_011981	CAT	2	6	102300	102305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102507
1160	NC_011981	GCA	2	6	102311	102316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102507
1161	NC_011981	GTC	2	6	102319	102324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102507
1162	NC_011981	GGC	2	6	102328	102333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102507
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1229	NC_011981	CTG	2	6	106769	106774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102511
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1233	NC_011981	CGT	2	6	106963	106968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102511
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1241	NC_011981	ACA	2	6	107258	107263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102512
1242	NC_011981	GAA	2	6	107284	107289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102512
1243	NC_011981	ATG	2	6	107331	107336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102512
1244	NC_011981	TGG	2	6	107343	107348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102512
1245	NC_011981	GAT	2	6	107467	107472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102512
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1247	NC_011981	GAT	2	6	107560	107565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102512
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1250	NC_011981	TGC	2	6	107790	107795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102512
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1254	NC_011981	GCC	2	6	108162	108167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102512
1255	NC_011981	TGA	2	6	108174	108179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102512
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1261	NC_011981	ATC	2	6	108982	108987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102513
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1264	NC_011981	AAT	2	6	109305	109310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102513
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1343	NC_011981	ATC	2	6	119224	119229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102524
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1358	NC_011981	CGC	2	6	121253	121258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102526
1359	NC_011981	CCG	2	6	121280	121285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102526
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1362	NC_011981	TGG	2	6	121347	121352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102526
1363	NC_011981	GGC	2	6	121423	121428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102526
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1476	NC_011981	CGG	2	6	129911	129916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102533
1477	NC_011981	AGC	2	6	129919	129924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102533
1478	NC_011981	ATC	2	6	130029	130034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102533
1479	NC_011981	CGC	2	6	130085	130090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102533
1480	NC_011981	TGG	2	6	130147	130152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102533
1481	NC_011981	CTG	2	6	130159	130164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102533
1482	NC_011981	GAT	2	6	130179	130184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102533
1483	NC_011981	CAC	2	6	130188	130193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102533
1484	NC_011981	GGC	2	6	130412	130417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102534
1485	NC_011981	CTG	2	6	130488	130493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102534
1486	NC_011981	CTG	2	6	130504	130509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102534
1487	NC_011981	CCG	2	6	130589	130594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102534
1488	NC_011981	TTG	2	6	130627	130632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102534
1489	NC_011981	ACC	2	6	130680	130685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102534
1490	NC_011981	TCA	2	6	130711	130716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102534
1491	NC_011981	ACA	2	6	130734	130739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102534
1492	NC_011981	CAG	2	6	130793	130798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102534
1493	NC_011981	CGC	2	6	130799	130804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102534
1494	NC_011981	TGA	2	6	130817	130822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102534
1495	NC_011981	TGA	2	6	130841	130846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102534
1496	NC_011981	CGC	2	6	130901	130906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102534
1497	NC_011981	CGA	2	6	131015	131020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102534
1498	NC_011981	ACT	2	6	131053	131058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102534
1499	NC_011981	CGC	2	6	131063	131068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102534
1500	NC_011981	GCA	2	6	131122	131127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102534

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