MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 7683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011981	GGT	2	6	131267	131272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102534
1502	NC_011981	ATT	2	6	131301	131306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102534
1503	NC_011981	TCG	2	6	131325	131330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102534
1504	NC_011981	TGC	2	6	131709	131714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102535
1505	NC_011981	GGT	2	6	131724	131729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102535
1506	NC_011981	AAG	2	6	132025	132030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102535
1507	NC_011981	GGC	2	6	132033	132038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102535
1508	NC_011981	TTG	2	6	132140	132145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102535
1509	NC_011981	CAA	2	6	132342	132347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102535
1510	NC_011981	CCT	2	6	132356	132361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102535
1511	NC_011981	CTG	2	6	132421	132426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102535
1512	NC_011981	AAC	2	6	132440	132445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102535
1513	NC_011981	GCC	2	6	132451	132456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102535
1514	NC_011981	GAA	2	6	132459	132464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102535
1515	NC_011981	CTG	2	6	132472	132477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102535
1516	NC_011981	CTG	2	6	132497	132502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102535
1517	NC_011981	GCC	2	6	132532	132537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102535
1518	NC_011981	TGC	2	6	132593	132598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102535
1519	NC_011981	TGC	2	6	132717	132722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102536
1520	NC_011981	GTC	2	6	132818	132823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102536
1521	NC_011981	CTT	2	6	132857	132862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102536
1522	NC_011981	GTG	2	6	132950	132955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102536
1523	NC_011981	TTG	2	6	132971	132976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102536
1524	NC_011981	GCG	2	6	133042	133047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102536
1525	NC_011981	GAA	2	6	133058	133063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102536
1526	NC_011981	CTC	2	6	133064	133069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102536
1527	NC_011981	CGG	2	6	133120	133125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102536
1528	NC_011981	ACC	2	6	133160	133165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102536
1529	NC_011981	TCA	2	6	133281	133286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102536
1530	NC_011981	TGG	2	6	133326	133331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102536
1531	NC_011981	ATT	2	6	133355	133360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102536
1532	NC_011981	ATG	2	6	133404	133409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102536
1533	NC_011981	TGC	2	6	133443	133448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102536
1534	NC_011981	CTG	2	6	133466	133471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102536
1535	NC_011981	GTG	2	6	133644	133649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102537
1536	NC_011981	GTG	2	6	133669	133674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102537
1537	NC_011981	GCC	2	6	133798	133803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102537
1538	NC_011981	TGC	2	6	133815	133820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102537
1539	NC_011981	GCC	2	6	133905	133910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102537
1540	NC_011981	TGA	2	6	133928	133933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102537
1541	NC_011981	GTT	2	6	133974	133979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102537
1542	NC_011981	GCG	2	6	134053	134058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102537
1543	NC_011981	TGG	2	6	134171	134176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102537
1544	NC_011981	GTC	2	6	134251	134256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102537
1545	NC_011981	GCC	2	6	134302	134307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102537
1546	NC_011981	AAT	2	6	134457	134462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102538
1547	NC_011981	GTG	2	6	134586	134591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102538
1548	NC_011981	GCC	4	12	134597	134608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102538
1549	NC_011981	GTC	2	6	134636	134641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102538
1550	NC_011981	CGC	2	6	134650	134655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102538
1551	NC_011981	CTT	2	6	134941	134946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102538
1552	NC_011981	CAC	2	6	134962	134967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102538
1553	NC_011981	ATA	2	6	135041	135046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102538
1554	NC_011981	GGC	2	6	135082	135087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102538
1555	NC_011981	GAT	2	6	135211	135216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102538
1556	NC_011981	CGC	2	6	135224	135229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102538
1557	NC_011981	ATG	2	6	135507	135512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102538
1558	NC_011981	GTG	2	6	135651	135656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102539
1559	NC_011981	GGC	2	6	135686	135691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102539
1560	NC_011981	CAG	2	6	135732	135737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102539
1561	NC_011981	CGT	2	6	135803	135808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102539
1562	NC_011981	AAG	3	9	135820	135828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102539
1563	NC_011981	CAT	2	6	135869	135874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102539
1564	NC_011981	TGG	2	6	135899	135904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102539
1565	NC_011981	GCC	2	6	136032	136037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102539
1566	NC_011981	CAG	3	9	136224	136232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102539
1567	NC_011981	GTT	2	6	136343	136348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102539
1568	NC_011981	CTG	2	6	136359	136364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102539
1569	NC_011981	GAA	2	6	136721	136726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102540
1570	NC_011981	CAT	2	6	136744	136749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102540
1571	NC_011981	CGG	2	6	136771	136776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102540
1572	NC_011981	CAG	2	6	136892	136897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102540
1573	NC_011981	CAT	2	6	136906	136911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102540
1574	NC_011981	GTG	2	6	136925	136930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102540
1575	NC_011981	CGG	2	6	137029	137034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102540
1576	NC_011981	TGT	2	6	137035	137040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102540
1577	NC_011981	AGA	2	6	137097	137102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102540
1578	NC_011981	CCA	2	6	137134	137139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102540
1579	NC_011981	ATG	2	6	137268	137273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102540
1580	NC_011981	CAA	2	6	137311	137316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102541
1581	NC_011981	GGT	2	6	137369	137374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102541
1582	NC_011981	AGA	2	6	137439	137444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102541
1583	NC_011981	GCA	2	6	137460	137465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102541
1584	NC_011981	GGA	2	6	137534	137539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102541
1585	NC_011981	CGG	2	6	137548	137553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102541
1586	NC_011981	TCG	2	6	137626	137631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102541
1587	NC_011981	GCC	2	6	137679	137684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102541
1588	NC_011981	ATC	2	6	137729	137734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102541
1589	NC_011981	GCG	2	6	137789	137794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102541
1590	NC_011981	AAT	2	6	137846	137851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102541
1591	NC_011981	TCA	2	6	137857	137862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102541
1592	NC_011981	ATT	2	6	137892	137897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102542
1593	NC_011981	GCG	2	6	137900	137905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102542
1594	NC_011981	CAT	2	6	138075	138080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102542
1595	NC_011981	TCC	2	6	138119	138124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102542
1596	NC_011981	GCG	2	6	138152	138157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102542
1597	NC_011981	GAT	2	6	138295	138300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102542
1598	NC_011981	TCA	2	6	138314	138319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102542
1599	NC_011981	CGC	2	6	138378	138383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102542
1600	NC_011981	CAG	2	6	138439	138444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102542
1601	NC_011981	GCA	2	6	138551	138556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102542
1602	NC_011981	GCC	2	6	138586	138591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102542
1603	NC_011981	TCT	2	6	138647	138652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102542
1604	NC_011981	TGG	2	6	138708	138713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102542
1605	NC_011981	CGG	2	6	138744	138749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102542
1606	NC_011981	CTT	2	6	138765	138770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102542
1607	NC_011981	ATC	2	6	138874	138879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102542
1608	NC_011981	ATG	2	6	138938	138943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102542
1609	NC_011981	CTG	2	6	138950	138955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102543
1610	NC_011981	ACG	2	6	139117	139122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102543
1611	NC_011981	ACC	2	6	139243	139248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102543
1612	NC_011981	GCG	2	6	139375	139380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102543
1613	NC_011981	CAG	2	6	139410	139415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102543
1614	NC_011981	TTC	2	6	139419	139424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102543
1615	NC_011981	TGC	2	6	139556	139561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102543
1616	NC_011981	TGC	2	6	139589	139594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102543
1617	NC_011981	TGG	2	6	139601	139606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102543
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1619	NC_011981	CCG	2	6	139754	139759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102543
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1738	NC_011981	GCT	2	6	149395	149400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102550
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1974	NC_011981	TTG	2	6	166820	166825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102566
1975	NC_011981	CGG	2	6	166896	166901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102566
1976	NC_011981	TTC	2	6	167000	167005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102566
1977	NC_011981	GCG	2	6	167108	167113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102566
1978	NC_011981	GGC	2	6	167242	167247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102566
1979	NC_011981	ATG	2	6	167337	167342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102566
1980	NC_011981	ATC	2	6	167351	167356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102566
1981	NC_011981	TCC	2	6	167412	167417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102566
1982	NC_011981	GGC	2	6	167506	167511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102566
1983	NC_011981	GCG	2	6	167521	167526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102566
1984	NC_011981	GCG	2	6	167618	167623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102566
1985	NC_011981	GGC	2	6	167627	167632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102566
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1988	NC_011981	GGT	2	6	167918	167923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102566
1989	NC_011981	CAA	2	6	167951	167956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102566
1990	NC_011981	CGG	2	6	167959	167964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102566
1991	NC_011981	GCG	2	6	168012	168017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102566
1992	NC_011981	CAT	2	6	168043	168048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102566
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1997	NC_011981	CAG	2	6	168300	168305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102567
1998	NC_011981	CCA	2	6	168395	168400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102567
1999	NC_011981	CGG	2	6	168535	168540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102567
2000	NC_011981	CCA	2	6	168715	168720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102567

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